RTL9
RTL9 (англ. Retrotransposon Gag like 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі X-хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 388 амінокислот, а молекулярна маса — 144 280[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MSIPLHSLRF | NNTMREENVE | PQNKQMAFCR | PMTETRADVQ | ILHSHVQLPI | ||||
| VSTSASDPGG | TSTQLMTSPV | FDTMSAPLMG | VPNSGALSPP | LMPASDSGAL | ||||
| SPLLMPASDS | GALSPLLMPA | LDSGTLSPLL | STSEYGVMSP | GMMTIPDFGT | ||||
| MSATLMVAPD | SAEISPLAMP | APSSGVVCTP | IMSTSSSEAM | STPLMLAPDS | ||||
| GELSPILMQD | MNPGVMSTQP | VPAPSSEAMS | PLQITDEDTE | AMSKVLMTAL | ||||
| ASGEISSLLM | SGTDSEAISS | LIMSAVASGG | TSPQPTSTQN | SGGIPTPLMS | ||||
| DLDSGIMSSL | LMSSPGSEVM | STPLLSVPDA | GEMSTLPKPA | PDAEAMSPAL | ||||
| MTALPSGVMP | TQTMPAPGSG | AMSPWSTQNV | DSEMMSNPPV | RATASGVMSA | ||||
| PPVRALDSGA | MSTPLMGAPA | SGNMSTLQKT | VPASGAMTTS | LMTVPSSGVM | ||||
| STEQMSATAS | RVMSAQLTMA | KTSGAMPTGS | MKAVAKQYKR | ATASGKMSTP | ||||
| LRRAPTSGAM | STQPVTATAS | ETMSMPQLTV | PASGSMSMLQ | MRAPVSEAMS | ||||
| MPQMRTMASG | LTSAAQMKAM | TSGAMSTPLM | TAQTSGSTST | LLMRDTASGV | ||||
| MSCPQMRSLA | SGALSKPLMT | PKASGTMFTE | KMTTTASEAM | PTLLMRDTVS | ||||
| GALSMPQMTD | TASGGLSASL | MRDTASGAMS | TSQMTATVSG | GMSMPLMRAQ | ||||
| DPGVMPASLM | RAKVSGKMLS | QPMSTQDPGG | MSMSPMKSMT | AGGMQMNSPT | ||||
| SDVMSTPTVR | AWTSETMSTP | LMRTSDPGER | PSLLTRASSS | GEMSLPLMRA | ||||
| PASGEIATPL | RSPAYGAMSA | PQMTATASGM | MSSMPQVKAP | ISGAMSMPLT | ||||
| RSTASGGMSM | PLMRAPDSRV | TSTSQMMPTA | SGDMCTLPVR | APASGGVSSP | ||||
| LVRAPASGTM | STPLRRPSAC | ETVSTELMRA | SASGHMSTAQ | TTAMVSGGMS | ||||
| KPLMRAPASG | TMPMPLMSAM | ASGEMSMPLM | ETMASGATST | LQTSVANSRS | ||||
| MSLSQTTYTV | SGRMATAPIR | ASASGARSTS | FMRASVSGSM | PMPLPRATAS | ||||
| GCGMGMSMPQ | MTATDSRGMS | TPLMRASGPG | TMSTPQTAFG | VMSTPEIKAT | ||||
| DSGEASTSHI | NITASGSKPT | SHMTATTPET | AKPPPKEVPS | FGMLTPALCY | ||||
| LLEEQEAARG | SCSVEEEMEI | DEEKQMKGFL | DDSERMAFLV | SLHLGAAERW | ||||
| FILQMEVGEP | LSHENKSFLR | RSQGIYDSLS | EIDILSAVLC | HPKQGQKSVR | ||||
| QYATDFLLLA | RHLSWSDAIL | RTRFLEGLSE | AVTTKMGRIF | LKVAGSLKEL | ||||
| IDRSLYTECQ | LAEEKDSPGN | SSQVLPTACK | RNNEEAMGNE | LSSQQQTEEH | ||||
| QHVSKRCYYL | KEHGDPQEGL | HDHLGQSTGH | HQKAHTNK |
| RTL9 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ідентифікатори | |||||||
| Символи | RTL9, MAR9, MART9, RGAG1, retrotransposon gag domain containing 1, SIRH10, retrotransposon Gag like 9 | ||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 300965 MGI: 2685231 HomoloGene: 104140 GeneCards: RTL9 | ||||||
| Ортологи | |||||||
| Види | Людина | Миша | |||||
| Entrez |
|
| |||||
| Ensembl |
|
| |||||
| UniProt |
|
| |||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||
| Локус (UCSC) | Хр. X: 110.36 – 110.46 Mb | Хр. X: 143.1 – 143.1 Mb | |||||
| PubMed search | [1] | [2] | |||||
| Вікідані | |||||||
| |||||||
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 65 — 73. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Brandt J., Veith A.-M., Volff J.-N. (2005). A family of neofunctionalized Ty3/gypsy retrotransposon genes in mammalian genomes.. Cytogenet. Genome Res. 110: 307 — 317. PubMed DOI:10.1159/000084963
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29245 (англ.). Процитовано 22 вересня 2017.
- UniProt, Q8NET4 (англ.). Процитовано 22 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.