COL5A2

COL5A2 (англ. Collagen type V alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 499 амінокислот, а молекулярна маса — 144 910[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMANWAEARPLLILIVLLGQFVSIKAQEEDEDEGYGEEIACTQNGQMYLN
RDIWKPAPCQICVCDNGAILCDKIECQDVLDCADPVTPPGECCPVCSQTP
GGGNTNFGRGRKGQKGEPGLVPVVTGIRGRPGPAGPPGSQGPRGERGPKG
RPGPRGPQGIDGEPGVPGQPGAPGPPGHPSHPGPDGLSRPFSAQMAGLDE
KSGLGSQVGLMPGSVGPVGPRGPQGLQGQQGGAGPTGPPGEPGDPGPMGP
IGSRGPEGPPGKPGEDGEPGRNGNPGEVGFAGSPGARGFPGAPGLPGLKG
HRGHKGLEGPKGEVGAPGSKGEAGPTGPMGAMGPLGPRGMPGERGRLGPQ
GAPGQRGAHGMPGKPGPMGPLGIPGSSGFPGNPGMKGEAGPTGARGPEGP
QGQRGETGPPGPVGSPGLPGAIGTDGTPGAKGPTGSPGTSGPPGSAGPPG
SPGPQGSTGPQGIRGQPGDPGVPGFKGEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEE
GKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGS
SGPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPG
PPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDPGKPGEAGNAGVPGQRGAPGKDGEV
GPSGPVGPPGLAGERGEQGPPGPTGFQGLPGPPGPPGEGGKPGDQGVPGD
PGAVGPLGPRGERGNPGERGEPGITGLPGEKGMAGGHGPDGPKGSPGPSG
TPGDTGPPGLQGMPGERGIAGTPGPKGDRGGIGEKGAEGTAGNDGARGLP
GPLGPPGPAGPTGEKGEPGPRGLVGPPGSRGNPGSRGENGPTGAVGFAGP
QGPDGQPGVKGEPGEPGQKGDAGSPGPQGLAGSPGPHGPNGVPGLKGGRG
TQGPPGATGFPGSAGRVGPPGPAGAPGPAGPLGEPGKEGPPGLRGDPGSH
GRVGDRGPAGPPGGPGDKGDPGEDGQPGPDGPPGPAGTTGQRGIVGMPGQ
RGERGMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPEG
PAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQR
GDPGSRGPIGPPGRAGKRGLPGPQGPRGDKGDHGDRGDRGQKGHRGFTGL
QGLPGPPGPNGEQGSAGIPGPFGPRGPPGPVGPSGKEGNPGPLGPIGPPG
VRGSVGEAGPEGPPGEPGPPGPPGPPGHLTAALGDIMGHYDESMPDPLPE
FTEDQAAPDDKNKTDPGVHATLKSLSSQIETMRSPDGSKKHPARTCDDLK
LCHSAKQSGEYWIDPNQGSVEDAIKVYCNMETGETCISANPSSVPRKTWW
ASKSPDNKPVWYGLDMNRGSQFAYGDHQSPNTAITQMTFLRLLSKEASQN
ITYICKNSVGYMDDQAKNLKKAVVLKGANDLDIKAEGNIRFRYIVLQDTC
SKRNGNVGKTVFEYRTQNVARLPIIDLAPVDVGGTDQEFGVEIGPVCFV
COL5A2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL5A2, EDSC, collagen type V alpha 2, collagen type V alpha 2 chain, EDSCL2
Зовнішні ІД OMIM: 120190 MGI: 88458 HomoloGene: 20119 GeneCards: COL5A2
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1290
12832
Ensembl
ENSG00000204262
ENSMUSG00000026042
UniProt
P05997
Q3U962
RefSeq (мРНК)
NM_000393
NM_007737
RefSeq (білок)
NP_000384
NP_031763
Локус (UCSC) Хр. 2: 189.03 – 189.23 Mb Хр. 1: 45.37 – 45.5 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Weil D., Bernard M.P., Gargano S., Ramirez F. (1987). The pro alpha 2(V) collagen gene is evolutionarily related to the major fibrillar-forming collagens.. Nucleic Acids Res. 15: 181 — 198. PubMed DOI:10.1093/nar/15.1.181
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Emanuel B.S., Cannizzaro L.A., Seyer J.M., Myers J.C. (1985). Human alpha 1(III) and alpha 2(V) procollagen genes are located on the long arm of chromosome 2.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82: 3385 — 3389. PubMed DOI:10.1073/pnas.82.10.3385
  • Michalickova K., Susic M., Willing M.C., Wenstrup R.J., Cole W.G. (1998). Mutations of the alpha2(V) chain of type V collagen impair matrix assembly and produce Ehlers-Danlos syndrome type I.. Hum. Mol. Genet. 7: 249 — 255. PubMed DOI:10.1093/hmg/7.2.249
  • Fernandes R.J., Farnand A.W., Traeger G.R., Weis M.A., Eyre D.R. (2011). A role for prolyl 3-hydroxylase 2 in post-translational modification of fibril-forming collagens.. J. Biol. Chem. 286: 30662 — 30669. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.267906
  • Woodbury D., Benson-Chanda V., Ramirez F. (1989). Amino-terminal propeptide of human pro-alpha 2(V) collagen conforms to the structural criteria of a fibrillar procollagen molecule.. J. Biol. Chem. 264: 2735 — 2738. PubMed

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2210 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, P05997 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.