SRBD1
SRBD1 (англ. S1 RNA binding domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 995 амінокислот, а молекулярна маса — 111 776[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MSSLPRRAKV | QVQDVVLKDE | FSSFSELSSA | SEEDDKEDSA | WEPQKKVPRS | ||||
| RKQPPPKESK | PKRMPRVKKN | APQISDGSEV | VVVKEELNSS | VAIADTALED | ||||
| RKNKLDTVQT | LKTAKTKQKC | AAQPHTVRRT | KKLKVEEETS | KASNLEGESN | ||||
| SSETPSTSTV | WGGTCKKEEN | DDDFTFGQSA | LKKIKTETYP | QGQPVKFPAN | ||||
| ANSTKEEVEM | NWDMVQVLSE | RTNIEPWVCA | NIIRLFNDDN | TIPFIIRYRK | ||||
| ELINNLDADS | LREVQQTLEE | LRAVAKKVHS | TIQKIKKEGK | MSECLLKAML | ||||
| NCKTFEELEH | VSAPYKTGSK | GTKAQRARQL | GLEGAARALL | EKPGELSLLS | ||||
| YIRPDVKGLS | TLQDIEIGVQ | HILADMIAKD | KDTLDFIRNL | CQKRHVCIQS | ||||
| SLAKVSSKKV | NEKDVDKFLL | YQHFSCNIRN | IHHHQILAIN | RGENLKVLTV | ||||
| KVNISDGVKD | EFCRWCIQNR | WRPRSFARPE | LMKILYNSLN | DSFKRLIYPL | ||||
| LCREFRAKLT | SDAEKESVMM | FGRNLRQLLL | TSPVPGRTLM | GVDPGYKHGC | ||||
| KLAIISPTSQ | ILHTDVVYLH | CGQGFREAEK | IKTLLLNFNC | STVVIGNGTA | ||||
| CRETEAYFAD | LIMKNYFAPL | DVVYCIVSEA | GASIYSVSPE | ANKEMPGLDP | ||||
| NLRSAVSIAR | RVQDPLAELV | KIEPKHIGVG | MYQHDVSQTL | LKATLDSVVE | ||||
| ECVSFVGVDI | NICSEVLLRH | IAGLNANRAK | NIIEWREKNG | PFINREQLKK | ||||
| VKGLGPKSFQ | QCAGFIRINQ | DYIRTFCSQQ | TETSGQIQGV | AVTSSADVEV | ||||
| TNEKQGKKKS | KTAVNVLLKP | NPLDQTCIHP | ESYDIAMRFL | SSIGGTLYEV | ||||
| GKPEMQQKIN | SFLEKEGMEK | IAERLQTTVH | TLQVIIDGLS | QPESFDFRTD | ||||
| FDKPDFKRSI | VCLEDLQIGT | VLTGKVENAT | LFGIFVDIGV | GKSGLIPIRN | ||||
| VTEAKLSKTK | KRRSLGLGPG | ERVEVQVLNI | DIPRSRITLD | LIRVL |
| SRBD1 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ідентифікатори | |||||||
| Символи | SRBD1, S1 RNA binding domain 1 | ||||||
| Зовнішні ІД | MGI: 1925836 HomoloGene: 9994 GeneCards: SRBD1 | ||||||
| Пов'язані генетичні захворювання | |||||||
| Глаукома[1] | |||||||
| Ортологи | |||||||
| Види | Людина | Миша | |||||
| Entrez |
|
| |||||
| Ensembl |
|
| |||||
| UniProt |
|
| |||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||
| Локус (UCSC) | Хр. 2: 45.39 – 45.61 Mb | Хр. 17: 85.98 – 86.15 Mb | |||||
| PubMed search | [2] | [3] | |||||
| Вікідані | |||||||
| |||||||
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432 — 12437. PubMed DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791. PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SRBD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25521 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
- UniProt, Q8N5C6 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.