Протеопедія
Протеопедія (англ. Proteopedia) — вікі, 3D-енциклопедія білків та інших молекул[2][3][4][5]. Сайт містить сторінку для кожного запису в Банку даних білків (>130,000 сторінок), а також сторінки, які описують білкові структури загалом, такі як ацетилхолінестераза[6], гемоглобін[7], і фотосистема II[8] із застосуванням технології Jmol, яка підсвічує функціональні частини й ліганди. У ньому використовується інструмент для створення таких картинок, тому користувачам не потрібно вивчати мову зображень JSmol для створення індивідуальних молекулярних зображень. Спеціальні зображення легко приєднуються до «зелених посилань» в описовому тексті, які відображають ці картинки в JSmol. Веббраузер — це все, що потрібно для доступу до сайту та 3D-інформації; не потрібно встановлювати програми перегляду.
Протеопедія | |
---|---|
Proteopedia | |
Посилання | proteopedia.org |
Комерційний | ні |
Тип | Онлайн-енциклопедія |
Мови | Англійська |
Започатковано | 2007 |
Рейтинг Alexa | 248 955[1] |
Ліцензія контенту | CC BY-SA 3.0 |
2010 року Протеопедія отримала нагороду за найкращий вебсайт від журналу The Scientist[9].
Весь вміст, доданий користувачами, є безкоштовним і покривається ліцензією GNU Free Documentation License. Протеопедія розміщується в Ізраїльському центрі структурної протеоміки[10] у Науково-дослідному інституті імені Вейцмана.
Див. також
Примітки
- Alexa.com — 1996.
- Hodis E., Prilusky J., Martz E., Silman I., Moult J., Sussman J. L. (2008). Proteopedia - a scientific 'wiki' bridging the rift between three-dimensional structure and function of biomacromolecules. Genome Biol. 9 (8): R121. PMC 2575511. PMID 18673581. doi:10.1186/gb-2008-9-8-r121.
- Martz E (2009). Proteopedia.Org: a scientific "Wiki" bridging the rift between 3D structure and function of biomacromolecules. Biopolymers 92 (1): 76–7. PMID 19117028. doi:10.1002/bip.21126.
- Hodis E., Prilusky J., Sussman J. L. (2010). Proteopedia: A collaborative, virtual 3D web-resource for protein and biomolecule structure and function. Biochemistry and Molecular Biology Education 38 (5): 341–2. PMID 21567857. doi:10.1002/bmb.20431.
- Prilusky, J; Hodis, E.; Canner, D.; Decatur, W. A.; Oberholser, K.; Martz, E.; Berchanski, A.; Harel, M. та ін. (Aug 2011). Proteopedia: A status report on the collaborative, 3D web-encyclopedia of proteins and other biomolecules. Journal of Structural Biology 175 (2): 244–252. PMID 21536137. doi:10.1016/j.jsb.2011.04.011.
- Acetylcholinesterase. Proteopedia.
- Hemoglobin. Proteopedia.
- Photosystem II. Proteopedia.
- Luiggi C (вересень 2010). Web Gems Introducing the winners of the first annual Labbies, our prizes for the best web-based multimedia by labs: Website Winner:Proteopedia. The Scientist 24 (9): 47. «Very absorbing. Kept me looking and playing (and learning) with it for a long time. Very informative and a good resource.»
- The Israel Structural Proteomics Center.