CLDN18

CLDN18
Ідентифікатори
Символи	CLDN18, SFTA5, SFTPJ, claudin 18
Зовнішні ІД	OMIM: 609210 MGI: 1929209 HomoloGene: 9489 GeneCards: CLDN18
Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • мембрана; • bicellular tight junction;
Біологічний процес	• negative regulation of protein localization to nucleus; • TNFSF11-mediated signaling pathway; • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules; • digestive tract development; • negative regulation of osteoclast development; • negative regulation of bone resorption; • response to ethanol;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	51208
	56492
	ENSG00000066405
	ENSMUSG00000032473
	P56856
	P56857
	NM_016369; NM_001002026
	NM_001194921; NM_001194922; NM_001194923; NM_019815
	NP_001002026; NP_057453
	NP_001181850; NP_001181851; NP_001181852; NP_062789
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLDN18 (англ. Claudin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 27 856[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTTTCQVVA	FLLSILGLAG	CIAATGMDMW	STQDLYDNPV	TSVFQYEGLW
RSCVRQSSGF	TECRPYFTIL	GLPAMLQAVR	ALMIVGIVLG	AIGLLVSIFA
LKCIRIGSME	DSAKANMTLT	SGIMFIVSGL	CAIAGVSVFA	NMLVTNFWMS
TANMYTGMGG	MVQTVQTRYT	FGAALFVGWV	AGGLTLIGGV	MMCIACRGLA
PEETNYKAVS	YHASGHSVAY	KPGGFKASTG	FGSNTKNKKI	YDGGARTEDE
VQSYPSKHDY	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2039 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P56856 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2039 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P56856 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.