Білок-білкова взаємодія
Білок-білкова взаємодія — зв'язування (зазвичай оборотне) білків, їх вплив один на одного, та дослідження цих процесів з точки зору біохімії, передачі сигналів і теорії керування.
Білок-білкова взаємодія важлива для багатьох біологічних процесів. Наприклад, сигнали від навколишнього середовища клітини передаються до її внутрішніх частин за допомогою білок-білкової взаємодії та взаємодії білків з сигнальними молекулами. Цей процес, що називається передачею сигналів, грає фундаментальну роль в багатьох біологічних процесах і в багатьох хворобах (наприклад, таких як рак). Білки можуть взаємодіяти і протягом довгого часу, формуючи білкові комплекси та допомагаючи транспорту інших білків (наприклад при ядерному транспорті через ядерні пори від цитоплазма клітини до її ядра або навпаки), або можуть взаємодіяти протягом короткого часу, наприклад, змінюючи інші білки в результаті ферментативної реакції (наприклад, білкові кінази фосфорилюють певні інші білки). Ця модифікації білків можуть змінювати взаємодію з іншими білками. Наприклад, деякі білки з SH2-областями зв'язуються з іншими виключно у фосфорильованому стані.
Джерела
- Stark C, Breitkreutz BJ, Reguly T, Boucher L, Breitkreutz A, Tyers M (January 2006). BioGRID: a general repository for interaction datasets. Nucleic Acids Research 34 (Database issue): D535–9. PMC 1347471. PMID 16381927. doi:10.1093/nar/gkj109.
- Peri S, Navarro JD, Kristiansen TZ, Amanchy R, Surendranath V, Muthusamy B, Gandhi TK, Chandrika KN, Deshpande N, Suresh S, Rashmi BP, Shanker K, Padma N, Niranjan V, Harsha HC, Talreja N, Vrushabendra BM, Ramya MA, Yatish AJ, Joy M, Shivashankar HN, Kavitha MP, Menezes M, Choudhury DR, Ghosh N, Saravana R, Chandran S, Mohan S, Jonnalagadda CK, Prasad CK, Kumar-Sinha C, Deshpande KS, Pandey A (January 2004). Human protein reference database as a discovery resource for proteomics. Nucleic Acids Research 32 (Database issue): D497–501. PMC 308804. PMID 14681466. doi:10.1093/nar/gkh070.
- Hermjakob H, Montecchi-Palazzi L, Lewington C, Mudali S, Kerrien S, Orchard S, Vingron M, Roechert B, Roepstorff P, Valencia A, Margalit H, Armstrong J, Bairoch A, Cesareni G, Sherman D, Apweiler R (January 2004). IntAct: an open source molecular interaction database. Nucleic Acids Research 32 (Database issue): D452–5. PMC 308786. PMID 14681455. doi:10.1093/nar/gkh052.
- Chatr-aryamontri A, Ceol A, Palazzi LM, Nardelli G, Schneider MV, Castagnoli L, Cesareni G (January 2007). MINT: the Molecular INTeraction database. Nucleic Acids Research 35 (Database issue): D572–4. PMC 1751541. PMID 17135203. doi:10.1093/nar/gkl950.
- Güldener U, Münsterkötter M, Oesterheld M, Pagel P, Ruepp A, Mewes HW, Stümpflen V (January 2006). MPact: the MIPS protein interaction resource on yeast. Nucleic Acids Research 34 (Database issue): D436–41. PMC 1347366. PMID 16381906. doi:10.1093/nar/gkj003.
- Pagel P, Kovac S, Oesterheld M, Brauner B, Dunger-Kaltenbach I, Frishman G, Montrone C, Mark P, Stümpflen V, Mewes HW, Ruepp A, Frishman D (March 2005). The MIPS mammalian protein-protein interaction database. Bioinformatics 21 (6): 832–4. PMID 15531608. doi:10.1093/bioinformatics/bti115.