CDH5

CDH5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KOH
Ідентифікатори
Символи	CDH5, 7B4, CD144, VE-cadherin, cadherin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601120 MGI: 105057 HomoloGene: 1359 GeneCards: CDH5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • beta-catenin binding; • transmembrane transporter binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • protein phosphatase binding; • signaling receptor binding; • cytoskeletal protein binding; • protein homodimerization activity; • cadherin binding; • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • bicellular tight junction; • Адгезивні контакти; • cell surface; • Міжклітинні контакти; • external side of plasma membrane; • cell periphery; • клітинна мембрана; • catenin complex;
Біологічний процес	• positive regulation of establishment of endothelial barrier; • Адгезія клітин; • cell-cell junction assembly; • adherens junction organization; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • regulation of establishment of cell polarity; • negative regulation of cell population proliferation; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • blood vessel maturation; • cell-cell adhesion; • negative regulation of inflammatory response; • positive regulation of angiogenesis; • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • cell morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1003
	12562
	ENSG00000179776
	ENSMUSG00000031871
	P33151
	P55284
	NM_001114117; NM_001795
	NM_009868
	NP_001786
	NP_033998
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDH5 (англ. Cadherin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 87 528[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRLMMLLAT	SGACLGLLAV	AAVAAAGANP	AQRDTHSLLP	THRRQKRDWI
WNQMHIDEEK	NTSLPHHVGK	IKSSVSRKNA	KYLLKGEYVG	KVFRVDAETG
DVFAIERLDR	ENISEYHLTA	VIVDKDTGEN	LETPSSFTIK	VHDVNDNWPV
FTHRLFNASV	PESSAVGTSV	ISVTAVDADD	PTVGDHASVM	YQILKGKEYF
AIDNSGRIIT	ITKSLDREKQ	ARYEIVVEAR	DAQGLRGDSG	TATVLVTLQD
INDNFPFFTQ	TKYTFVVPED	TRVGTSVGSL	FVEDPDEPQN	RMTKYSILRG
DYQDAFTIET	NPAHNEGIIK	PMKPLDYEYI	QQYSFIVEAT	DPTIDLRYMS
PPAGNRAQVI	INITDVDEPP	IFQQPFYHFQ	LKENQKKPLI	GTVLAMDPDA
ARHSIGYSIR	RTSDKGQFFR	VTKKGDIYNE	KELDREVYPW	YNLTVEAKEL
DSTGTPTGKE	SIVQVHIEVL	DENDNAPEFA	KPYQPKVCEN	AVHGQLVLQI
SAIDKDITPR	NVKFKFILNT	ENNFTLTDNH	DNTANITVKY	GQFDREHTKV
HFLPVVISDN	GMPSRTGTST	LTVAVCKCNE	QGEFTFCEDM	AAQVGVSIQA
VVAILLCILT	ITVITLLIFL	RRRLRKQARA	HGKSVPEIHE	QLVTYDEEGG
GEMDTTSYDV	SVLNSVRRGG	AKPPRPALDA	RPSLYAQVQK	PPRHAPGAHG
GPGEMAAMIE	VKKDEADHDG	DGPPYDTLHI	YGYEGSESIA	ESLSSLGTDS
SDSDVDYDFL	NDWGPRFKML	AELYGSDPRE	ELLY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins.. Biochem. J. 349: 159 — 167. PubMed DOI:10.1042/0264-6021:3490159
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Ali J., Liao F., Martens E., Muller W.A. (1997). Vascular endothelial cadherin (VE-cadherin): cloning and role in endothelial cell-cell adhesion.. Microcirculation 4: 267 — 277. PubMed
Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue.. Cell Regul. 2: 261 — 270. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P33151 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P33151 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.