COL4A3

COL4A3
Ідентифікатори
Символи	COL4A3, collagen type IV alpha 3 chain, ATS2, ATS3
Зовнішні ІД	OMIM: 120070 MGI: 104688 HomoloGene: 68033 GeneCards: COL4A3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent; • structural molecule activity; • GO:0001948 protein binding; • metalloendopeptidase inhibitor activity; • integrin binding; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Клітинна компонента	• Колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • Ендоплазматичний ретикулум; • extracellular region; • Базальна мембрана; • collagen type IV trimer; • extracellular space; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• extracellular matrix organization; • sensory perception of sound; • кровообіг; • Адгезія клітин; • endothelial cell apoptotic process; • проліферація; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • negative regulation of cell population proliferation; • cell surface receptor signaling pathway; • negative regulation of endopeptidase activity; • negative regulation of angiogenesis; • glomerular basement membrane development; • collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway; • response to glucose;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1285
	12828
	ENSG00000169031
	ENSMUSG00000079465
	Q01955
	Q9QZS0
NM_000091; NM_031362; NM_031363; NM_031364; NM_031365;
	NM_031366
	NM_007734
	NP_000082
	NP_031760
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL4A3 (англ. Collagen type IV alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 670 амінокислот, а молекулярна маса — 161 813[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSARTAPRPQ	VLLLPLLLVL	LAAAPAASKG	CVCKDKGQCF	CDGAKGEKGE
KGFPGPPGSP	GQKGFTGPEG	LPGPQGPKGF	PGLPGLTGSK	GVRGISGLPG
FSGSPGLPGT	PGNTGPYGLV	GVPGCSGSKG	EQGFPGLPGT	LGYPGIPGAA
GLKGQKGAPA	KEEDIELDAK	GDPGLPGAPG	PQGLPGPPGF	PGPVGPPGPP
GFFGFPGAMG	PRGPKGHMGE	RVIGHKGERG	VKGLTGPPGP	PGTVIVTLTG
PDNRTDLKGE	KGDKGAMGEP	GPPGPSGLPG	ESYGSEKGAP	GDPGLQGKPG
KDGVPGFPGS	EGVKGNRGFP	GLMGEDGIKG	QKGDIGPPGF	RGPTEYYDTY
QEKGDEGTPG	PPGPRGARGP	QGPSGPPGVP	GSPGSSRPGL	RGAPGWPGLK
GSKGERGRPG	KDAMGTPGSP	GCAGSPGLPG	SPGPPGPPGD	IVFRKGPPGD
HGLPGYLGSP	GIPGVDGPKG	EPGLLCTQCP	YIPGPPGLPG	LPGLHGVKGI
PGRQGAAGLK	GSPGSPGNTG	LPGFPGFPGA	QGDPGLKGEK	GETLQPEGQV
GVPGDPGLRG	QPGRKGLDGI	PGTPGVKGLP	GPKGELALSG	EKGDQGPPGD
PGSPGSPGPA	GPAGPPGYGP	QGEPGLQGTQ	GVPGAPGPPG	EAGPRGELSV
STPVPGPPGP	PGPPGHPGPQ	GPPGIPGSLG	KCGDPGLPGP	DGEPGIPGIG
FPGPPGPKGD	QGFPGTKGSL	GCPGKMGEPG	LPGKPGLPGA	KGEPAVAMPG
GPGTPGFPGE	RGNSGEHGEI	GLPGLPGLPG	TPGNEGLDGP	RGDPGQPGPP
GEQGPPGRCI	EGPRGAQGLP	GLNGLKGQQG	RRGKTGPKGD	PGIPGLDRSG
FPGETGSPGI	PGHQGEMGPL	GQRGYPGNPG	ILGPPGEDGV	IGMMGFPGAI
GPPGPPGNPG	TPGQRGSPGI	PGVKGQRGTP	GAKGEQGDKG	NPGPSEISHV
IGDKGEPGLK	GFAGNPGEKG	NRGVPGMPGL	KGLKGLPGPA	GPPGPRGDLG
STGNPGEPGL	RGIPGSMGNM	GMPGSKGKRG	TLGFPGRAGR	PGLPGIHGLQ
GDKGEPGYSE	GTRPGPPGPT	GDPGLPGDMG	KKGEMGQPGP	PGHLGPAGPE
GAPGSPGSPG	LPGKPGPHGD	LGFKGIKGLL	GPPGIRGPPG	LPGFPGSPGP
MGIRGDQGRD	GIPGPAGEKG	ETGLLRAPPG	PRGNPGAQGA	KGDRGAPGFP
GLPGRKGAMG	DAGPRGPTGI	EGFPGPPGLP	GAIIPGQTGN	RGPPGSRGSP
GAPGPPGPPG	SHVIGIKGDK	GSMGHPGPKG	PPGTAGDMGP	PGRLGAPGTP
GLPGPRGDPG	FQGFPGVKGE	KGNPGFLGSI	GPPGPIGPKG	PPGVRGDPGT
LKIISLPGSP	GPPGTPGEPG	MQGEPGPPGP	PGNLGPCGPR	GKPGKDGKPG
TPGPAGEKGN	KGSKGEPGPA	GSDGLPGLKG	KRGDSGSPAT	WTTRGFVFTR
HSQTTAIPSC	PEGTVPLYSG	FSFLFVQGNQ	RAHGQDLGTL	GSCLQRFTTM
PFLFCNVNDV	CNFASRNDYS	YWLSTPALMP	MNMAPITGRA	LEPYISRCTV
CEGPAIAIAV	HSQTTDIPPC	PHGWISLWKG	FSFIMFTSAG	SEGTGQALAS
PGSCLEEFRA	SPFLECHGRG	TCNYYSNSYS	FWLASLNPER	MFRKPIPSTV
KAGELEKIIS	RCQVCMKKRH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

Raya A., Revert F., Navarro S., Saus J. (1999). Characterization of a novel type of serine/threonine kinase that specifically phosphorylates the human goodpasture antigen.. J. Biol. Chem. 274: 12642 — 12649. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.18.12642
Maeshima Y., Colorado P.C., Kalluri R. (2000). Two RGD-independent alpha vbeta 3 integrin binding sites on tumstatin regulate distinct anti-tumor properties.. J. Biol. Chem. 275: 23745 — 23750. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000186200
Nagel M., Nagorka S., Gross O. (2005). Novel COL4A5, COL4A4, and COL4A3 mutations in Alport syndrome.. Hum. Mutat. 26: 60 — 60. PubMed DOI:10.1002/humu.9349
Mariyama M., Leinonen A., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human alpha 3(IV) collagen chain. Coexpression of the alpha 3(IV) and alpha 4(IV) collagen chains in human tissues.. J. Biol. Chem. 269: 23013 — 23017. PubMed
Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1992). Exon/intron structure of the human alpha 3(IV) gene encompassing the Goodpasture antigen (alpha 3(IV)NC1). Identification of a potentially antigenic region at the triple helix/NC1 domain junction.. J. Biol. Chem. 267: 19780 — 19784. PubMed
Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1994). J. Biol. Chem. 269: 17358 — 17358. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2204 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q01955 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2204 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q01955 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.