Гістон H1b

Гістон H1b
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2RHI
Ідентифікатори
Символи	H1-5, H1, H1.5, H1B, H1F5, H1s-3, histone cluster 1, H1b, histone cluster 1 H1 family member b, HIST1H1B, H1.5 linker histone, cluster member
Зовнішні ІД	OMIM: 142711 HomoloGene: 136789 GeneCards: H1-5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • histone deacetylase binding; • chromatin DNA binding; • RNA binding; • GO:0001948 protein binding; • double-stranded DNA binding; • nucleosomal DNA binding;
Клітинна компонента	• Нуклеосома; • Екзосома; • хромосома; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• establishment of protein localization to chromatin; • nucleosome assembly; • protein stabilization; • positive regulation of cell growth; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • chromatin organization; • positive regulation of histone H3-K9 methylation; • regulation of transcription, DNA-templated; • nucleosome positioning; • chromosome condensation; • negative regulation of DNA recombination; • muscle organ development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3009
	н/д
	ENSG00000184357
	н/д
	P16401
	н/д
	NM_005322
	н/д
	NP_005313
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

Гістон H1b (англ. Histone cluster 1 H1 family member b) – білок, який кодується геном HIST1H1B, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 226 амінокислот, а молекулярна маса — 22 580[3].

Представник родини білків гістонів H1.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSETAPAETA	TPAPVEKSPA	KKKATKKAAG	AGAAKRKATG	PPVSELITKA
VAASKERNGL	SLAALKKALA	AGGYDVEKNN	SRIKLGLKSL	VSKGTLVQTK
GTGASGSFKL	NKKAASGEAK	PKAKKAGAAK	AKKPAGATPK	KAKKAAGAKK
AVKKTPKKAK	KPAAAGVKKV	AKSPKKAKAA	AKPKKATKSP	AKPKAVKPKA
AKPKAAKPKA	AKPKAAKAKK	AAAKKK

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Albig W., Meergans T., Doenecke D. (1997). Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes.. Gene 184: 141 — 148. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(96)00582-3
Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes.. Genomics 80: 487 — 498. PubMed DOI:10.1006/geno.2002.6850
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts.. Chromosome Res. 8: 405 — 424. PubMed DOI:10.1023/A:1009262819961
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Hamkalo B.A. (2001). Distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin II: distribution in human adult fibroblasts.. J. Cell. Biochem. 83: 643 — 659. PubMed DOI:10.1002/jcb.1224
Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain.. J. Biol. Chem. 280: 27809 — 27814. PubMed DOI:10.1074/jbc.M501627200

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4719 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.
UniProt, P16401 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4719 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P16401 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.