CASP1

CASP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BMQ, 1IBC, 1ICE, 1RWK, 1RWM, 1RWN, 1RWO, 1RWP, 1RWV, 1RWW, 1RWX, 1SC1, 1SC3, 1SC4, 2FQQ, 2H48, 2H4W, 2H4Y, 2H51, 2H54, 2HBQ, 2HBR, 2HBY, 2HBZ, 3D6F, 3D6H, 3D6M, 3E4C, 3NS7, 5FNA
Ідентифікатори
Символи	CASP1, ICE, IL1BC, P45, caspase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 147678 MGI: 96544 HomoloGene: 133272 GeneCards: CASP1
шифр КФ	3.4.22.36
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • endopeptidase activity; • peptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process; • hydrolase activity; • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • kinase binding; • cysteine-type endopeptidase activity; • CARD domain binding; • identical protein binding; • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway;
Клітинна компонента	• NLRP3 inflammasome complex; • цитоплазма; • гіалоплазма; • NLRP1 inflammasome complex; • extracellular region; • AIM2 inflammasome complex; • мітохондрія; • IPAF inflammasome complex; • protease inhibitor complex; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• cellular response to organic substance; • response to ATP; • response to hypoxia; • response to bacterium; • membrane hyperpolarization; • Піроптоз; • protein processing; • toxin transport; • Протеоліз; • cellular response to mechanical stimulus; • response to lipopolysaccharide; • regulation of autophagy; • interleukin-1 beta production; • mitochondrial depolarization; • programmed necrotic cell death; • Сигнальна трансдукція; • Апоптоз; • regulation of apoptotic process; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • regulation of inflammatory response; • execution phase of apoptosis; • cellular response to lipopolysaccharide; • cellular response to interferon-gamma; • protein autoprocessing; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • cytokine-mediated signaling pathway; • cellular response to cytokine stimulus; • apoptotic signaling pathway; • positive regulation of interleukin-1 beta production;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	834
	12362
	ENSG00000137752
	ENSMUSG00000025888
	P29466
	P29452
NM_001223; NM_001257118; NM_001257119; NM_033292; NM_033293;
	NM_033294; NM_033295
	NM_009807
NP_001214; NP_001244047; NP_001244048; NP_150634; NP_150635;
	NP_150636; NP_150637
	NP_033937
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CASP1 (англ. Caspase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 45 159[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADKVLKEKR	KLFIRSMGEG	TINGLLDELL	QTRVLNKEEM	EKVKRENATV
MDKTRALIDS	VIPKGAQACQ	ICITYICEED	SYLAGTLGLS	ADQTSGNYLN
MQDSQGVLSS	FPAPQAVQDN	PAMPTSSGSE	GNVKLCSLEE	AQRIWKQKSA
EIYPIMDKSS	RTRLALIICN	EEFDSIPRRT	GAEVDITGMT	MLLQNLGYSV
DVKKNLTASD	MTTELEAFAH	RPEHKTSDST	FLVFMSHGIR	EGICGKKHSE
QVPDILQLNA	IFNMLNTKNC	PSLKDKPKVI	IIQACRGDSP	GVVWFKDSVG
VSGNLSLPTT	EEFEDDAIKK	AHIEKDFIAF	CSSTPDNVSW	RHPTMGSVFI
GRLIEHMQEY	ACSCDVEEIF	RKVRFSFEQP	DGRAQMPTTE	RVTLTRCFYL
FPGH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Alnemri E.S., Fernandes-Alnemri T., Litwack G. (1995). Cloning and expression of four novel isoforms of human interleukin-1 beta converting enzyme with different apoptotic activities.. J. Biol. Chem. 270: 4312 — 4317. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.9.4312
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Feng Q., Li P., Leung P.C.K., Auersperg N. (2004). Caspase-1 zeta, a new splice variant of caspase-1 gene.. Genomics 84: 587 — 591. PubMed DOI:10.1016/j.ygeno.2004.06.005
Humke E.W., Shriver S.K., Starovasnik M.A., Fairbrother W.J., Dixit V.M. (2000). ICEBERG: a novel inhibitor of interleukin-1beta generation.. Cell 103: 99 — 111. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)00108-2
Romanowski M.J., Scheer J.M., O'Brien T., McDowell R.S. (2004). Crystal structures of a ligand-free and malonate-bound human caspase-1: implications for the mechanism of substrate binding.. Structure 12: 1361 — 1371. PubMed DOI:10.1016/j.str.2004.05.010

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1499 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P29466 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1499 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P29466 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.