Зета-варіант SARS-CoV-2

Зета-варіант, також відомий як лінія P.2,[lower-alpha 1], є варіантом SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19. Вперше він був виявлений в штаті Ріо-де-Жанейро; він містить мутацію E484K, але не мутації N501Y та K417T. Він розвивався незалежно в Ріо-де-Жанейро, не будучи безпосередньо пов'язаним з варіантом Гамма з Манауса.[2] [3]

Зета-варіант SARS-CoV-2
Офіційна назва англ. Zeta (31 травня 2021)[1]
Названо на честь дзета
Дата відкриття (винаходу) квітень 2020[1]
Місце відкриття Бразилія[1]

Відповідно до спрощеної схеми найменування, запропонованої Всесвітньою організацією охорони здоров’я, P.2 був позначений як «Зета-варіант» і вважався варіантом, що викликає інтерес (VOI), але не варіантом, що викликає занепокоєння.[4] Другій хвилі в листопаді 2020 року передувало збільшення поширеності варіанту Zeta серед генетичних послідовностей зі штату Сан-Паулу, занесених до бази даних GISAID.[5] Станом на липень 2021 року ВООЗ більше не розглядає Zeta як цікавий варіант.[6]

Мутації

У геномі зета-варіанта є 3 амінокислотні мутації: E484K, D614G і V1176F, всі з яких знаходяться в коді білка спайка вірусу.[7] За даними Центрів з контролю та профілактики захворювань, F565L був виявлений в деяких послідовностях варіантів Zeta, але не у всіх.[8]

  • Amino acid mutations of SARS-CoV-2 Zeta variant plotted on a genome map of SARS-CoV-2 with a focus on the spike.[7]

Див. також

Примітки
  1. A sub-lineage of B.1.1.28

Посилання
  1. https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
  2. PANGO lineages Lineage P.2. COV lineages. Процитовано 28 січня 2021. «P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage»
  3. Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana та ін. (26 квітня 2021). Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil. Journal of Virology 95 (10). ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194. doi:10.1128/JVI.00119-21.
  4. Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological (англ.). 12 січня 2021. Процитовано 26 червня 2021.
  5. Ranzani, Otavio (2021). Effectiveness of the CoronaVac vaccine in the elderly population during a Gamma variant-associated epidemic of COVID-19 in Brazil. medRxiv. doi:10.1101/2021.05.19.21257472.
  6. Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int (англ.). World Health Organization.
  7. Spike Variants: Zeta variant, aka P.2. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. 1 липня 2021. Процитовано 5 липня 2021.
  8. SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 11 лютого 2020. Процитовано 5 липня 2021.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.