CAST

CAST
Ідентифікатори
Символи	CAST, BS-17, PLACK, calpastatin
Зовнішні ІД	OMIM: 114090 MGI: 1098236 HomoloGene: 7658 GeneCards: CAST
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity; • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity; • GO:0001948 protein binding; • endopeptidase inhibitor activity; • RNA binding; • cadherin binding; • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase inhibitor activity; • protease binding;
Клітинна компонента	• ендоплазматичний ретикулум; • мембрана; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of peptidase activity; • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process; • inhibition of cysteine-type endopeptidase activity; • presynaptic active zone organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	831
	12380
	ENSG00000153113
	ENSMUSG00000021585
	P20810
	P51125
NM_001042440; NM_001042441; NM_001042442; NM_001042443; NM_001042444;
	NM_001042445; NM_001042446; NM_001190442; NM_001284212; NM_001284213; NM_001750; NM_173060; NM_173061; NM_173062; NM_173063; NM_001330626; NM_001330627; NM_001330628; NM_001330629; NM_001330630; NM_001330631; NM_001330632; NM_001330633; NM_001330634; NM_001375317
NM_001301153; NM_001301155; NM_001301156; NM_001301157; NM_001301158;
	NM_001301160; NM_001301181; NM_009817
NP_001035905; NP_001035906; NP_001035907; NP_001035908; NP_001035909;
	NP_001035910; NP_001035911; NP_001177371; NP_001271141; NP_001271142; NP_001317555; NP_001317556; NP_001317557; NP_001317558; NP_001317559; NP_001317560; NP_001317561; NP_001317562; NP_001317563; NP_001741; NP_775083; NP_001362246
NP_001288082; NP_001288084; NP_001288085; NP_001288086; NP_001288087;
	NP_001288089; NP_001288110; NP_033947
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CAST (англ. Calpastatin) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 76 573[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNPTETKAIP	VSQQMEGPHL	PNKKKHKKQA	VKTEPEKKSQ	STKLSVVHEK
KSQEGKPKEH	TEPKSLPKQA	SDTGSNDAHN	KKAVSRSAEQ	QPSEKSTEPK
TKPQDMISAG	GESVAGITAI	SGKPGDKKKE	KKSLTPAVPV	ESKPDKPSGK
SGMDAALDDL	IDTLGGPEET	EEENTTYTGP	EVSDPMSSTY	IEELGKREVT
IPPKYRELLA	KKEGITGPPA	DSSKPIGPDD	AIDALSSDFT	CGSPTAAGKK
TEKEESTEVL	KAQSAGTVRS	AAPPQEKKRK	VEKDTMSDQA	LEALSASLGT
RQAEPELDLR	SIKEVDEAKA	KEEKLEKCGE	DDETIPSEYR	LKPATDKDGK
PLLPEPEEKP	KPRSESELID	ELSEDFDRSE	CKEKPSKPTE	KTEESKAAAP
APVSEAVCRT	SMCSIQSAPP	EPATLKGTVP	DDAVEALADS	LGKKEADPED
GKPVMDKVKE	KAKEEDREKL	GEKEETIPPD	YRLEEVKDKD	GKPLLPKESK
EQLPPMSEDF	LLDALSEDFS	GPQNASSLKF	EDAKLAAAIS	EVVSQTPAST
TQAGAPPRDT	SQSDKDLDDA	LDKLSDSLGQ	RQPDPDENKP	MEDKVKEKAK
AEHRDKLGER	DDTIPPEYRH	LLDDNGQDKP	VKPPTKKSED	SKKPADDQDP
IDALSGDLDS	CPSTTETSQN	TAKDKCKKAA	SSSKAPKNGG	KAKDSAKTTE
ETSKPKDD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібітор тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Despres N., Talbot G., Plouffe B., Boire G., Menard H.A. (1995). Detection and expression of a cDNA clone that encodes a polypeptide containing two inhibitory domains of human calpastatin and its recognition by rheumatoid arthritis sera.. J. Clin. Invest. 95: 1891 — 1896. PubMed DOI:10.1172/JCI117870
Wang L.F., Wei S.G., Miao S.Y., Liu Q.Y., Koide S.S. (1994). Calpastatin gene in human testis.. Biochem. Mol. Biol. Int. 33: 245 — 252. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1515 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P20810 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1515 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P20810 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.