Енциклопедія елементів ДНК

Енциклопедія елементів ДНК (англ. Encyclopedia Оf DNA Elements, ENCODE) — відкритий міжнародний науковий проект, спрямований на пошук та систематичне дослідження усіх функціональних елементів геному людини та модельних організмів. Проект почався у вересні 2003 року за ініціативою Національного інституту досліджень геному людини США.[1] У 2012 році над проектом працювали понад 440 фахівців в 32 лабораторіях США, Західної Європи, Японії та Сингапуру. В перші 9 років бюджет становив 300 мільйонів доларів.[2]

В пілотній фазі проекту (2003—2007) було проаналізовано 1 % геному людини[3] та розроблялися нові методи дослідження функціональних елементів. В продуктивній фазі проекту (2007—2012) елементи всього геному людини аналізували в 1600 експериментах на 147 тканинах, використовуючи стандартизовані протоколи. Були створені спеціальні бази даних і програми для їх аналізу, розроблена система координації праці науковців. Результати другої фази проекту були надруковані в інтегральній статті в Nature[4], ще 5 статтях в цьому журналі, 18 статтях в Genome Research і 6 статтях в Genome Biology.

Основний висновок проекту становить що 80 % геному людини кодує 4 мільйони перемикачів, які регулюють 21 тисячу генів, що займають лише 1,5 % геному, і тим самим спростовано концепцію «сміттєвої ДНК». Цей висновок був відзначений як одне з найвагоміших досягнень десятиріччя в медицині та біології, тому що варіації в численних регуляторах, а не тільки в білок-кодуючих генах, впливають на здоров'я і захворювання людини.[5][6][7]

Примітки

  1. The ENCODE Project Consortium. The ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) Project // Science.  2004. Т. 306, вип. 5696. С. 636-640. DOI:10.1126/science.1105136. Процитовано 6 вересня 2012.
  2. ENCODE data describes function of human genome. NHGRI-funded study produces massive data set, novel publishing strategy (прес-реліз). National Human Genome Research Institute. September 5, 2012. Процитовано 6 вересня 2012. Архівовано вересень 8, 2012, у Wayback Machine.
  3. The ENCODE Project Consortium. Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project // Nature.  2007. Т. 447, вип. 7146. С. 799-816. DOI:10.1038/nature05874. Процитовано 6 вересня 2012.
  4. The ENCODE Project Consortium. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome // Nature.  2012. Т. 489, вип. 7414. С. 57–74. DOI:10.1038/nature11247. Процитовано 6 вересня 2012.
  5. Kolata, Gina (September 5, 2012). Bits of Mystery DNA, Far From ‘Junk,’ Play Crucial Role. New York Times. Процитовано 5 вересня 2012.
  6. 6 вересня 2012. Зроблено ще один крок до розшифровки геному людини [телебачення]. Перший національний.
  7. ЛІГАБізнесІнформ (6 вересня 2012). Вчені склали саму повну карту ДНК людини. Ліга. Процитовано 6 вересня 2012.

Посилання

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.