COL11A1
COL11A1 (англ. Collagen type XI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 806 амінокислот, а молекулярна маса — 181 065[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEPWSSRWKT | KRWLWDFTVT | TLALTFLFQA | REVRGAAPVD | VLKALDFHNS | ||||
PEGISKTTGF | CTNRKNSKGS | DTAYRVSKQA | QLSAPTKQLF | PGGTFPEDFS | ||||
ILFTVKPKKG | IQSFLLSIYN | EHGIQQIGVE | VGRSPVFLFE | DHTGKPAPED | ||||
YPLFRTVNIA | DGKWHRVAIS | VEKKTVTMIV | DCKKKTTKPL | DRSERAIVDT | ||||
NGITVFGTRI | LDEEVFEGDI | QQFLITGDPK | AAYDYCEHYS | PDCDSSAPKA | ||||
AQAQEPQIDE | YAPEDIIEYD | YEYGEAEYKE | AESVTEGPTV | TEETIAQTEA | ||||
NIVDDFQEYN | YGTMESYQTE | APRHVSGTNE | PNPVEEIFTE | EYLTGEDYDS | ||||
QRKNSEDTLY | ENKEIDGRDS | DLLVDGDLGE | YDFYEYKEYE | DKPTSPPNEE | ||||
FGPGVPAETD | ITETSINGHG | AYGEKGQKGE | PAVVEPGMLV | EGPPGPAGPA | ||||
GIMGPPGLQG | PTGPPGDPGD | RGPPGRPGLP | GADGLPGPPG | TMLMLPFRYG | ||||
GDGSKGPTIS | AQEAQAQAIL | QQARIALRGP | PGPMGLTGRP | GPVGGPGSSG | ||||
AKGESGDPGP | QGPRGVQGPP | GPTGKPGKRG | RPGADGGRGM | PGEPGAKGDR | ||||
GFDGLPGLPG | DKGHRGERGP | QGPPGPPGDD | GMRGEDGEIG | PRGLPGEAGP | ||||
RGLLGPRGTP | GAPGQPGMAG | VDGPPGPKGN | MGPQGEPGPP | GQQGNPGPQG | ||||
LPGPQGPIGP | PGEKGPQGKP | GLAGLPGADG | PPGHPGKEGQ | SGEKGALGPP | ||||
GPQGPIGYPG | PRGVKGADGV | RGLKGSKGEK | GEDGFPGFKG | DMGLKGDRGE | ||||
VGQIGPRGED | GPEGPKGRAG | PTGDPGPSGQ | AGEKGKLGVP | GLPGYPGRQG | ||||
PKGSTGFPGF | PGANGEKGAR | GVAGKPGPRG | QRGPTGPRGS | RGARGPTGKP | ||||
GPKGTSGGDG | PPGPPGERGP | QGPQGPVGFP | GPKGPPGPPG | KDGLPGHPGQ | ||||
RGETGFQGKT | GPPGPGGVVG | PQGPTGETGP | IGERGHPGPP | GPPGEQGLPG | ||||
AAGKEGAKGD | PGPQGISGKD | GPAGLRGFPG | ERGLPGAQGA | PGLKGGEGPQ | ||||
GPPGPVGSPG | ERGSAGTAGP | IGLPGRPGPQ | GPPGPAGEKG | APGEKGPQGP | ||||
AGRDGVQGPV | GLPGPAGPAG | SPGEDGDKGE | IGEPGQKGSK | GDKGENGPPG | ||||
PPGLQGPVGA | PGIAGGDGEP | GPRGQQGMFG | QKGDEGARGF | PGPPGPIGLQ | ||||
GLPGPPGEKG | ENGDVGPMGP | PGPPGPRGPQ | GPNGADGPQG | PPGSVGSVGG | ||||
VGEKGEPGEA | GNPGPPGEAG | VGGPKGERGE | KGEAGPPGAA | GPPGAKGPPG | ||||
DDGPKGNPGP | VGFPGDPGPP | GEPGPAGQDG | VGGDKGEDGD | PGQPGPPGPS | ||||
GEAGPPGPPG | KRGPPGAAGA | EGRQGEKGAK | GEAGAEGPPG | KTGPVGPQGP | ||||
AGKPGPEGLR | GIPGPVGEQG | LPGAAGQDGP | PGPMGPPGLP | GLKGDPGSKG | ||||
EKGHPGLIGL | IGPPGEQGEK | GDRGLPGTQG | SPGAKGDGGI | PGPAGPLGPP | ||||
GPPGLPGPQG | PKGNKGSTGP | AGQKGDSGLP | GPPGSPGPPG | EVIQPLPILS | ||||
SKKTRRHTEG | MQADADDNIL | DYSDGMEEIF | GSLNSLKQDI | EHMKFPMGTQ | ||||
TNPARTCKDL | QLSHPDFPDG | EYWIDPNQGC | SGDSFKVYCN | FTSGGETCIY | ||||
PDKKSEGVRI | SSWPKEKPGS | WFSEFKRGKL | LSYLDVEGNS | INMVQMTFLK | ||||
LLTASARQNF | TYHCHQSAAW | YDVSSGSYDK | ALRFLGSNDE | EMSYDNNPFI | ||||
KTLYDGCASR | KGYEKTVIEI | NTPKIDQVPI | VDVMINDFGD | QNQKFGFEVG | ||||
PVCFLG |
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhidkova N.I., Justice S.K., Mayne R. (1995). Alternative mRNA processing occurs in the variable region of the pro-alpha 1(XI) and pro-alpha 2(XI) collagen chains.. J. Biol. Chem. 270: 9486 — 9493. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.16.9486
- Yoshioka H., Ramirez F. (1990). Pro-alpha 1(XI) collagen. Structure of the amino-terminal propeptide and expression of the gene in tumor cell lines.. J. Biol. Chem. 265: 6423 — 6426. PubMed
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з COL11A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2186 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
- UniProt, P12107 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.