Каспаза 9

CASP9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4RHW, 1JXQ, 1NW9, 2AR9, 3D9T, 3V3K, 3YGS
Ідентифікатори
Символи	CASP9, APAF-3, APAF3, ICE-LAP6, MCH6, PPP1R56, caspase 9
Зовнішні ІД	OMIM: 602234 MGI: 1277950 HomoloGene: 31024 GeneCards: CASP9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • SH3 domain binding; • peptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • GO:0010577 enzyme activator activity; • hydrolase activity; • protein kinase binding; • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; • cysteine-type endopeptidase activity; • identical protein binding; • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway; • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мітохондрія; • apoptosome; • клітинне ядро; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process; • response to estradiol; • response to organic cyclic compound; • signal transduction in response to DNA damage; • cellular response to UV; • response to antibiotic; • cellular response to organic cyclic compound; • Старіння людини; • Тромбоцитопоез; • glial cell apoptotic process; • cellular response to dexamethasone stimulus; • Протеоліз; • cellular response to DNA damage stimulus; • response to lipopolysaccharide; • positive regulation of neuron apoptotic process; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • regulation of response to DNA damage stimulus; • response to cobalt ion; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • response to UV; • execution phase of apoptosis; • positive regulation of apoptotic process; • Апоптоз; • kidney development; • response to ischemia; • leukocyte apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	842
	12371
	ENSG00000132906
	ENSMUSG00000028914
	P55211
	Q8C3Q9
	NM_001229; NM_001278054; NM_032996
	NM_001277932; NM_015733; NM_001355176
	NP_001220; NP_001264983; NP_127463
	NP_001264861; NP_056548; NP_001342105
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CASP9 (англ. Caspase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 46 281[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEADRRLLR	RCRLRLVEEL	QVDQLWDALL	SRELFRPHMI	EDIQRAGSGS
RRDQARQLII	DLETRGSQAL	PLFISCLEDT	GQDMLASFLR	TNRQAAKLSK
PTLENLTPVV	LRPEIRKPEV	LRPETPRPVD	IGSGGFGDVG	ALESLRGNAD
LAYILSMEPC	GHCLIINNVN	FCRESGLRTR	TGSNIDCEKL	RRRFSSLHFM
VEVKGDLTAK	KMVLALLELA	QQDHGALDCC	VVVILSHGCQ	ASHLQFPGAV
YGTDGCPVSV	EKIVNIFNGT	SCPSLGGKPK	LFFIQACGGE	QKDHGFEVAS
TSPEDESPGS	NPEPDATPFQ	EGLRTFDQLD	AISSLPTPSD	IFVSYSTFPG
FVSWRDPKSG	SWYVETLDDI	FEQWAHSEDL	QSLLLRVANA	VSVKGIYKQM
PGCFNFLRKK	LFFKTS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як апоптоз.

Література

Seol D.W., Billiar T.R. (1999). A caspase-9 variant missing the catalytic site is an endogenous inhibitor of apoptosis.. J. Biol. Chem. 274: 2072 — 2076. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.4.2072
Wang P., Shi T., Ma D. (2006). Cloning of a novel human caspase-9 splice variant containing only the CARD domain.. Life Sci. 79: 934 — 940. PubMed DOI:10.1016/j.lfs.2006.04.026
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bartke T., Pohl C., Pyrowolakis G., Jentsch S. (2004). Dual role of BRUCE as an antiapoptotic IAP and a chimeric E2/E3 ubiquitin ligase.. Mol. Cell 14: 801 — 811. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2004.05.018
Checinska A., Giaccone G., Rodriguez J.A., Kruyt F.A.E., Jimenez C.R. (2009). Comparative proteomics analysis of caspase-9-protein complexes in untreated and cytochrome c/dATP stimulated lysates of NSCLC cells.. J. Proteomics 72: 575 — 585. PubMed DOI:10.1016/j.jprot.2008.11.016
Renatus M., Stennicke H.R., Scott F.L., Liddington R.C., Salvesen G.S. (2001). Dimer formation drives the activation of the cell death protease caspase 9.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 14250 — 14255. PubMed DOI:10.1073/pnas.231465798

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1511 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P55211 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1511 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P55211 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.