APOBEC2

APOBEC2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2NYT
Ідентифікатори
Символи	APOBEC2, ARCD1, ARP1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604797 MGI: 1343178 HomoloGene: 4941 GeneCards: APOBEC2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • zinc ion binding; • каталітична активність; • hydrolase activity; • зв'язування з іоном металу; • RNA binding; • cytidine deaminase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• DNA demethylation; • mRNA processing; • mRNA modification; • cytidine deamination; • cytidine to uridine editing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10930
	11811
	ENSG00000124701
	ENSMUSG00000040694
	Q9Y235
	Q9WV35
	NM_006789
	NM_009694
	NP_006780
	NP_033824
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

APOBEC2 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 25 703[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQKEEAAVA	TEAASQNGED	LENLDDPEKL	KELIELPPFE	IVTGERLPAN
FFKFQFRNVE	YSSGRNKTFL	CYVVEAQGKG	GQVQASRGYL	EDEHAAAHAE
EAFFNTILPA	FDPALRYNVT	WYVSSSPCAA	CADRIIKTLS	KTKNLRLLIL
VGRLFMWEEP	EIQAALKKLK	EAGCKLRIMK	PQDFEYVWQN	FVEQEEGESK
AFQPWEDIQE	NFLYYEEKLA	DILK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain.. Cell 145: 423 — 434. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
Prochnow C., Bransteitter R., Klein M.G., Goodman M.F., Chen X.S. (2007). The APOBEC-2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID.. Nature 445: 447 — 451. PubMed DOI:10.1038/nature05492

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:605 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, Q9Y235 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:605 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y235 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.