CAMP

CAMP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4EYC, 2FBS, 2FBU, 2FCG, 2K6O
Ідентифікатори
Символи	CAMP, IPR001894, CAP-18, CAP18, CRAMP, HSD26, gene FALL39, gene LL37, FALL39, LL37, FALL-39, cathelicidin antimicrobial peptide, Cathelicidins
Зовнішні ІД	OMIM: 600474 MGI: 108443 HomoloGene: 110678 GeneCards: CAMP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipopolysaccharide binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • specific granule; • Екзосома; • extracellular space; • внутрішньоклітинний; • specific granule lumen; • tertiary granule lumen;
Біологічний процес	• defense response; • innate immune response in mucosa; • Вроджений імунітет; • killing by host of symbiont cells; • chronic inflammatory response; • defense response to bacterium; • antimicrobial humoral response; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • cytolysis by host of symbiont cells; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	820
	12796
	ENSG00000164047
	ENSMUSG00000038357
	P49913
	P51437
	NM_004345
	NM_009921
	NP_004336
	NP_034051
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CAMP (англ. Cathelicidin antimicrobial peptide) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 170 амінокислот, а молекулярна маса — 19 301[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKTQRDGHSL	GRWSLVLLLL	GLVMPLAIIA	QVLSYKEAVL	RAIDGINQRS
SDANLYRLLD	LDPRPTMDGD	PDTPKPVSFT	VKETVCPRTT	QQSPEDCDFK
KDGLVKRCMG	TVTLNQARGS	FDISCDKDNK	RFALLGDFFR	KSKEKIGKEF
KRIVQRIKDF	LRNLVPRTES

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Секретований назовні.

Література

Cowland J.B., Johnsen A.H., Borregaard N. (1995). hCAP-18, a cathelin/pro-bactenecin-like protein of human neutrophil specific granules.. FEBS Lett. 368: 173 — 176. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(95)00634-L
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Li X., Li Y., Han H., Miller D.W., Wang G. (2006). Solution structures of human LL-37 fragments and NMR-based identification of a minimal membrane-targeting antimicrobial and anticancer region.. J. Am. Chem. Soc. 128: 5776 — 5785. PubMed DOI:10.1021/ja0584875
Wang G. (2008). Structures of human host defense cathelicidin LL-37 and its smallest antimicrobial peptide KR-12 in lipid micelles.. J. Biol. Chem. 283: 32637 — 32643. PubMed DOI:10.1074/jbc.M805533200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1472 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P49913 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1472 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P49913 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.