CD47

CD47
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JJS, 2JJT, 2VSC, 4CMM, 4KJY, 5IWL
Ідентифікатори
Символи	CD47, IAP, MER6, OA3, CD47 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 601028 MGI: 96617 HomoloGene: 1346 GeneCards: CD47
Онтологія гена
Молекулярна функція	• thrombospondin receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion; • cell-cell adhesion mediator activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • specific granule membrane; • tertiary granule membrane; • Екзосома; • cell surface;
Біологічний процес	• integrin-mediated signaling pathway; • positive regulation of phagocytosis; • адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • positive regulation of inflammatory response; • positive regulation of T cell activation; • response to bacterium; • leukocyte migration; • positive regulation of cell population proliferation; • Опсонізація; • positive regulation of cell-cell adhesion; • neutrophil degranulation; • cell migration; • regulation of interferon-gamma production; • regulation of interleukin-10 production; • regulation of interleukin-12 production; • regulation of interleukin-6 production; • regulation of tumor necrosis factor production; • heterotypic cell-cell adhesion; • monocyte extravasation; • regulation of nitric oxide biosynthetic process; • positive regulation of stress fiber assembly; • cellular response to interferon-gamma; • cellular response to interleukin-1; • cellular response to interleukin-12; • cell-cell adhesion; • negative regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	961
	16423
	ENSG00000196776
	ENSMUSG00000055447
	Q08722
	Q61735
	NM_001025079; NM_001025080; NM_001777; NM_198793; NM_001382306
	NM_010581; NM_001368415; NM_001368416; NM_001368417; NM_001368418
	NP_001768; NP_942088; NP_001369235
	NP_034711; NP_001355344; NP_001355345; NP_001355346; NP_001355347
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD47 (англ. CD47 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 323 амінокислот, а молекулярна маса — 35 214[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWPLVAALLL	GSACCGSAQL	LFNKTKSVEF	TFCNDTVVIP	CFVTNMEAQN
TTEVYVKWKF	KGRDIYTFDG	ALNKSTVPTD	FSSAKIEVSQ	LLKGDASLKM
DKSDAVSHTG	NYTCEVTELT	REGETIIELK	YRVVSWFSPN	ENILIVIFPI
FAILLFWGQF	GIKTLKYRSG	GMDEKTIALL	VAGLVITVIV	IVGAILFVPG
EYSLKNATGL	GLIVTSTGIL	ILLHYYVFST	AIGLTSFVIA	ILVIQVIAYI
LAVVGLSLCI	AACIPMHGPL	LISGLSILAL	AQLLGLVYMK	FVASNQKTIQ
PPRKAVEEPL	NAFKESKGMM	NDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Lindberg F.P., Gresham H.D., Schwarz E., Brown E.J. (1993). Molecular cloning of integrin-associated protein: an immunoglobulin family member with multiple membrane spanning domains implicated in alpha-v beta-3-dependent ligand binding.. J. Cell Biol. 123: 485 — 496. PubMed DOI:10.1083/jcb.123.2.485
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Mawby W.J., Holmes C.H., Anstee D.J., Spring F.A., Tanner M.J.A. (1994). Isolation and characterization of CD47 glycoprotein: a multispanning membrane protein which is the same as integrin-associated protein (IAP) and the ovarian tumour marker OA3.. Biochem. J. 304: 525 — 530. PubMed DOI:10.1042/bj3040525
Wu A.-L., Wang J., Zheleznyak A., Brown E.J. (1999). Ubiquitin-related proteins regulate interaction of vimentin intermediate filaments with the plasma membrane.. Mol. Cell 4: 619 — 625. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(00)80212-9
Rebres R.A., Vaz L.E., Green J.M., Brown E.J. (2001). Normal ligand binding and signaling by CD47 (integrin-associated protein) requires a long range disulfide bond between the extracellular and membrane-spanning domains.. J. Biol. Chem. 276: 34607 — 34616. PubMed DOI:10.1074/jbc.M106107200
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance.. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PubMed DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1682 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q08722 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1682 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q08722 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.