COL4A4
COL4A4 (англ. Collagen type IV alpha 4 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 690 амінокислот, а молекулярна маса — 164 038[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MWSLHIVLMR | CSFRLTKSLA | TGPWSLILIL | FSVQYVYGSG | KKYIGPCGGR | ||||
| DCSVCHCVPE | KGSRGPPGPP | GPQGPIGPLG | APGPIGLSGE | KGMRGDRGPP | ||||
| GAAGDKGDKG | PTGVPGFPGL | DGIPGHPGPP | GPRGKPGMSG | HNGSRGDPGF | ||||
| PGGRGALGPG | GPLGHPGEKG | EKGNSVFILG | AVKGIQGDRG | DPGLPGLPGS | ||||
| WGAGGPAGPT | GYPGEPGLVG | PPGQPGRPGL | KGNPGVGVKG | QMGDPGEVGQ | ||||
| QGSPGPTLLV | EPPDFCLYKG | EKGIKGIPGM | VGLPGPPGRK | GESGIGAKGE | ||||
| KGIPGFPGPR | GDPGSYGSPG | FPGLKGELGL | VGDPGLFGLI | GPKGDPGNRG | ||||
| HPGPPGVLVT | PPLPLKGPPG | DPGFPGRYGE | TGDVGPPGPP | GLLGRPGEAC | ||||
| AGMIGPPGPQ | GFPGLPGLPG | EAGIPGRPDS | APGKPGKPGS | PGLPGAPGLQ | ||||
| GLPGSSVIYC | SVGNPGPQGI | KGKVGPPGGR | GPKGEKGNEG | LCACEPGPMG | ||||
| PPGPPGLPGR | QGSKGDLGLP | GWLGTKGDPG | PPGAEGPPGL | PGKHGASGPP | ||||
| GNKGAKGDMV | VSRVKGHKGE | RGPDGPPGFP | GQPGSHGRDG | HAGEKGDPGP | ||||
| PGDHEDATPG | GKGFPGPLGP | PGKAGPVGPP | GLGFPGPPGE | RGHPGVPGHP | ||||
| GVRGPDGLKG | QKGDTISCNV | TYPGRHGPPG | FDGPPGPKGF | PGPQGAPGLS | ||||
| GSDGHKGRPG | TPGTAEIPGP | PGFRGDMGDP | GFGGEKGSSP | VGPPGPPGSP | ||||
| GVNGQKGIPG | DPAFGHLGPP | GKRGLSGVPG | IKGPRGDPGC | PGAEGPAGIP | ||||
| GFLGLKGPKG | REGHAGFPGV | PGPPGHSCER | GAPGIPGQPG | LPGYPGSPGA | ||||
| PGGKGQPGDV | GPPGPAGMKG | LPGLPGRPGA | HGPPGLPGIP | GPFGDDGLPG | ||||
| PPGPKGPRGL | PGFPGFPGER | GKPGAEGCPG | AKGEPGEKGM | SGLPGDRGLR | ||||
| GAKGAIGPPG | DEGEMAIISQ | KGTPGEPGPP | GDDGFPGERG | DKGTPGMQGR | ||||
| RGEPGRYGPP | GFHRGEPGEK | GQPGPPGPPG | PPGSTGLRGF | IGFPGLPGDQ | ||||
| GEPGSPGPPG | FSGIDGARGP | KGNKGDPASH | FGPPGPKGEP | GSPGCPGHFG | ||||
| ASGEQGLPGI | QGPRGSPGRP | GPPGSSGPPG | CPGDHGMPGL | RGQPGEMGDP | ||||
| GPRGLQGDPG | IPGPPGIKGP | SGSPGLNGLH | GLKGQKGTKG | ASGLHDVGPP | ||||
| GPVGIPGLKG | ERGDPGSPGI | SPPGPRGKKG | PPGPPGSSGP | PGPAGATGRA | ||||
| PKDIPDPGPP | GDQGPPGPDG | PRGAPGPPGL | PGSVDLLRGE | PGDCGLPGPP | ||||
| GPPGPPGPPG | YKGFPGCDGK | DGQKGPVGFP | GPQGPHGFPG | PPGEKGLPGP | ||||
| PGRKGPTGLP | GPRGEPGPPA | DVDDCPRIPG | LPGAPGMRGP | EGAMGLPGMR | ||||
| GPSGPGCKGE | PGLDGRRGVD | GVPGSPGPPG | RKGDTGEDGY | PGGPGPPGPI | ||||
| GDPGPKGFGP | GYLGGFLLVL | HSQTDQEPTC | PLGMPRLWTG | YSLLYLEGQE | ||||
| KAHNQDLGLA | GSCLPVFSTL | PFAYCNIHQV | CHYAQRNDRS | YWLASAAPLP | ||||
| MMPLSEEAIR | PYVSRCAVCE | APAQAVAVHS | QDQSIPPCPQ | TWRSLWIGYS | ||||
| FLMHTGAGDQ | GGGQALMSPG | SCLEDFRAAP | FLECQGRQGT | CHFFANKYSF | ||||
| WLTTVKADLQ | FSSAPAPDTL | KESQAQRQKI | SRCQVCVKYS |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Sugimoto M., Oohashi T., Yoshioka H., Matsuo N., Ninomiya Y. (1993). cDNA isolation and partial gene structure of the human alpha 4(IV) collagen chain.. FEBS Lett. 330: 122 — 128. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(93)80256-T
- Lemmink H.H., Schroeder C.H., Monnens L.A.H., Smeets H.J.M. (1997). The clinical spectrum of type IV collagen mutations.. Hum. Mutat. 9: 477 — 499. PubMed DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1997)9:6<477::AID-HUMU1>3.3.CO;2-H
- Leinonen A., Mariyama M., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human type IV collagen alpha 4(IV) chain. Comparison with structure and expression of the other alpha (IV) chains.. J. Biol. Chem. 269: 26172 — 26177. PubMed
- Kamagata Y., Mattei M.-G., Ninomiya Y. (1992). Isolation and sequencing of cDNAs and genomic DNAs encoding the alpha 4 chain of basement membrane collagen type IV and assignment of the gene to the distal long arm of human chromosome 2.. J. Biol. Chem. 267: 23753 — 23758. PubMed
- Mariyama M., Leinonen A., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human alpha 3(IV) collagen chain. Coexpression of the alpha 3(IV) and alpha 4(IV) collagen chains in human tissues.. J. Biol. Chem. 269: 23013 — 23017. PubMed
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з COL4A4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2206 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
- UniProt, P53420 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.