Катепсин S

CTSS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GLO, 1MS6, 1NPZ, 1NQC, 2C0Y, 2F1G, 2FQ9, 2FRA, 2FRQ, 2FT2, 2FUD, 2FYE, 2G6D, 2G7Y, 2H7J, 2HH5, 2HHN, 2HXZ, 2OP3, 2R9M, 2R9N, 2R9O, 3IEJ, 3KWN, 3MPE, 3MPF, 3N3G, 3N4C, 3OVX, 4P6E, 4P6G
Ідентифікатори
Символи	CTSS, entrez:1520, cathepsin S
Зовнішні ІД	OMIM: 116845 MGI: 107341 HomoloGene: 20867 GeneCards: CTSS
Реагує на сполуку
	odanacatib[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• fibronectin binding; • cysteine-type peptidase activity; • collagen binding; • peptidase activity; • cysteine-type endopeptidase activity; • laminin binding; • hydrolase activity; • proteoglycan binding; • serine-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • extracellular region; • endolysosome lumen; • lysosomal lumen; • Лізосома; • extracellular space; • tertiary granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen; • collagen-containing extracellular matrix; • late endosome;
Біологічний процес	• positive regulation of cation channel activity; • antigen processing and presentation; • adaptive immune response; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • protein processing; • extracellular matrix disassembly; • Протеоліз; • toll-like receptor signaling pathway; • antigen processing and presentation of peptide antigen; • Імунна відповідь; • cellular response to thyroid hormone stimulus; • collagen catabolic process; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • basement membrane disassembly; • response to acidic pH; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1520
	13040
	ENSG00000163131
	ENSMUSG00000038642
	P25774
	O70370
	NM_004079; NM_001199739
	NM_001267695; NM_021281
	NP_001186668; NP_004070
	NP_001254624; NP_067256
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Катепсін С (англ. Cathepsin S) – білок, який кодується геном CTSS, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 331 амінокислот, а молекулярна маса — 37 496[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKRLVCVLLV	CSSAVAQLHK	DPTLDHHWHL	WKKTYGKQYK	EKNEEAVRRL
IWEKNLKFVM	LHNLEHSMGM	HSYDLGMNHL	GDMTSEEVMS	LMSSLRVPSQ
WQRNITYKSN	PNRILPDSVD	WREKGCVTEV	KYQGSCGACW	AFSAVGALEA
QLKLKTGKLV	SLSAQNLVDC	STEKYGNKGC	NGGFMTTAFQ	YIIDNKGIDS
DASYPYKAMD	QKCQYDSKYR	AATCSKYTEL	PYGREDVLKE	AVANKGPVSV
GVDARHPSFF	LYRSGVYYEP	SCTQNVNHGV	LVVGYGDLNG	KEYWLVKNSW
GHNFGEEGYI	RMARNKGNHC	GIASFPSYPE	I

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fengler A., Brandt W. (1998). Three-dimensional structures of the cysteine proteases cathepsins K and S deduced by knowledge-based modelling and active site characteristics.. Protein Eng. 11: 1007 — 1013. PubMed DOI:10.1093/protein/11.11.1007
Shi G.-P., Munger J.S., Meara J.P., Rich D.H., Chapman H.A. (1992). Molecular cloning and expression of human alveolar macrophage cathepsin S, an elastinolytic cysteine protease.. J. Biol. Chem. 267: 7258 — 7262. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Cathepsin S переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2545 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P25774 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Cathepsin S переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2545 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P25774 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.