PPR-білки

PPR-білки (англ. Pentatricopeptide repeat), білки з пентатрикопептидним повтором — родина білків, які мають у своїй структурі мотив з 35 амінокислотних залишків. Гени цієї родини наявні у всіх гілках евкаріотів, але найбільш поширені в рослин, де виконують різноманітні функції, включно з редагуванням РНК у мітохондріях та хлоропластах.[1] Також виявляються в окремих прокаріотів, але, скоріш за все, набуті шляхом горизонтального перенесення генів.[2]

Білки з пентатрикопептидним повтором
Ідентифікатори
Символ PPR
Інша інформація

Структура

Кількість 35-амінокислотних мотивів коливається від 2 до 26. Схожість з послідовністю 34-амінокислотного мотиву свідчить про їхнє розходження на ранній стадії еволюції евкаріот.

Низка білків цієї родини формує гомодимери для взаємодії з молекулами РНК.[2]

Класифікація

PPR-білки поділяють на два класи:

  • P-клас, молекули якого містять класичний 35-амінокислотний домен та зазвичай не мають інших додаткових доменів;
  • PLS-клас, молекули якого мають різні домени: класичний P (35 амінокислот), короткий S (31 амінокислота), довгий L (35-36 амінокислот), а також задіяні в редагуванні РНК[2]

PLS

PLS-клас поділяється на підкласи білків з DYW-доменом (який складається з залишків аспартату (D), тирозину (Y) та триптофану (W)) та білків з E-доменом (від англ. extension).[2]

У рослин

У рослин значна частина PPR-білків має DYW-домен та/або E-домен.

У людини

У людини відомо 7-8 білків цієї родини, зокрема:

Примітки
  1. Sun, Tao; Bentolila, Stephane; Hanson, Maureen R. (2016). The Unexpected Diversity of Plant Organelle RNA Editosomes. Trends in Plant Science 21 (11): 962–973. ISSN 13601385. doi:10.1016/j.tplants.2016.07.005.
  2. Manna, Sam (2015). An overview of pentatricopeptide repeat proteins and their applications. Biochimie 113: 93–99. ISSN 03009084. doi:10.1016/j.biochi.2015.04.004.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.