Капсид
Капсид — зовнішня білкова оболонка вірусу. Капсид виконує декілька функцій:
- Захист генетичного матеріалу (ДНК або РНК) вірусу від механічних і хімічних пошкоджень.
- Визначення потенціалу до зараження клітини.
- На початкових стадіях зараження клітки капсид виконує прикріплення до клітинної мембрани, розриває мембрану і впроваджує в клітину генетичний матеріал вірусу.
У зараженій клітині вірус рано чи пізно починає розмножуватися, використовуючи інфраструктуру клітини. Білки, що складають капсид, синтезуються на основі генетичного матеріалу вірусу. Деякі типи вірусів, покидаючи заражену клітину, відтинають частину мембрани і «закутуються» в неї, створюючи тим самим додатковий рівень захисту. Мембранна оболонка отримується капсидом з однієї з мембран клітини-хазяїна, залежно від вірусу, це може бути ядерна мембрана, мембрана апарату Гольджі або зовнішня клітинна мембрана[1]. Під час процесу збірки вірусу, на вершині капсида утворюється особлива субодиниця капсиду, «портал» або вірусний пакувальний мотор. через цей портал відбувається упаковка генетичного матеріалу у новий вірус[2].
Капсиди більшості вірусів мають спіральну або ікосаедричну симетрію. У разі спіральної симетрії (наприклад, у вірусу тютюнової мозаїки) складові частини капсида формують циліндр з укладених по спіралі білкових глобул, усередині якого знаходиться генетичний матеріал вірусу. У разі ікосаедричної симетрії (наприклад, у багатьох бактеріофагів) утворюється квазі-сферична структура капсида[3]. У разі «закутаного» капсида окремі частини капсида (спірального або ікосаедричного) відкриті навколишньому середовищу, тоді як велика частина його прихована мембраною.
Структурний аналіз основних типів капсидів використовується в класифікації вірусів. Так, за даними структурного аналізу капсида в одну групу були поміщені бактеріофаг PRD1, вірус хлорел, що мешкають в Paramecium bursaria, і аденовірус ссавців[4].
Примітки
- Alberts, Bruce; Bray, Dennis; Lewis, Julian; Raff, Martin; Roberts, Keith; Watson, James D. (1994). Molecular Biology of the Cell (вид. 4). с. 280. (див. Молекулярна біологія клітини)
- Newcomb WW, Homa FL, Brown JC (2005 Aug). Involvement of the portal at an early step in herpes simplex virus capsid assembly. Journal of Virology 79 (16): 10540-6. PMID 16051846.
- Branden, Carl and Tooze, John (1991). Introduction to Protein Structure. с. 161–162. ISBN 0-8153-0270-3.
- Khayat et al. classified Sulfolobus turreted icosahedral virus (STIV) and Laurinmäki et al. classified bacteriophage Bam35 — Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 3669 (2006); 102, 18944 (2005); Structure 13, 1819 (2005)