AMY1A

AMY1A
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1C8Q, 1JXJ, 1JXK, 1MFU, 1MFV, 1NM9, 1Q4N, 1SMD, 1XV8, 1Z32, 3BLK, 3BLP, 3DHP
Ідентифікатори
Символи	AMY1A, AMY1, amylase, alpha 1A (salivary), amylase alpha 1A (salivary), amylase alpha 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 104700 HomoloGene: 133998 GeneCards: AMY1A
шифр КФ	3.2.1.1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • alpha-amylase activity; • hydrolase activity; • каталітична активність; • зв'язування з іоном металу; • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds; • cation binding; • alpha-amylase activity (releasing maltohexaose);
Клітинна компонента	• extracellular region; • Екзосома; • extracellular space;
Біологічний процес	• травлення; • Обмін речовин; • carbohydrate metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	276
	н/д
	ENSG00000237763
	н/д
	P04745
	н/д
	NM_004038; NM_001008221
	н/д
	NP_001008220; NP_001333709; NP_001008222; NP_004029; NP_001008219
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

AMY1A (англ. Amylase, alpha 1C (salivary)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 511 амінокислот, а молекулярна маса — 57 768[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKLFWLLFTI	GFCWAQYSSN	TQQGRTSIVH	LFEWRWVDIA	LECERYLAPK
GFGGVQVSPP	NENVAIHNPF	RPWWERYQPV	SYKLCTRSGN	EDEFRNMVTR
CNNVGVRIYV	DAVINHMCGN	AVSAGTSSTC	GSYFNPGSRD	FPAVPYSGWD
FNDGKCKTGS	GDIENYNDAT	QVRDCRLSGL	LDLALGKDYV	RSKIAEYMNH
LIDIGVAGFR	IDASKHMWPG	DIKAILDKLH	NLNSNWFPEG	SKPFIYQEVI
DLGGEPIKSS	DYFGNGRVTE	FKYGAKLGTV	IRKWNGEKMS	YLKNWGEGWG
FMPSDRALVF	VDNHDNQRGH	GAGGASILTF	WDARLYKMAV	GFMLAHPYGF
TRVMSSYRWP	RYFENGKDVN	DWVGPPNDNG	VTKEVTINPD	TTCGNDWVCE
HRWRQIRNMV	NFRNVVDGQP	FTNWYDNGSN	QVAFGRGNRG	FIVFNNDDWT
FSLTLQTGLP	AGTYCDVISG	DKINGNCTGI	KIYVSDDGKA	HFSISNSAED
PFIAIHAESK	L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, глікозидаз. Задіяний у такому біологічному процесі як вуглеводний обмін. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, хлоридом. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Gumucio D.L., Wiebauer K., Caldwell R.M., Samuelson L.C., Meisler M.H. (1988). Concerted evolution of human amylase genes.. Mol. Cell. Biol. 8: 1197 — 1205. PubMed DOI:10.1128/MCB.8.3.1197
Bank R.A., Hettema E.H., Arwert F., Amerongen A.V., Pronk J.C. (1991). Electrophoretic characterization of posttranslational modifications of human parotid salivary alpha-amylase.. Electrophoresis 12: 74 — 79. PubMed DOI:10.1002/elps.1150120114
Ramasubbu N., Paloth V., Luo Y., Brayer G.D., Levine M.J. (1996). Structure of human salivary alpha-amylase at 1.6-A resolution: implications for its role in the oral cavity.. Acta Crystallogr. D 52: 435 — 446. PubMed DOI:10.1107/S0907444995014119
Ramasubbu N., Ragunath C., Mishra P.J. (2003). Probing the role of a mobile loop in substrate binding and enzyme activity of human salivary amylase.. J. Mol. Biol. 325: 1061 — 1076. PubMed DOI:10.1016/S0022-2836(02)01326-8
Handy D.E., Larsen S.H., Karn R.C., Hodes M.E. (1987). Identification of a human salivary amylase gene. Partial sequence of genomic DNA suggests a mode of regulation different from that of mouse, Amy1.. Mol. Biol. Med. 4: 145 — 155. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:474 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P04745 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:474 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P04745 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.