CLDN1

CLDN1
Ідентифікатори
Символи	CLDN1, CLD1, ILVASC, SEMP1, claudin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603718 MGI: 1276109 HomoloGene: 9620 GeneCards: CLDN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • structural molecule activity; • identical protein binding; • virus receptor activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • integral component of membrane; • Міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • apical plasma membrane; • lateral plasma membrane; • bicellular tight junction; • цитоплазма; • basolateral plasma membrane;
Біологічний процес	• viral entry into host cell; • cell-cell junction organization; • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules; • GO:0022415 viral process; • protein homooligomerization; • protein heterooligomerization; • establishment of skin barrier; • bicellular tight junction assembly; • Старіння людини; • establishment of blood-nerve barrier; • response to toxic substance; • response to lipopolysaccharide; • hyperosmotic salinity response; • response to ethanol; • xenobiotic transport across blood-nerve barrier; • response to interleukin-18; • cellular response to lead ion; • cellular response to interferon-gamma; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to dexamethasone; • cellular response to transforming growth factor beta stimulus; • establishment of endothelial intestinal barrier; • liver regeneration; • positive regulation of bicellular tight junction assembly; • cellular response to butyrate;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9076
	12737
	ENSG00000163347
	ENSMUSG00000022512
	O95832
	O88551
	NM_021101
	NM_016674
	NP_066924
	NP_057883
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLDN1 (англ. Claudin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 22 744[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANAGLQLLG	FILAFLGWIG	AIVSTALPQW	RIYSYAGDNI	VTAQAMYEGL
WMSCVSQSTG	QIQCKVFDSL	LNLSSTLQAT	RALMVVGILL	GVIAIFVATV
GMKCMKCLED	DEVQKMRMAV	IGGAIFLLAG	LAILVATAWY	GNRIVQEFYD
PMTPVNARYE	FGQALFTGWA	AASLCLLGGA	LLCCSCPRKT	TSYPTPRPYP
KPAPSSGKDY	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

Kraemer F., White K., Kubbies M., Swisshelm K.L., Weber B.H.F. (2000). Genomic organization of claudin-1 and its assessment in hereditary and sporadic breast cancer.. Hum. Genet. 107: 249 — 256. PubMed DOI:10.1007/s004390000375
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Che P., Tang H., Li Q. (2013). The interaction between claudin-1 and dengue viral prM/M protein for its entry.. Virology 446: 303 — 313. PubMed DOI:10.1016/j.virol.2013.08.009

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2032 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, O95832 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2032 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O95832 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.