Лейцил-тРНК-синтаза

LARS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2WFD
Ідентифікатори
Символи	LARS1, HSPC192, LEURS, LEUS, LFIS, LRS, PIG44, RNTLS, hr025Cl, ILFS1, Leucyl-tRNA synthetase, LARS, leucyl-tRNA synthetase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 151350 MGI: 1913808 HomoloGene: 7083 GeneCards: LARS1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• aminoacyl-tRNA ligase activity; • nucleotide binding; • leucine-tRNA ligase activity; • ligase activity; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding; • aminoacyl-tRNA editing activity; • valine-tRNA ligase activity; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • glutamine-tRNA ligase activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • Ядерні тільця; • цитоплазма; • Лізосома; • Ендоплазматичний ретикулум; • endomembrane system; • aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex;
Біологічний процес	• tRNA aminoacylation for protein translation; • Біосинтез білків; • leucyl-tRNA aminoacylation; • valyl-tRNA aminoacylation; • protein targeting to lysosome; • regulation of cell size; • negative regulation of autophagy; • cellular response to amino acid starvation; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • cellular response to amino acid stimulus; • cellular response to leucine; • positive regulation of TORC1 signaling; • cellular response to leucine starvation; • glutaminyl-tRNA aminoacylation; • aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51520
	107045
	ENSG00000133706
	ENSMUSG00000024493
	Q9P2J5
	Q8BMJ2
	NM_020117; NM_001317964; NM_001317965; NM_016460
	NM_134137
	NP_001304893; NP_001304894; NP_057544; NP_064502
	NP_598898
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LARS (англ. Leucyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 176 амінокислот, а молекулярна маса — 134 466[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAERKGTAKV	DFLKKIEKEI	QQKWDTERVF	EVNASNLEKQ	TSKGKYFVTF
PYPYMNGRLH	LGHTFSLSKC	EFAVGYQRLK	GKCCLFPFGL	HCTGMPIKAC
ADKLKREIEL	YGCPPDFPDE	EEEEEETSVK	TEDIIIKDKA	KGKKSKAAAK
AGSSKYQWGI	MKSLGLSDEE	IVKFSEAEHW	LDYFPPLAIQ	DLKRMGLKVD
WRRSFITTDV	NPYYDSFVRW	QFLTLRERNK	IKFGKRYTIY	SPKDGQPCMD
HDRQTGEGVG	PQEYTLLKLK	VLEPYPSKLS	GLKGKNIFLV	AATLRPETMF
GQTNCWVRPD	MKYIGFETVN	GDIFICTQKA	ARNMSYQGFT	KDNGVVPVVK
ELMGEEILGA	SLSAPLTSYK	VIYVLPMLTI	KEDKGTGVVT	SVPSDSPDDI
AALRDLKKKQ	ALRAKYGIRD	DMVLPFEPVP	VIEIPGFGNL	SAVTICDELK
IQSQNDREKL	AEAKEKIYLK	GFYEGIMLVD	GFKGQKVQDV	KKTIQKKMID
AGDALIYMEP	EKQVMSRSSD	ECVVALCDQW	YLDYGEENWK	KQTSQCLKNL
ETFCEETRRN	FEATLGWLQE	HACSRTYGLG	THLPWDEQWL	IESLSDSTIY
MAFYTVAHLL	QGGNLHGQAE	SPLGIRPQQM	TKEVWDYVFF	KEAPFPKTQI
AKEKLDQLKQ	EFEFWYPVDL	RVSGKDLVPN	HLSYYLYNHV	AMWPEQSDKW
PTAVRANGHL	LLNSEKMSKS	TGNFLTLTQA	IDKFSADGMR	LALADAGDTV
EDANFVEAMA	DAGILRLYTW	VEWVKEMVAN	WDSLRSGPAS	TFNDRVFASE
LNAGIIKTDQ	NYEKMMFKEA	LKTGFFEFQA	AKDKYRELAV	EGMHRELVFR
FIEVQTLLLA	PFCPHLCEHI	WTLLGKPDSI	MNASWPVAGP	VNEVLIHSSQ
YLMEVTHDLR	LRLKNYMMPA	KGKKTDKQPL	QKPSHCTIYV	AKNYPPWQHT
TLSVLRKHFE	ANNGKLPDNK	VIASELGSMP	ELKKYMKKVM	PFVAMIKENL
EKMGPRILDL	QLEFDEKAVL	MENIVYLTNS	LELEHIEVKF	ASEAEDKIRE
DCCPGKPLNV	FRIEPGVSVS	LVNPQPSNGH	FSTKIEIRQG	DNCDSIIRRL
MKMNRGIKDL	SKVKLMRFDD	PLLGPRRVPV	LGKEYTEKTP	ISEHAVFNVD
LMSKKIHLTE	NGIRVDIGDT	IIYLVH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 65 — 73. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6512 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.
UniProt, Q9P2J5 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6512 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9P2J5 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.