Йота-варіант SARS-CoV-2

Йота-варіант,[2] також відомий як лінія B.1.526, є одним із варіантів SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19. Вперше його виявили в Нью-Йорку в листопаді 2020 року. Варіант з’явився з двома помітними мутаціями: спайкова мутація E484K, яка може допомогти вірусу уникнути антитіл, і мутація S477N, яка може допомогти вірусу міцніше зв’язуватися з клітинами людини. 

Йота-варіант SARS-CoV-2
Офіційна назва англ. Iota (31 травня 2021)[1]
Названо на честь йота
Дата відкриття (винаходу) листопад 2020[1]
Місце відкриття Нью-Йорк і США[1]

До лютого 2021 року він швидко поширився в регіоні Нью-Йорка і становив приблизно одну з чотирьох вірусних послідовностей.[3][4] Станом на 11 квітня 2021 року цей варіант був виявлений щонайменше у 48 штатах США та 18 країнах.[5][6]

Згідно зі спрощеною схемою найменування, запропонованою Всесвітньою організацією охорони здоров’я, B.1.526 позначено як йота-варіант і вважається варіантом, що викликає інтерес (VOI), але ще не варіантом, що викликає занепокоєння.[7]

Мутації

Геном Йота (B.1.526) містить такі амінокислотні мутації, усі з яких містяться в коді спайкового білка вірусу: L5F, T95I, D253G, E484K, D614G та A701V.[8]

  • Амінокислотні мутації варіанту SARS-CoV-2 Йота нанесені на карту геному SARS-CoV-2 з акцентом на спайку.

Історія

Збільшення варіанту Йота було зафіксовано дослідниками з Каліфорнійського технологічного інституту шляхом сканування на наявність мутацій у базі даних, відомій як GISAID, глобальна наукова ініціатива, яка задокументувала понад 700 000 геномних послідовностей SARS-CoV-2.[9][10]

Частка випадків у США, представлених варіантом Iota, різко знизилася до кінця липня 2021 року, оскільки варіант Delta став домінуючим.[11]

Статистика
Cases by country (Updated as of 11 August 2021) GISAID[12]
Country Confirmed cases Last Reported Case
 USA 45,558 24 June 2021
Шаблон:Дані країни Ecuador 168 10 June 2021
 Canada 158
 Spain 119 17 June 2021
Шаблон:Дані країни Colombia 115 24 May 2021
Шаблон:Дані країни Aruba 103 10 June 2021
Шаблон:Дані країни Germany 56 22 June 2021
Шаблон:Дані країни Mexico 50 11 June 2021
Шаблон:Дані країни United Kingdom 43 16 May 2021
Шаблон:Дані країни Sint Maarten 17 27 May 2021
Шаблон:Дані країни Ireland 13 7 May 2021
Шаблон:Дані країни Switzerland 12 17 May 2021
Шаблон:Дані країни Chile 11 12 May 2021
Шаблон:Дані країни Denmark 9 31 May 2021
Шаблон:Дані країни Israel 9 26 April 2021
Шаблон:Дані країни Suriname 9 10 May 2021
Шаблон:Дані країни Argentina 8 26 April 2021
Шаблон:Дані країни Belgium 8 18 April 2021
Шаблон:Дані країни Dominican Republic 8 10 June 2021
 France 8 25 May 2021
Шаблон:Дані країни Lithuania 8 28 May 2021
Шаблон:Дані країни Singapore 7 4 April 2021
 Australia 6 21 May 2021
Шаблон:Дані країни Italy 6 4 May 2021
Шаблон:Дані країни Luxembourg 6 05 March 2021
Шаблон:Дані країни Costa Rica 5 21 May 2021
Шаблон:Дані країни Netherlands 5 19 April 2021
Шаблон:Дані країни Russia 5 4 June 2021
Шаблон:Дані країни Croatia 4 9 February 2021
 Japan 4 7 May 2021
Шаблон:Дані країни South Korea 4 14 April 2021
Шаблон:Дані країни Sweden 4 14 May 2021
Шаблон:Дані країни Turkey 4 4 May 2021
Шаблон:Дані країни Malta 4 21 December 2020
Шаблон:Дані країни India 3 24 March 2021
 Dominica 3 15 January 2021
Шаблон:Дані країни Slovenia 3 18 May 2021
Шаблон:Дані країни Austria 2 22 April 2021
Шаблон:Дані країни Ghana 2 20 March 2021
Шаблон:Дані країни Grenada 2 17 January 2021
Шаблон:Дані країни Indonesia 2 8 January 2021
 Jamaica 2 2 February 2021
Шаблон:Дані країни Liberia 2 14 May 2021
Шаблон:Дані країни Portugal 2 4 March 2021
Шаблон:Дані країни Romania 2 17 April 2021
 Anguilla 1 21 April 2021
Шаблон:Дані країни Antigua and Barbuda 1 3 May 2021
 British Virgin Islands 1 25 January 2021
Шаблон:Дані країни Cayman Islands 1 15 April 2021
 China 1
 Curacao 1 30 April 2021
Шаблон:Дані країни Finland 1 14 March 2021
Шаблон:Дані країни Guadeloupe 1 9 March 2021
Шаблон:Дані країни New Zealand 1 16 March 2021
Шаблон:Дані країни Poland 1 31 March 2021
Шаблон:Дані країни Turks and Caicos Islands 1 22 March 2021
Шаблон:Дані країни Venezuela 1 8 May 2021
 World (57 countries) Total: 46,589 Total as of 11 August 2021

Див. також

Примітки
  1. https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
  2. Tracking SARS-CoV-2 variants. www.who.int (англ.). Процитовано 1 червня 2021.
  3. Rosa-Aquino, Matt Stieb, Paola (21 березня 2021). Everything We Know About the Coronavirus Variant Spreading in New York City. Intelligencer (en-us). Процитовано 10 квітня 2021.
  4. Mandavilli, Apoorva (24 лютого 2021). A New Coronavirus Variant Is Spreading in New York, Researchers Report. The New York Times (амер.). ISSN 0362-4331. Процитовано 10 квітня 2021.
  5. outbreak.info. outbreak.info (англ.). Процитовано 10 квітня 2021.
  6. PANGO lineages Lineage B.1.526. cov-lineages.org. 22 квітня 2021. Процитовано 22 квітня 2021.
  7. Tracking SARS-CoV-2 variants. www.who.int (англ.). Процитовано 1 червня 2021.
  8. SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. Процитовано 5 липня 2021.
  9. Corum, Jonathan; Zimmer, Carl. Coronavirus Variants and Mutations. The New York Times (амер.). ISSN 0362-4331. Процитовано 10 квітня 2021.
  10. West, Anthony P.; Barnes, Christopher O.; Yang, Zhi; Bjorkman, Pamela J. (23 лютого 2021). SARS-CoV-2 lineage B.1.526 emerging in the New York region detected by software utility created to query the spike mutational landscape. bioRxiv (англ.): 2021.02.14.431043. PMC 8077570. PMID 33907745. doi:10.1101/2021.02.14.431043.
  11. SARS-CoV-2 sequences by variant, Jul 26, 2021, USA Our World in Data
  12. GISAID - hCov19 Variants. www.gisaid.org. Процитовано 2 липня 2021.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.