AFDN

AFDN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1T2M, 1XZ9, 2AIN, 2EXG, 5A6C
Ідентифікатори
Символи	AFDN, AF6, MLL-AF6, MLLT4, myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia; translocated to, 4, afadin, adherens junction formation factor, l-afadin
Зовнішні ІД	OMIM: 159559 MGI: 1314653 HomoloGene: 21202 GeneCards: AFDN
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein C-terminus binding; • GO:0001948 protein binding; • cadherin binding; • cell adhesion molecule binding; • actin filament binding;
Клітинна компонента	• Адгезивні контакти; • Міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • cell-cell junction; • nuclear speck; • cell-cell contact zone; • Щільні контакти;
Біологічний процес	• cell-cell signaling; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • Адгезія клітин; • establishment of endothelial intestinal barrier; • Сигнальна трансдукція; • regulation of protein localization; • adherens junction organization; • positive regulation of gene expression; • positive regulation of cell-cell adhesion; • negative regulation of cell migration; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • establishment of protein localization to plasma membrane; • bicellular tight junction assembly; • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4301
	17356
	ENSG00000130396
	ENSMUSG00000068036
	P55196
	Q9QZQ1
NM_001040000; NM_001040001; NM_001207008; NM_001291964; NM_005936;
	NM_001366319; NM_001366320; NM_001366321; NM_001386888
	NM_010806
NP_001035089; NP_001193937; NP_001278893; NP_001353248; NP_001353249;
	NP_001353250
	NP_034936
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AFDN (англ. Afadin, adherens junction formation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 824 амінокислот, а молекулярна маса — 206 804[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAGGRDEER	RKLADIIHHW	NANRLDLFEI	SQPTEDLEFH	GVMRFYFQDK
AAGNFATKCI	RVSSTATTQD	VIETLAEKFR	PDMRMLSSPK	YSLYEVHVSG
ERRLDIDEKP	LVVQLNWNKD	DREGRFVLKN	ENDAIPPKKA	QSNGPEKQEK
EGVIQNFKRT	LSKKEKKEKK	KREKEALRQA	SDKDDRPFQG	EDVENSRLAA
EVYKDMPETS	FTRTISNPEV	VMKRRRQQKL	EKRMQEFRSS	DGRPDSGGTL
RIYADSLKPN	IPYKTILLST	TDPADFAVAE	ALEKYGLEKE	NPKDYCIARV
MLPPGAQHSD	EKGAKEIILD	DDECPLQIFR	EWPSDKGILV	FQLKRRPPDH
IPKKTKKHLE	GKTPKGKERA	DGSGYGSTLP	PEKLPYLVEL	SPGRRNHFAY
YNYHTYEDGS	DSRDKPKLYR	LQLSVTEVGT	EKLDDNSIQL	FGPGIQPHHC
DLTNMDGVVT	VTPRSMDAET	YVEGQRISET	TMLQSGMKVQ	FGASHVFKFV
DPSQDHALAK	RSVDGGLMVK	GPRHKPGIVQ	ETTFDLGGDI	HSGTALPTSK
STTRLDSDRV	SSASSTAERG	MVKPMIRVEQ	QPDYRRQESR	TQDASGPELI
LPASIEFRES	SEDSFLSAII	NYTNSSTVHF	KLSPTYVLYM	ACRYVLSNQY
RPDISPTERT	HKVIAVVNKM	VSMMEGVIQK	QKNIAGALAF	WMANASELLN
FIKQDRDLSR	ITLDAQDVLA	HLVQMAFKYL	VHCLQSELNN	YMPAFLDDPE
ENSLQRPKID	DVLHTLTGAM	SLLRRCRVNA	ALTIQLFSQL	FHFINMWLFN
RLVTDPDSGL	CSHYWGAIIR	QQLGHIEAWA	EKQGLELAAD	CHLSRIVQAT
TLLTMDKYAP	DDIPNINSTC	FKLNSLQLQA	LLQNYHCAPD	EPFIPTDLIE
NVVTVAENTA	DELARSDGRE	VQLEEDPDLQ	LPFLLPEDGY	SCDVVRNIPN
GLQEFLDPLC	QRGFCRLIPH	TRSPGTWTIY	FEGADYESHL	LRENTELAQP
LRKEPEIITV	TLKKQNGMGL	SIVAAKGAGQ	DKLGIYVKSV	VKGGAADVDG
RLAAGDQLLS	VDGRSLVGLS	QERAAELMTR	TSSVVTLEVA	KQGAIYHGLA
TLLNQPSPMM	QRISDRRGSG	KPRPKSEGFE	LYNNSTQNGS	PESPQLPWAE
YSEPKKLPGD	DRLMKNRADH	RSSPNVANQP	PSPGGKSAYA	SGTTAKITSV
STGNLCTEEQ	TPPPRPEAYP	IPTQTYTREY	FTFPASKSQD	RMAPPQNQWP
NYEEKPHMHT	DSNHSSIAIQ	RVTRSQEELR	EDKAYQLERH	RIEAAMDRKS
DSDMWINQSS	SLDSSTSSQE	HLNHSSKSVT	PASTLTKSGP	GRWKTPAAIP
ATPVAVSQPI	RTDLPPPPPP	PPVHYAGDFD	GMSMDLPLPP	PPSANQIGLP
SAQVAAAERR	KREEHQRWYE	KEKARLEEER	ERKRREQERK	LGQMRTQSLN
PAPFSPLTAQ	QMKPEKPSTL	QRPQETVIRE	LQPQQQPRTI	ERRDLQYITV
SKEELSSGDS	LSPDPWKRDA	KEKLEKQQQM	HIVDMLSKEI	QELQSKPDRS
AEESDRLRKL	MLEWQFQKRL	QESKQKDEDD	EEEEDDDVDT	MLIMQRLEAE
RRARLQDEER	RRQQQLEEMR	KREAEDRARQ	EEERRRQEEE	RTKRDAEEKR
RQEEGYYSRL	EAERRRQHDE	AARRLLEPEA	PGLCRPPLPR	DYEPPSPSPA
PGAPPPPPQR	NASYLKTQVL	SPDSLFTAKF	VAYNEEEEEE	DCSLAGPNSY
PGSTGAAVGA	HDACRDAKEK	RSKSQDADSP	GSSGAPENLT	FKERQRLFSQ
GQDVSNKVKA	SRKLTELENE	LNTK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинних контактах.

Література

Takai Y., Nakanishi H. (2003). Nectin and afadin: novel organizers of intercellular junctions.. J. Cell Sci. 116: 17 — 27. PubMed DOI:10.1242/jcs.00167

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7137 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P55196 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7137 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P55196 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.