ATG7

ATG7
Ідентифікатори
Символи	ATG7, APG7-LIKE, APG7L, GSA7, autophagy related 7, SCAR31
Зовнішні ІД	OMIM: 608760 MGI: 1921494 HomoloGene: 4662 GeneCards: ATG7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • transcription factor binding; • ubiquitin activating enzyme activity; • GO:0001948 protein binding; • ubiquitin-like modifier activating enzyme activity; • Atg12 activating enzyme activity; • Atg8 activating enzyme activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • GO:0035085 Аксонема; • extracellular region; • Аксон; • secretory granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen; • гіалоплазма; • phagophore assembly site;
Біологічний процес	• positive regulation of protein catabolic process; • cellular response to hyperoxia; • cellular response to starvation; • membrane fusion; • cellular protein modification process; • defense response to virus; • positive regulation of protein modification process; • positive regulation of apoptotic process; • protein transport; • protein lipidation; • suppression by virus of host autophagy; • Убіквітин-залежний протеоліз; • Автофагія; • Старіння людини; • response to glucose; • macroautophagy; • response to nutrient levels; • neutrophil degranulation; • negative regulation of cell death; • cellular response to morphine; • negative regulation of mitochondrial DNA replication; • regulation of neuron death; • response to fluoride; • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death; • autophagy of mitochondrion; • autophagosome assembly; • C-terminal protein lipidation; • cellular response to nitrogen starvation; • piecemeal microautophagy of the nucleus; • late nucleophagy; • positive regulation of autophagy; • regulation of circadian rhythm; • chaperone-mediated autophagy; • protein modification by small protein conjugation; • ритмічний процес;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10533
	74244
	ENSG00000197548
	ENSMUSG00000030314
	O95352
	Q9D906
NM_001136031; NM_001144912; NM_006395; NM_001349232; NM_001349233;
	NM_001349234; NM_001349235; NM_001349236; NM_001349237; NM_001349238
	NM_001253717; NM_001253718; NM_028835; NM_001379130
NP_001129503; NP_001138384; NP_006386; NP_001336161; NP_001336162;
	NP_001336163; NP_001336164; NP_001336165; NP_001336166; NP_001336167
	NP_001240646; NP_001240647; NP_083111; NP_001366059
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATG7 (англ. Autophagy related 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 77 960[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAATGDPGL	SKLQFAPFSS	ALDVGFWHEL	TQKKLNEYRL	DEAPKDIKGY
YYNGDSAGLP	ARLTLEFSAF	DMSAPTPARC	CPAIGTLYNT	NTLESFKTAD
KKLLLEQAAN	EIWESIKSGT	ALENPVLLNK	FLLLTFADLK	KYHFYYWFCY
PALCLPESLP	LIQGPVGLDQ	RFSLKQIEAL	ECAYDNLCQT	EGVTALPYFL
IKYDENMVLV	SLLKHYSDFF	QGQRTKITIG	VYDPCNLAQY	PGWPLRNFLV
LAAHRWSSSF	QSVEVVCFRD	RTMQGARDVA	HSIIFEVKLP	EMAFSPDCPK
AVGWEKNQKG	GMGPRMVNLS	ECMDPKRLAE	SSVDLNLKLM	CWRLVPTLDL
DKVVSVKCLL	LGAGTLGCNV	ARTLMGWGVR	HITFVDNAKI	SYSNPVRQPL
YEFEDCLGGG	KPKALAAADR	LQKIFPGVNA	RGFNMSIPMP	GHPVNFSSVT
LEQARRDVEQ	LEQLIESHDV	VFLLMDTRES	RWLPAVIAAS	KRKLVINAAL
GFDTFVVMRH	GLKKPKQQGA	GDLCPNHPVA	SADLLGSSLF	ANIPGYKLGC
YFCNDVVAPG	DSTRDRTLDQ	QCTVSRPGLA	VIAGALAVEL	MVSVLQHPEG
GYAIASSSDD	RMNEPPTSLG	LVPHQIRGFL	SRFDNVLPVS	LAFDKCTACS
SKVLDQYERE	GFNFLAKVFN	SSHSFLEDLT	GLTLLHQETQ	AAEIWDMSDD
ETI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Yuan W., Stromhaug P.E., Dunn W.A. Jr. (1999). Glucose-induced autophagy of peroxisomes in Pichia pastoris requires a unique E1-like protein.. Mol. Biol. Cell 10: 1353 — 1366. PubMed DOI:10.1091/mbc.10.5.1353
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3.. J. Biol. Chem. 276: 1701 — 1706. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000752200
Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p.. J. Biol. Chem. 277: 13739 — 13744. PubMed DOI:10.1074/jbc.M200385200
Sou Y.S., Tanida I., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2006). Phosphatidylserine in addition to phosphatidylethanolamine is an in vitro target of the mammalian Atg8 modifiers, LC3, GABARAP, and GATE-16.. J. Biol. Chem. 281: 3017 — 3024. PubMed DOI:10.1074/jbc.M505888200
Lee I.H., Finkel T. (2009). Regulation of autophagy by the p300 acetyltransferase.. J. Biol. Chem. 284: 6322 — 6328. PubMed DOI:10.1074/jbc.M807135200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16935 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, O95352 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16935 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O95352 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.