Гамма-варіант SARS-CoV-2
Гамма-варіант (P.1) є одним із варіантів SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COD-19I1. Цей варіант SARS-CoV-2 отримав назву лінії P.1 і має 17 амінокислотних замін, десять з яких у білку спайку, включаючи ці три, які викликають особливе занепокоєння: N501Y, E48 а тK7T.K4
Гамма-варіант SARS-CoV-2 | |
Офіційна назва | англ. Gamma[1] |
---|---|
Названо на честь | гамма |
Дата відкриття (винаходу) | 6 січня 2021[2] |
Місце відкриття | Японія[2] і Манаус[3] |
Цей варіант SARS-CoV-2 вперше був виявлений Національним інститутом інфекційних захворювань Японії (NIID) 6 січня 2021 року у чотирьох людей, які прибули до Токіо, відвідавши Амазонас, Бразилія, чотири дні тому. Згодом було оголошено, що він знаходиться в обігу в Бразилії. Відповідно до спрощеної схеми найменування, запропонованої Всесвітньою організацією охорони здоров’я, P.1 було позначено як варіант гамма, і наразі він вважається варіантом, що викликає занепокоєння. На початку 2021 року гамма спричинила широку інфекцію в місті Манаус, столиці Амазонаса, хоча у травні 2020 року в місті вже була поширена інфекція[4] з дослідженням[5], яке вказує на високу серопоширеність антитіл до SARS-CoV-2.[6] Дослідницька стаття, опублікована в Науковому журналі, показує, що люди, інфіковані P.1, мають більший шанс зараження та смерті, ніж інфіковані B.1.1.28.[7]
Гамма-варіант включає два різних підваріанти 28-AM-1 і 28-AM-2, обидва несуть мутації K417T, E484K, N501Y, і обидва розвивалися незалежно один від одного в межах одного бразильського регіону Амазонки.[8]
Гамма помітно відрізняється від зета-варіанту (лінія P.2), який також активно поширювався в Бразилії. Зокрема, зета несе лише мутацію E484K і не має жодної з двох інших мутацій, що викликають занепокоєння, N501Y та K417T.[8][9]
Класифікація
Початкові звіти стверджували, що і P.1, і P.2 були двома окремими і різними нащадками бразильської лінії B.1.1.248. [10] [11] Однак пізніше B.1.1.248 втратив статус окремої лінії та був перекласифікований до B.1.1.28. [12] P.1 також називається B.1.1.28.1 [13], а P.2 — B.1.1.28.2 або VUI-202101/01. [14] Оскільки в системі номенклатури PANGO Lineage дозволені лише три підрівні, звідси позначення B.1.1.28.1 до P.1 і B.1.1.28.2 до P.2. [15] [16]
Після його виявлення дані геному для чотирьох зразків нового варіанту були передані в GISAID, яким був призначений діапазон ідентифікаторів: EPI_ISL_792680
до EPI_ISL_792683
.[17]
Мутації
- Амінокислотні мутації гамма-варіанта SARS-CoV-2, нанесені на карту геному SARS-CoV-2 з акцентом на Спайка.
ген | Амінокислота |
---|---|
ORF1ab | synT733C |
synC2749T | |
S1188L | |
K1795Q | |
del11288-11296 (3675-3677 SGF) | |
synC12778T | |
synC13860T | |
E5665D | |
Спайк | L18F |
T20N | |
P26S | |
D138Y | |
R190S | |
K417T | |
E484K | |
N501Y | |
H 655Y | |
T1027I | |
ORF8 | E92K |
ins28269-28273 | |
Н | P80R |
Джерело: Faria et al., (2021) Б |
Варіанти SARS-CoV-2, а також наявність восьми мутацій (чотири з цих синонімічних генетичних мутацій ) у відкритих рамках зчитування (ORF1a та ORF1b) – одним з яких є набір видалень – Гамма має 10 визначальних мутацій у білку спайка, включаючи N501Y та E484K. Він також має дві мутації – одна вставка – в його гені ORF8 і один у його гені N.[15][18]
Нащадок і підрід
Лінія коронавірусу B.1.1.28 породила чотири відомі лінії, які класифікуються як цікавий варіант (VOI) або варіант, що викликає занепокоєння (VOC): лінії P.1, P.2, P.3 і P.4.
Лінія P.2 (B.1.1.28.2, варіант Zeta), вперше виявлена в жовтні 2020 року в штаті Ріо-де-Жанейро, Бразилія, має лише одну мутацію, що викликає занепокоєння, з P.1, а саме E484K. [19] Інші мутації P.2 не викликають занепокоєння і рідко зустрічаються для інших варіантів. П’ять P.2-специфічних мутацій: E484K в S-гені, A119S в N-гені, 5'UTR C100U, плюс L3468V і synC11824U в гені ORF1ab . Інші мутації, які зазвичай зустрічаються в P.2: 3'UTR C29754U, F120F (synC28253U) в ORF8, M234I в N-гені, а також L3930F і synA12964G в ORF1ab.[20]
Лінія P.3 (тета-варіант) була вперше ідентифікована на Філіппінах 18 лютого 2021 року, коли в Центральних Вісайських островах було виявлено дві мутації, що викликають занепокоєння.[21]
Решта похідного вірусу B.1.1.28 належить до лінії P.4. Хоча дослідники не визначили його точне походження, вперше він був секвенований в Ітірапіні, Бразилія, і вже циркулював у різних муніципалітетах штату Сан-Паулу тієї ж країни. Він несе мутацію, що викликає занепокоєння, у білку-шипу під назвою L452R, який також присутній у лінії B.1.617 (варіанти дельта та каппа), виявленої в Індії, варіант Epsilon (лінії B.1.427 та B.1.429) із Каліфорнії, Сполучені Штати.[22][23] Гілка цієї лінії — P.4.1 (VUI-NP13L) — імовірно, що вона виникла в Гоясі, Бразилія, приблизно в червні–липні 2020 року — також швидко поширилася на південний схід країни, де, наприклад, Taquara мала свою першу послідовність геному, і на північний схід нації. Це було виявлено на міжнародному рівні, зареєстровані випадки в Японії, Нідерландах та Англії. P.4.1 має мутації V1176F та D614G у білку спайка.[24]
Статистика
Country | Confirmed cases (PANGO) | Confirmed cases (GISAID)[25] as of 9 August 2021 |
First detection | References |
---|---|---|---|---|
United States | 15,786 | 23,373 | 25 січня 2021 | [26][27][28][29] |
Canada | 19,643 | 8,070 | 7 лютого 2021 | [29][30][31][32] |
Шаблон:Дані країни Brazil | 10,556 | 16,200 | 14 січня 2021 | [33][15][29] |
Шаблон:Дані країни Chile | 975 | 2,522 | 24 березня 2021 | [34][29] |
Шаблон:Дані країни Mexico | 814 | 2,278 | 28 січня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Italy | 838 | 2,181 | 25 січня 2021 | [35][36][37][29] |
Шаблон:Дані країни Belgium | 1,333 | 1,974 | 16 лютого 2021 | [29] |
Spain | 635 | 957 | 16 лютого 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Luxembourg | 43 | 928 | 30 березня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Germany | 276 | 806 | 22 січня 2021 | [38][29] |
France | 219 | 577 | 4 лютого 2021 | [29][39] |
Шаблон:Дані країни Netherlands | 499 | 566 | 29 січня 2021 | [40][29] |
Шаблон:Дані країни Colombia | 165 | 346 | 30 січня 2021 | [41][42][29] |
Шаблон:Дані країни Argentina | 230 | 329 | 8 лютого 2021 | [43][29] |
Шаблон:Дані країни French Guiana | 225 | 318 | 16 лютого 2021 | [29] |
Trinidad and Tobago | 14 | 255 | 23 квітня 2021 | [44][45][46] |
Шаблон:Дані країни United Kingdom | 155 | 224 | 28 лютого 2021 | [29][47][48][49][50] |
Шаблон:Дані країни Portugal | 148 | 190 | 11 лютого 2021 | [51][52][53][29] |
Шаблон:Дані країни Switzerland | 153 | 187 | 16 лютого 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Uruguay | 112 | 173 | 22 березня 2021 | [54] |
Шаблон:Дані країни Turkey | 166 | 88 | 3 лютого 2021 | [55][56][29] |
Шаблон:Дані країни Ecuador | 27 | 145 | 14 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Sweden | 68 | 141 | 20 лютого 2021 | [57][29] |
Шаблон:Дані країни Aruba | 96 | 121 | 29 березня 2021 | [29] |
Japan | 96 | 118 | 6 січня 2021 | [58][59][29] |
Шаблон:Дані країни Suriname | 106 | 117 | 11 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Peru | 103 | 42 | 4 лютого 2021 | [60][61][62][63][64] |
Шаблон:Дані країни Costa Rica | 32 | 69 | 11 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Denmark | 40 | 63 | 3 березня 2021 | [65][66][29] |
Шаблон:Дані країни Paraguay | 53 | 54 | 25 березня 2021 | [67][29] |
Шаблон:Дані країни Haiti | 46 | 47 | 15 травня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Dominican Republic | 4 | 38 | 11 березня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Malta | 22 | 32 | 18 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Ireland | 25 | 29 | 19 лютого 2021 | [68][69][70][71][72][29] |
Шаблон:Дані країни Austria | 17 | 28 | 15 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Poland | 5 | 24 | 13 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Czech Republic | 9 | 20 | 21 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Israel | 9 | 19 | 11 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Venezuela | 17 | 17 | 10 лютого 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Bolivia | 10 | 17 | 19 березня 2021 | [29] |
Curacao | 6 | 14 | 24 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Romania | 5 | 12 | 8 березня 2021 | [73][29] |
Шаблон:Дані країни South Korea | 3 | 10 | 18 січня 2021 | [74] |
Шаблон:Дані країни Norway | 4 | 9 | 24 лютого 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Singapore | 8 | 8 | 16 квітня 2021 | [29] |
Australia | 5 | 8 | 6 березня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни New Zealand | 7 | 7 | 18 березня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Slovenia | 4 | 7 | 21 березня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Finland | 2 | 7 | 18 лютого 2021 | [75] |
Шаблон:Дані країни Lithuania | 3 | 6 | 10 травня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Croatia | 2 | 6 | 18 лютого 2021 | [76] |
Шаблон:Дані країни Jordan | 5 | 5 | 4 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Taiwan | 4 | 4 | 20 лютого 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни India | 2 | 3 | 17 лютого 2021 | [77] |
Шаблон:Дані країни Bosnia and Herzegovina | - | 3 | ||
Шаблон:Дані країни Guyana | - | 3 | ||
China | 2 | 2 | 10 травня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Philippines | 2 | 2 | 13 березня 2021 | [78][79] |
Шаблон:Дані країни Bangladesh | 1 | 1 | 3 травня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Cayman Islands | 1 | 1 | 17 червня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Faroe Islands | 1 | 1 | 18 січня 2021 | [80][29] |
Шаблон:Дані країни Thailand | 1 | 1 | 5 квітня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Guyane | 1 | - | 3 травня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Hungary | 1 | - | 22 липня 2021 | [81] |
Шаблон:Дані країни Sint Maarten | 1 | - | 10 березня 2021 | [29] |
Шаблон:Дані країни Angola | - | 1 | ||
Шаблон:Дані країни Bonaire | - | 1 | ||
Шаблон:Дані країни Greece | - | 1 | ||
Шаблон:Дані країни Guam | - | 1 | ||
Шаблон:Дані країни Latvia | - | 1 | ||
Шаблон:Дані країни Pakistan | - | 1 | ||
Шаблон:Дані країни Puerto Rico | - | 1 | ||
Шаблон:Дані країни Russia | - | 1 | ||
World (63 countries) | Total: 52,079 | Total: 63,729 |
Історія
12 січня 2021 року CADDE-центр Бразилії та Великобританії підтвердив 13 місцевих випадків лінії P.1 в Манаусі, штат Амазонас, найбільшому місті тропічних лісів Амазонки.[15] Новий рід був відсутній у 27 зразках, зібраних з березня по листопад 2020 року в Манаусі, але він був ідентифікований для того самого міста в 42% (n=13/31) зразків, зібраних 15–23 грудня 2020 року, а потім у 52,2% ( n=35/67) протягом 15–31 грудня 2020 року та 85,4% (n=41/48) протягом 1–9 січня 2021 року. Зокрема, P.2 швидко випередив P1 з другої половини грудня до 1–9 січня, коли частка P.2 для Манауса зменшилася з 25,4% до 6,3%.[15][82]
Дослідження 180 секвенованих бразильських зразків, зібраних у штаті Ріо-де-Жанейро протягом 2020 року, виявило появу нової лінії P.2 SARS-CoV-2 (походить із B.1.1.28). P.2 вперше був виявлений за допомогою секвенування геному в жовтні 2020 року, але, за оцінками, він з’явився на початку липня 2020 року [20] . Станом на грудень 2020 року, хоча його частота значно зросла по всьому штату, вона все ще була в основному обмежена столицею штату Ріо-де-Жанейро. У травні 2020 року основними лініями, що стояли за позитивними на COVID-19, були B.1.1.33 (70%) і B.1.1.28 (20%), тоді як до вересня основними лініями були B.1.1.33 (50%) і B.1.1.28 (40%), без виявленої присутності P.2, тоді як протягом жовтня та листопада P.2 була найпоширенішою лінією з часткою близько 50% (за даними інструменту Pangolin).[83] Дослідження також виявило, що мутація E484K «широко поширена» у всіх проаналізованих зразках P.2 (36 з 38).[83]
Дослідники з Фонду Освальдо Круза опублікували препринт геномного епідеміологічного дослідження 250 зібраних геномів з різних місць Амазонасу і виявили, що інфекції P.1 можуть спричиняти майже в 10 разів більше вірусного навантаження, ніж у інших інфікованих COVID-19 осіб, які стосуються лінії B.1.1. .28 і B.1.195. Лінія також продемонструвала в 2,2 рази вищу трансмісивність з однаковою здатністю інфікувати як дорослих (18–59 років), так і літніх людей (60 років і вище), що свідчить про те, що P.1 та його підліні є більш успішними в зараженні молодих людей без гендерний диференціал.[84]
Центр виявлення, діагностики, геноміки та епідеміології арбовірусів (CADDE) випустив ще одну журнальну статтю зі зразками, зібраними в Манаусі з листопада 2020 року по січень 2021 року. Дослідження показало, що лінія P.1 становить приблизно 2.0 (50% CI, 1.7– 2.4) більш передається і було показано, що він здатний уникати близько 32 (50% CI, 21– 46) спадкового імунітету від попередніх коронавірусних захворювань, що призводить до можливості повторного зараження Ці збільшені статистичні дані також мали те саме відображення смертності, оскільки інфекції P.1 можуть бути приблизно на 50 (50% CI, 20– 90) смертельнішими.[85][86][87] У рамках поточних досліджень здатність варіанта нейтралізувати антитіла була оцінена вченими в опублікованій препринтній роботі, яка демонструє, що 8 імунізованих CoronaVac осіб мали погану реакцію плазми крові проти лінії P.1. Оскільки у дослідженні було лише невелика кількість учасників, неможливо було зробити будь-який статистичний висновок, оскільки потрібно було б вивчати більшу кількість вакцинованих людей. [88] Вчені з Массачусетського технологічного інституту, Гарварду та Кембриджа, а також лікарі в Бостоні підтвердили, що люди, які були повністю вакциновані вакцинами Pfizer і Moderna, значно зменшили нейтралізацію за допомогою P.1 — під час попередньої роботи.[89]
Див. також
Примітки
- https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- https://www.niid.go.jp/niid/images/epi/corona/covid19-33-en-210112.pdf
- https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586
- Matt Rivers (28 січня 2021). Is a new coronavirus variant to blame for this Brazilian city's collapse?. CNN.
- Buss, Lewis F.; Prete, Carlos A.; Abrahim, Claudia M. M.; Mendrone, Alfredo; Salomon, Tassila; de Almeida-Neto, Cesar та ін. (8 грудня 2020). Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic. Science (American Association for the Advancement of Science) 371 (6526): 288–292. ISSN 0036-8075. PMC 7857406. PMID 33293339. doi:10.1126/science.abe9728. Проігноровано невідомий параметр
|doi-access=
(довідка) - Sabino, Ester C.; Buss, Lewis F.; Carvalho, Maria P. S.; Prete, Carlos A.; Crispim, Myuki A. E.; Fraiji, Nelson A. та ін. (27 січня 2021). Resurgence of COVID-19 in Manaus, Brazil, despite high seroprevalence. The Lancet (English) 397 (10273): 452–455. ISSN 0140-6736. PMC 7906746. PMID 33515491. doi:10.1016/S0140-6736(21)00183-5. Проігноровано невідомий параметр
|doi-access=
(довідка) - Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science Magazine. 31 травня 2021. Процитовано 7 липня 2021.
- Oliver T.R. Toovey, Kirsty N. Harvey, Paul W. Bird, and Julian Wei-Tze Wei-Tze Tang (3 лютого 2021). Introduction of Brazilian SARS-CoV-2 484K.V2 related variants into the UK. Journal of Infection 82 (5): e23–e24. PMC 7857057. PMID 33548358. doi:10.1016/j.jinf.2021.01.025.
- Covid-19 Genomics UK Consortium (15 січня 2021). COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK. www.cogconsortium.uk. Процитовано 25 січня 2021.
- Michael Le Page, Matt Hambly (1 березня 2021). Brazil covid-19 variant (P.1). NewScientist. Процитовано 7 березня 2021.
- Vinícius Bonetti Franceschi (26 січня 2021). Genomic Epidemiology of SARS-CoV-2 in Esteio, Rio Grande do Sul, Brazil. medrxiv. doi:10.1101/2021.01.21.21249906. Процитовано 7 березня 2021. «These lineages have already formed new sublineages. B.1.1.248 has evolved in N.1 (USA lineage), N.2 (French), N.3 (Argentinian), and N.4 (Chilean). Furthermore, B.1.1.248 has evolved in P.1 (Manaus lineage associated with a constellation of Spike mutations like B.1.1.7 and B.1.351 (Faria et al. 2021)) and P.2 (Rio de Janeiro lineage found in this study).»
- PANGO lineages Lineage B.1.1.248. cov-lineages.org. Процитовано 26 лютого 2021. «Brazilian lineage [B.1.1.248] reassigned B.1.1.28»
- Marlúcia Seixas (25 січня 2021). Fiocruz Amazon confirms reinfection by a new variation of the Sars-CoV-2. Fiocruz Amazon. Fiocruz, Oswaldo Cruz Foundation.
- PANGO lineages Lineage P.2. cov-lineages.org. Процитовано 28 січня 2021. «P.2...Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage»
- Faria, Nuno R.; Claro, Ingra Morales (12 січня 2021). Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological (англ.). Процитовано 23 січня 2021.
- P.1 report. cov-lineages.org. Процитовано 8 лютого 2021.
- Supplementary Table 1 Acknowledgement Table GISAID. virological.org. GISAID. 14 січня 2021. с. 10. Процитовано 14 січня 2021. «EPI_ISL_792680, EPI_ISL_792681, EPI_ISL_792682, EPI_ISL_792683 - Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases - Tsuyoshi Sekizuka, Kentaro Itokawa, Rina Tanaka, Masanori Hashino, Makoto Kuroda»
- Corum, Jonathan; Zimmer, Carl (24 лютого 2021). Coronavirus Variants and Mutations (Section: The P.1 Lineage). www.nytimes.com. Процитовано 25 лютого 2021.
- A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the Spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil. virological.org. 11 березня 2021. Процитовано 29 травня 2021.
- Carolina M. Voloch (1 березня 2021). Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil. Journal of Virology. doi:10.1128/JVI.00119-21. Процитовано 7 березня 2021.
- News, CNN Philippines (18 лютого 2021). DOH confirms new COVID-19 mutations in Central Visayas. Процитовано 2 травня 2021.
- Rede Corona-ômica. BR-MCTI informa possível nova variante da COVID-19 no interior de SP com mutação também encontrada na variante indiana [Corona-ômica. BR-MCTI network informs a possible new variant of COVID-19 in the interior of SP with a mutation also found in the Indian variant]. gov.br (portuguese). 4 травня 2021. Процитовано 30 травня 2021.
- G1 São Carlos e Araraquara (25 травня 2021). Nova variante do coronavírus P.4 é identificada no interior de São Paulo, diz pesquisador da Unesp [A new variant of the P.4 coronavirus is identified in the interior of São Paulo, says researcher at Unesp]. g1.globo.com (portuguese). Процитовано 30 травня 2021.
- Sant’Anna, Fernando Hayashi; Muterle Varela, Ana Paula; Prichula, Janira; Comerlato, Juliana; Comerlato, Carolina Baldisserotto; Roglio, Vinicius Serafini та ін. (20 квітня 2021). Emergence of the novel SARS-CoV-2 lineage P.4.1 and massive spread of P.2 in South Brazil. doi:10.1101/2021.04.14.21255429. Процитовано 8 червня 2021.
- GISAID - hCov19 Variants. www.gisaid.org. Процитовано 9 серпня 2021.
- Achenbach, Joel (25 січня 2021). First U.S. case of highly transmissible Brazil coronavirus variant identified in Minnesota. The Washington Post (USA). Процитовано 26 січня 2021. «This is the first report in the United States of the P.1 variant...»
- Massie, Graeme (26 січня 2021). First case of Brazil coronavirus variant found in the US. The Independent (Los Angeles). Процитовано 26 січня 2021.
- US COVID-19 Cases Caused by Variants. cdc.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 2 лютого 2021. Процитовано 16 квітня 2021.
- PANGO Lineages - B.1.28. cov-lineages.org. 22 січня 2021. Процитовано 27 червня 2021.
- Coronavirus: What's happening in Canada and around the world on Friday. CBC (Toronto). 19 березня 2021. Процитовано 19 березня 2021. «In an update published Thursday night, federal health officials reported a total of 4,499 variant of concern cases, including: *4,169 cases of the B117 variant, which was first reported in the U.K. *241 cases of the B1351 variant, which was first reported in South Africa. *89 cases of the P1 variant, which was first reported in travellers from Brazil.»
- Tracking variants of the novel coronavirus in Canada. ctvnews.ca (англ.). 4 лютого 2021. Процитовано 27 травня 2021.
- Variant that forced B.C. ski resort shut is rapidly spreading, sending more young people to hospital. Процитовано 2 квітня 2021.
- Biernath, André (14 січня 2021). Coronavirus: qué se sabe sobre la nueva variante encontrada en Brasil (y que llegó a Japón) [Coronavirus: what is known about the new variant found in Brazil (and that reached Japan)]. BBC Brasil (Spanish) (Sao Paulo). Процитовано 18 січня 2021. «Los científicos analizaron el material genético de 31 muestras de pacientes con covid-19 en la ciudad de Manaos... ...De ellos, 13 individuos (el 42% del total) presentaban justamente ese nuevo linaje del virus. Scientists analyzed the genetic material of 31 samples from patients with covid-19 in the city of Manaus... ...Of them, 13 individuals (42% of the total) presented precisely this new lineage of the virus.»
- Circulación de variantes SARS-CoV-2 en Chile [Circulation of SARS-CoV-2 variants in Chile].
- Covid, variante brasiliana: primo caso identificato a Varese [Covid, Brazilian variant: first case identified in Varese]. ADN Kronos (It) (Italy). 25 січня 2021. Процитовано 26 січня 2021.
- Covid, first case of Brazilian variant in Italy. Italy 24 News (Italy). 26 січня 2021. Архів оригіналу за 30 січня 2021. Процитовано 26 січня 2021.
- Ronza, Veronica (26 січня 2021). Covid, è allarme per la variante brasiliana: altri tre casi rilevati in Italia [Covid alarm for the Brazilian variant: three other cases detected in Italy]. Vesuvio Live (It). Процитовано 2 лютого 2021.
- Coronavirus live news: France death toll surpasses 72,000; Brazil variant found in Germany. The Guardian (London). 22 січня 2021. Процитовано 22 січня 2021.
- France registers four cases of Brazilian coronavirus variant, says minister. Reuters (Paris). 4 лютого 2021. Процитовано 5 лютого 2021.
- Brazilian coronavirus variants (P1 and P2) found in the Netherlands (прес-реліз). 29 січня 2021.
- Colombia mantiene vigilancia de cepa brasileña de covid-19 [Colombia maintains surveillance of the Brazilian strain of covid-19]. minsalud.gov.co (Es). Bogotá. 30 січня 2021. Процитовано 31 січня 2021. «The case of a Colombian-Brazilian woman who acquired the new strain and consulted the health services in Leticia is confirmed.»
- Colombia detecta su primer caso de variante brasileña del coronavirus [Colombia detects its first case of Brazilian variant of the coronavirus]. La Vanguardia (Es) (Bogotá). 30 січня 2021. Процитовано 31 січня 2021.
- First Brazilian variants of COVID-19 identified in Buenos Aires. Semana (Buenos Aires). 8 лютого 2021. Процитовано 10 лютого 2021. «Officials said on Monday that two patients who had recently travelled from Brazil has tested positive for the P.1 COVID-19 mutation.»
- Ministry of Health, Trinidad and Tobago (23 квітня 2021). Brazilian Variant Found in Additional COVID-19 Samples. Government of Trinidad and Tobago Ministry of Health (англ.). Процитовано 24 травня 2021.
- Ministry of Health, Trinidad and Tobago (26 квітня 2021). 5 Additional COVID-19 samples Confirmed to be the Brazilian Variant. Government of Trinidad and Tobago Ministry of Health (англ.). Процитовано 24 травня 2021.
- Newsday, Trinidad and Tobago (26 квітня 2021). 5 more cases of Brazilian covid19 variant in Trinidad and Tobago. Trinidad and Tobago Newsday (англ.). Процитовано 24 травня 2021.
- Covid-19: Brazil 'variant of concern' detected in UK. BBC News (UK). 28 лютого 2021. Процитовано 28 лютого 2021.
- Covid: Four more cases of Brazil variant found in England. BBC News (London). 11 березня 2021. Процитовано 11 березня 2021.
- COVID-19: New Philippines-linked coronavirus variant investigated in England after two cases found. Sky News (UK). 16 березня 2021. Процитовано 17 березня 2021.
- Variants: distribution of cases data. gov.uk (англ.). Public Health England. 9 лютого 2021. Процитовано 23 травня 2021.
- Portugal detecta primeiros casos da variante brasileira [Portugal detects first cases of the Brazilian variant]. terra.com (Portugal). 11 лютого 2021. Процитовано 11 лютого 2021.
- Portugal detects first cases of Brazilian COVID-19 variant. The Portugal News (Portugal). 11 лютого 2021. Процитовано 11 лютого 2021.
- INSA identifica mais três casos da variante brasileira (a somar aos sete já conhecidos) [INSA identifies three more cases of the Brazilian variant (in addition to the seven already known)]. Observador. Процитовано 4 березня 2021.
- Coronavirus: variante P.1 se detectó en casos de Artigas, Canelones, Fray Bentos, Montevideo, Rocha, Salto y San José [Coronavirus: variant P.1 was detected in cases from Artigas, Canelones, Fray Bentos, Montevideo, Rocha, Salto and San José]. Процитовано 23 березня 2021.
- Turkey: 2 S. Africa, 1 Brazil variant detected. aa.com.tr. İstanbul. 4 лютого 2021. Процитовано 4 лютого 2021. «Two Turkish citizens have contracted the South African variant...»
- Turkey: Turkey reports cases of South Africa, Brazil variants of coronavirus. dailysabah.com. İstanbul. 4 лютого 2021. Процитовано 4 лютого 2021. «Two people in Turkey have contracted the South African variant...»
- Brasilianska mutationen i Sverige – saknas resekoppling [Brazilian mutation in Sweden - no travel connection]. expressen.se (швед.). Процитовано 21 лютого 2021.
- Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil (прес-реліз). 12 січня 2021.
- 新たなコロナ変異種を確認 ブラジルから入国の4人 [New coronavirus Mutation Confirmed in 4 people from Brazil]. The Nikkei (Japanese) (Japan). 10 січня 2020. Процитовано 14 січня 2021. «厚生労働省は10日、ブラジルから羽田空港に2日に到着した10~40代の男女4人が、新型コロナウイルスでこれまで確認されていないタイプの変異種に感染していたと発表した。国内での変異種への感染確認は計34人になった (The Ministry of Health, Labor and Welfare announced on the 10th that four men and women in their teens and 40s who arrived at Haneda Airport from Brazil on the 2nd were infected with a type of mutation that had not been confirmed so far with the new coronavirus.)»
- Loreto: Diresa reporta caso de variante de Covid-19 procedente de Manaos [[[Department of Loreto|Loreto]]: Diresa reports case of variant of Covid-19 from Manaus]. Peru.21 (Spanish) (Iquitos). 20 січня 2021. Процитовано 21 січня 2021. Назва URL містить вбудоване вікіпосилання (довідка)
- Loreto: DIRESA aclara que variante de Manaos aún no llega a la región [Loreto: DIRESA clarifies that Manaus variant has not yet reached the region]. Canal N (Es) (Peru). 21 січня 2021. Процитовано 27 січня 2021.
- Pilar Mazzetti confirma que en Lima, Loreto y Huánuco se ha encontrado la variante brasilera del coronavirus [Pilar Mazzetti confirms that the Brazilian variant of the coronavirus has been found in Lima, Loreto and Huánuco]. El Comercio (ісп.) (Peru). 4 лютого 2021. Процитовано 4 лютого 2021.
- INS identifica 22 casos de variante brasileña [NIS identifies 22 cases of Brazilian variant]. Diario Correo (Spanish) (Lima). 26 лютого 2021. Процитовано 26 лютого 2021.
- Variante brasileña del COVID-19 amenaza la capacidad de respuesta en hospitales de Madre de Dios [Brazilian variant of COVID-19 threatens response capacity in Madre de Dios hospitals]. Diario Correo (Spanish). 9 квітня 2021. Процитовано 9 квітня 2021.
- Heunicke. Det første tilfælde af varianten P1 er fundet i Danmark [The first case of the variant P1 has been found in Denmark] (Твіт) (da-DK) — через Твіттер. Відсутній або пустий параметр |date= (help)
- Danmark finder første tilfælde af brasiliansk variant, men den vurderes ikke at have spredt sig - TV 2 [Denmark finds the first case of Brazilian variant, but it is not considered to have spread]. nyheder.tv2.dk (da-DK). 3 березня 2021. Процитовано 3 березня 2021.
- PERÚ, NOTICIAS EL COMERCIO (24 березня 2021). Coronavirus: Paraguay confirma presencia de variante brasileña del COVID-19 y reporta récord de muertes [Coronavirus: Paraguay confirms presence of Brazilian variant of COVID-19 and reports record of deaths]. El Comercio Perú (ісп.). Процитовано 25 березня 2021.
- Statement from the National Public Health Emergency Team on the detection of P1 variant in Ireland - Friday 19 February. Government of Ireland. Department of Health. 19 лютого 2021. Процитовано 19 лютого 2021.
- Three cases of Brazilian virus variant identified in Ireland. RTÉ News and Current Affairs. 19 лютого 2021. Процитовано 19 лютого 2021.
- Halpin, Hayley (19 лютого 2021). Three cases of new Covid-19 variant, first identified in Brazil, reported in Ireland. TheJournal.ie. Процитовано 19 лютого 2021.
- Cullen, Paul (9 березня 2021). Covid-19: Irish cases of worrying variant double to six. The Irish Times. Процитовано 9 березня 2021.
- Bowers, Fergal; Hogan, Laura (3 квітня 2021). Newer Covid variants unrelated to travel detected in community, says expert. RTÉ News and Current Affairs. Процитовано 3 квітня 2021.
- Primele două cazuri de infectare cu tulpina braziliană de Covid-19 confirmate în România [First two cases of infection with the Brazilian variant of Covid-19 confirmed in Romania]. stirileprotv.ro (рум.) (Romania). 8 березня 2021. Процитовано 8 березня 2021.
- S. Korea reports 1st COVID-19 variant case from Brazil. Yonhap News Agency. 18 січня 2021. Процитовано 20 січня 2021.
- Suomen epidemiatilanne on jakautunut - muuntuneet virusmuodot herättävät huolta [Finland's pandemic situation is divided - variants are worrying]. thl.fi (fi-FI). 3 березня 2021. Процитовано 18 лютого 2021.
- Mutated Brazilian Variant of Coronavirus Detected in Croatia by RBI Researchers. total-croatia-news.com (en-gb). Процитовано 18 лютого 2021.
- South Africa, Brazil mutated Covid strains have reached India. Times of India (New Delhi). 17 лютого 2021. Процитовано 4 березня 2021.
- First case of Brazil COVID in Philippines. canberratimes.com.au (Canberra). 13 березня 2021. Процитовано 13 березня 2021.
- News, Philippine Star (11 квітня 2021). Philippines sees more cases of COVID-19 variants, including local P.3. Процитовано 11 квітня 2021.
- Egholm, Sverri (18 січня 2021). In a first European case, Brazilian Covid variant confirmed in Faroe. Local.fo. Процитовано 22 січня 2021.
- Coronavirus: New Variants Confirmed in 15 New Cases. Hungary Today. 22 липня 2021. Процитовано 28 серпня 2021. «Tests by the National Public Health Centre (NNK) showed the presence of the Delta variant of the coronavirus in 14 new cases and the gamma variant in one new case, the prime minister's chief of staff said on Thursday.»
- Danner, Chas (25 січня 2021). What We Know About the New P.1 Strain of the Coronavirus. nymag.com. Процитовано 28 січня 2021.
- Voloch, Carolina M. (2020). Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil, Figure 5.. с. 2020.12.23.20248598. doi:10.1101/2020.12.23.20248598. Процитовано 15 січня 2021.
- Nascimento, Valdinete; Souza, Victor (25 лютого 2021). COVID-19 epidemic in the Brazilian state of Amazonas was driven by long-term persistence of endemic SARS-CoV-2 lineages and the recent emergence of the new Variant of Concern P.1. Research Square. doi:10.21203/rs.3.rs-275494/v1. Процитовано 2 березня 2021.
- Andreoni, Manuela; Londoño, Ernesto; Casado, Leticia (3 березня 2021). Brazil's Covid Crisis Is a Warning to the Whole World, Scientists Say - Brazil is seeing a record number of deaths, and the spread of a more contagious coronavirus variant that may cause reinfection.. The New York Times. Процитовано 3 березня 2021.
- Zimmer, Carl (1 березня 2021). Virus Variant in Brazil Infected Many Who Had Already Recovered From Covid-19 - The first detailed studies of the so-called P.1 variant show how it devastated a Brazilian city. Now scientists want to know what it will do elsewhere.. The New York Times. Архів оригіналу за 28 грудня 2021. Процитовано 3 березня 2021.
- Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science 372 (6544): 815–821. 21 травня 2021. Bibcode:2021Sci...372..815F. ISSN 0036-8075. PMC 8139423. PMID 33853970. doi:10.1126/science.abh2644. Проігноровано невідомий параметр
|vauthors=
(довідка); Проігноровано невідомий параметр|doi-access=
(довідка) - Souza, William; Amorim, Mariene; Sesti-Costa, Renata; Coimbra, Lais; Toledo-Teixeira, Daniel (1 березня 2021). Levels of SARS-CoV-2 Lineage P.1 Neutralization by Antibodies Elicited after Natural Infection and Vaccination. The Lancet. SSRN 3793486. doi:10.2139/ssrn.3793486. Процитовано 3 березня 2021.
- Garcia-Beltran, Wilfredo; Lam, Evan; Denis, Kerri (18 лютого 2021). Circulating SARS-CoV-2 variants escape neutralization by vaccine-induced humoral immunity. medrxiv. doi:10.1101/2021.02.14.21251704. Процитовано 3 березня 2021.