CASP1

CASP1 (англ. Caspase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 45 159[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MADKVLKEKRKLFIRSMGEGTINGLLDELLQTRVLNKEEMEKVKRENATV
MDKTRALIDSVIPKGAQACQICITYICEEDSYLAGTLGLSADQTSGNYLN
MQDSQGVLSSFPAPQAVQDNPAMPTSSGSEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSA
EIYPIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSV
DVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLVFMSHGIREGICGKKHSE
QVPDILQLNAIFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRGDSPGVVWFKDSVG
VSGNLSLPTTEEFEDDAIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFI
GRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQPDGRAQMPTTERVTLTRCFYL
FPGH
CASP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CASP1, ICE, IL1BC, P45, caspase 1
Зовнішні ІД OMIM: 147678 MGI: 96544 HomoloGene: 133272 GeneCards: CASP1
шифр КФ 3.4.22.36
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
834
12362
Ensembl
ENSG00000137752
ENSMUSG00000025888
UniProt
P29466
P29452
RefSeq (мРНК)
NM_009807
RefSeq (білок)
NP_033937
Локус (UCSC) Хр. 11: 105.03 – 105.04 Mb Хр. 9: 5.3 – 5.31 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • Alnemri E.S., Fernandes-Alnemri T., Litwack G. (1995). Cloning and expression of four novel isoforms of human interleukin-1 beta converting enzyme with different apoptotic activities.. J. Biol. Chem. 270: 4312 — 4317. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.9.4312
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Feng Q., Li P., Leung P.C.K., Auersperg N. (2004). Caspase-1 zeta, a new splice variant of caspase-1 gene.. Genomics 84: 587 — 591. PubMed DOI:10.1016/j.ygeno.2004.06.005
  • Humke E.W., Shriver S.K., Starovasnik M.A., Fairbrother W.J., Dixit V.M. (2000). ICEBERG: a novel inhibitor of interleukin-1beta generation.. Cell 103: 99 — 111. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)00108-2
  • Romanowski M.J., Scheer J.M., O'Brien T., McDowell R.S. (2004). Crystal structures of a ligand-free and malonate-bound human caspase-1: implications for the mechanism of substrate binding.. Structure 12: 1361 — 1371. PubMed DOI:10.1016/j.str.2004.05.010

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1499 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, P29466 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.