ABCA4

ABCA4 (англ. ATP binding cassette subfamily A member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 273 амінокислот, а молекулярна маса — 255 944[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGFVRQIQLLLWKNWTLRKRQKIRFVVELVWPLSLFLVLIWLRNANPLYS
HHECHFPNKAMPSAGMLPWLQGIFCNVNNPCFQSPTPGESPGIVSNYNNS
ILARVYRDFQELLMNAPESQHLGRIWTELHILSQFMDTLRTHPERIAGRG
IRIRDILKDEETLTLFLIKNIGLSDSVVYLLINSQVRPEQFAHGVPDLAL
KDIACSEALLERFIIFSQRRGAKTVRYALCSLSQGTLQWIEDTLYANVDF
FKLFRVLPTLLDSRSQGINLRSWGGILSDMSPRIQEFIHRPSMQDLLWVT
RPLMQNGGPETFTKLMGILSDLLCGYPEGGGSRVLSFNWYEDNNYKAFLG
IDSTRKDPIYSYDRRTTSFCNALIQSLESNPLTKIAWRAAKPLLMGKILY
TPDSPAARRILKNANSTFEELEHVRKLVKAWEEVGPQIWYFFDNSTQMNM
IRDTLGNPTVKDFLNRQLGEEGITAEAILNFLYKGPRESQADDMANFDWR
DIFNITDRTLRLVNQYLECLVLDKFESYNDETQLTQRALSLLEENMFWAG
VVFPDMYPWTSSLPPHVKYKIRMDIDVVEKTNKIKDRYWDSGPRADPVED
FRYIWGGFAYLQDMVEQGITRSQVQAEAPVGIYLQQMPYPCFVDDSFMII
LNRCFPIFMVLAWIYSVSMTVKSIVLEKELRLKETLKNQGVSNAVIWCTW
FLDSFSIMSMSIFLLTIFIMHGRILHYSDPFILFLFLLAFSTATIMLCFL
LSTFFSKASLAAACSGVIYFTLYLPHILCFAWQDRMTAELKKAVSLLSPV
AFGFGTEYLVRFEEQGLGLQWSNIGNSPTEGDEFSFLLSMQMMLLDAAVY
GLLAWYLDQVFPGDYGTPLPWYFLLQESYWLGGEGCSTREERALEKTEPL
TEETEDPEHPEGIHDSFFEREHPGWVPGVCVKNLVKIFEPCGRPAVDRLN
ITFYENQITAFLGHNGAGKTTTLSILTGLLPPTSGTVLVGGRDIETSLDA
VRQSLGMCPQHNILFHHLTVAEHMLFYAQLKGKSQEEAQLEMEAMLEDTG
LHHKRNEEAQDLSGGMQRKLSVAIAFVGDAKVVILDEPTSGVDPYSRRSI
WDLLLKYRSGRTIIMSTHHMDEADLLGDRIAIIAQGRLYCSGTPLFLKNC
FGTGLYLTLVRKMKNIQSQRKGSEGTCSCSSKGFSTTCPAHVDDLTPEQV
LDGDVNELMDVVLHHVPEAKLVECIGQELIFLLPNKNFKHRAYASLFREL
EETLADLGLSSFGISDTPLEEIFLKVTEDSDSGPLFAGGAQQKRENVNPR
HPCLGPREKAGQTPQDSNVCSPGAPAAHPEGQPPPEPECPGPQLNTGTQL
VLQHVQALLVKRFQHTIRSHKDFLAQIVLPATFVFLALMLSIVIPPFGEY
PALTLHPWIYGQQYTFFSMDEPGSEQFTVLADVLLNKPGFGNRCLKEGWL
PEYPCGNSTPWKTPSVSPNITQLFQKQKWTQVNPSPSCRCSTREKLTMLP
ECPEGAGGLPPPQRTQRSTEILQDLTDRNISDFLVKTYPALIRSSLKSKF
WVNEQRYGGISIGGKLPVVPITGEALVGFLSDLGRIMNVSGGPITREASK
EIPDFLKHLETEDNIKVWFNNKGWHALVSFLNVAHNAILRASLPKDRSPE
EYGITVISQPLNLTKEQLSEITVLTTSVDAVVAICVIFSMSFVPASFVLY
LIQERVNKSKHLQFISGVSPTTYWVTNFLWDIMNYSVSAGLVVGIFIGFQ
KKAYTSPENLPALVALLLLYGWAVIPMMYPASFLFDVPSTAYVALSCANL
FIGINSSAITFILELFENNRTLLRFNAVLRKLLIVFPHFCLGRGLIDLAL
SQAVTDVYARFGEEHSANPFHWDLIGKNLFAMVVEGVVYFLLTLLVQRHF
FLSQWIAEPTKEPIVDEDDDVAEERQRIITGGNKTDILRLHELTKIYPGT
SSPAVDRLCVGVRPGECFGLLGVNGAGKTTTFKMLTGDTTVTSGDATVAG
KSILTNISEVHQNMGYCPQFDAIDELLTGREHLYLYARLRGVPAEEIEKV
ANWSIKSLGLTVYADCLAGTYSGGNKRKLSTAIALIGCPPLVLLDEPTTG
MDPQARRMLWNVIVSIIREGRAVVLTSHSMEECEALCTRLAIMVKGAFRC
MGTIQHLKSKFGDGYIVTMKIKSPKDDLLPDLNPVEQFFQGNFPGSVQRE
RHYNMLQFQVSSSSLARIFQLLLSHKDSLLIEEYSVTQTTLDQVFVNFAK
QQTESHDLPLHPRAAGASRQAQD
ABCA4
Ідентифікатори
Символи ABCA4, AW050280, Abc10, Abcr, D430003I15Rik, RmP, ARMD2, CORD3, FFM, RP19, STGD, STGD1, ATP binding cassette subfamily A member 4
Зовнішні ІД OMIM: 601691 MGI: 109424 HomoloGene: 298 GeneCards: ABCA4
Пов'язані генетичні захворювання
Stargardt disease, age related macular degeneration 2, cone-rod dystrophy 3, retinitis pigmentosa 19[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
24
11304
Ensembl
ENSG00000198691
ENSMUSG00000028125
UniProt
P78363
O35600
RefSeq (мРНК)
NM_000350
NM_007378
RefSeq (білок)
NP_000341
NP_031404
Локус (UCSC) Хр. 1: 93.99 – 94.12 Mb Хр. 3: 122.04 – 122.18 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Задіяний у такому біологічному процесі як транспорт. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані.

Література

  • Azarian S.M., Travis G.H. (1997). The photoreceptor rim protein is an ABC transporter encoded by the gene for recessive Stargardt's disease (ABCR).. FEBS Lett. 409: 247 — 252. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(97)00517-6
  • Roni V., Carpio R., Wissinger B. (2007). Mapping of transcription start sites of human retina expressed genes.. BMC Genomics 8: 42 — 42. PubMed DOI:10.1186/1471-2164-8-42
  • Sun H., Molday R.S., Nathans J. (1999). Retinal stimulates ATP hydrolysis by purified and reconstituted ABCR, the photoreceptor-specific ATP-binding cassette transporter responsible for Stargardt disease.. J. Biol. Chem. 274: 8269 — 8281. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.12.8269
  • Bungert S., Molday L.L., Molday R.S. (2001). Membrane topology of the ATP binding cassette transporter ABCR and its relationship to ABC1 and related ABCA transporters: identification of N-linked glycosylation sites.. J. Biol. Chem. 276: 23539 — 23546. PubMed DOI:10.1074/jbc.M101902200
  • Shroyer N.F., Lewis R.A., Lupski J.R. (2000). Complex inheritance of ABCR mutations in Stargardt disease: linkage disequilibrium, complex alleles, and pseudodominance.. Hum. Genet. 106: 244 — 248. PubMed DOI:10.1007/s004390051034
  • Sun H., Smallwood P.M., Nathans J. (2000). Biochemical defects in ABCR protein variants associated with human retinopathies.. Nat. Genet. 26: 242 — 246. PubMed DOI:10.1038/79994

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.