Каспаза-12
Каспаза 12(CASP12) - білок сімейства каспаз, кодується геном CASP12, що у людей знаходиться на довгому плечі 11-ї хромосоми. Структурно білок найбільш схожий на сімейство каспаз ICE(англ. Interleukin 1-beta Converting Enzyme, ICE — фермети, що конвертують інтерлейкін 1-бета). На відмінну від інших каспаз, не має протеазної активності.
У щурів, гомологічний білок є медіатором апоптозу у відповідь на пошкодження ендоплазматичного ретикулуму(ЕПР-стрес).
Людський ген CASP12 має дуже поширений поліморфізм, при якому в гені присутній передчасний стоп-кодон. Тому у більшості людей транслюється нефункціональний білок. Функціональний білок синтезується в людей, що належать до певної етнічної групи африканських аборигенів, в яких виявлений підвищений ризик розвитку сепсису.
Виявлено кілька різних форм транскрипту, що утворюються шляхами альтернативного сплайсингу.
Ген CASP12
Ген CASP12 є білок-кодуючим і розташований на довгому плечі 11-ї хромосоми. Складається з 12 953-ох нуклеотидів.
Ген та його продукти задіяні в розвитку аміотрофічного латерального склерозу, транспорті електронів в дихальних шляхах та в синтезі АТФ. Бере участь в механізмах апоптозу.
Важливим паралогом гену є ген CASP4.
Біохімічні процеси, в які задіяні продукти гену
Фізіологічні процеси:
- апоптоз
- ЕПР-стрес
Патологічні процеси:
- Хвороба Альцгеймера
- аміотрофічний латеральний склероз
- гепатит В
Білок
Білок має 3 ізоформи, створені шляхом альтернативного сплайсингу. Найпоширеніша ізоформа 1(Q6UXS9-1)складається з 341-ї амінокислоти та має молекулярну масу в 38,9 кДа. Ізоформа 2 (Q6UXS9-2) має стоп-кодон на місці 169-ї амінокислоти, тому її довжина 168 амінокислот та молекулярна маса 19 кДа. Крім цього, після 87-ї амінокислоти спостерігаються амінокислотні заміни. В ізоформі 3(Q6UXS9-3) відсутній фрагмент з 3-86 амінокислот, довжина - 257, молекулярна маса - 29,4 кДа.
Найбільша концентрація білку виявлена в ЕПР, невелика кількість присутня в цитозолі.
Білок може знижувати вивільнення цитокінів у відповідь на бактеріальний ліпополісахарид під час інфекцій. Знижує активацію NF-каппа-B у відповідь на TNF.
Недавні дослідження показали, що відбувається позитивний добір індивідів за неактивною формою гену, так як вони більш стійкі до розвитку запальних захворювань.
Література
- Population distribution of the functional caspase-12 allele. (PMID: 16917906) Kachapati K … Dean M Human mutation 2006[2]
- Spread of an inactive form of caspase-12 in humans is due to recent positive selection. (PMID: 16532395) Xue Y … Tyler-Smith C American journal of human genetics 2006
- Human caspase 12 has acquired deleterious mutations. (PMID: 12054529) Fischer H … Tschachler E Biochemical and biophysical research communications 2002[3]
- Genetic variation of innate immune genes in HIV-infected african patients with or without oropharyngeal candidiasis.[4] (PMID: 20577092) Plantinga TS … Netea MG Journal of acquired immune deficiency syndromes (1999) 2010
- Persistence of full-length caspase-12 and its relation to malaria in West and Central African populations. (PMID: 20423816) McCall MB … Netea MG European cytokine network 2010
Див. також
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Kachapati, Kritika; O'Brien, Thomas R.; Bergeron, Julie; Zhang, Mingdong; Dean, Michael (2006-9). Population distribution of the functional caspase-12 allele. Human Mutation 27 (9). с. 975. ISSN 1098-1004. PMID 16917906. doi:10.1002/humu.9448. Процитовано 9 січня 2019.
- Fischer, Heinz; Koenig, Ulrich; Eckhart, Leopold; Tschachler, Erwin (3 травня 2002). Human caspase 12 has acquired deleterious mutations. Biochemical and Biophysical Research Communications 293 (2). с. 722–726. ISSN 0006-291X. PMID 12054529. doi:10.1016/S0006-291X(02)00289-9. Процитовано 9 січня 2019.
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20577092. Пропущений або порожній
|title=(довідка)