ALCAM

ALCAM (англ. Activated leukocyte cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 65 102[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MESKGASSCRLLFCLLISATVFRPGLGWYTVNSAYGDTIIIPCRLDVPQN
LMFGKWKYEKPDGSPVFIAFRSSTKKSVQYDDVPEYKDRLNLSENYTLSI
SNARISDEKRFVCMLVTEDNVFEAPTIVKVFKQPSKPEIVSKALFLETEQ
LKKLGDCISEDSYPDGNITWYRNGKVLHPLEGAVVIIFKKEMDPVTQLYT
MTSTLEYKTTKADIQMPFTCSVTYYGPSGQKTIHSEQAVFDIYYPTEQVT
IQVLPPKNAIKEGDNITLKCLGNGNPPPEEFLFYLPGQPEGIRSSNTYTL
TDVRRNATGDYKCSLIDKKSMIASTAITVHYLDLSLNPSGEVTRQIGDAL
PVSCTISASRNATVVWMKDNIRLRSSPSFSSLHYQDAGNYVCETALQEVE
GLKKRESLTLIVEGKPQIKMTKKTDPSGLSKTIICHVEGFPKPAIQWTIT
GSGSVINQTEESPYINGRYYSKIIISPEENVTLTCTAENQLERTVNSLNV
SAISIPEHDEADEISDENREKVNDQAKLIVGIVVGLLLAALVAGVVYWLY
MKKSKTASKHVNKDLGNMEENKKLEENNHKTEA
ALCAM
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ALCAM, CD166, MEMD, activated leukocyte cell adhesion molecule
Зовнішні ІД OMIM: 601662 MGI: 1313266 HomoloGene: 1229 GeneCards: ALCAM
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
214
11658
Ensembl
ENSG00000170017
ENSMUSG00000022636
UniProt
Q13740
Q61490
RefSeq (мРНК)
NM_001627
NM_001243280
NM_001243281
NM_001243283
NM_009655
NM_001331110
RefSeq (білок)
NP_001230209
NP_001230210
NP_001230212
NP_001618
NP_001318039
NP_033785
Локус (UCSC) Хр. 3: 105.37 – 105.58 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

  • Ikeda K., Quertermous T. (2004). Molecular isolation and characterization of a soluble isoform of activated leukocyte cell adhesion molecule that modulates endothelial cell function.. J. Biol. Chem. 279: 55315 — 55323. PubMed DOI:10.1074/jbc.M407776200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Skonier J.E., Bowen M.A., Emswiler J., Aruffo A., Bajorath J. (1996). Recognition of diverse proteins by members of the immunoglobulin superfamily: delineation of the receptor binding site in the human CD6 ligand ALCAM.. Biochemistry 35: 12287 — 12291. PubMed DOI:10.1021/bi961038k
  • Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry.. Nat. Biotechnol. 21: 660 — 666. PubMed DOI:10.1038/nbt827
  • Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166.. Eur. J. Immunol. 34: 930 — 940. PubMed DOI:10.1002/eji.200424856
  • Bajorath J., Bowen M.A., Aruffo A. (1995). Molecular model of the N-terminal receptor-binding domain of the human CD6 ligand ALCAM.. Protein Sci. 4: 1644 — 1647. PubMed DOI:10.1002/pro.5560040822

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:400 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, Q13740 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.