CXCL11

CXCL11
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1RJT
Ідентифікатори
Символи	CXCL11, H174, I-TAC, IP-9, IP9, SCYB11, SCYB9B, b-R1, C-X-C motif chemokine ligand 11
Зовнішні ІД	OMIM: 604852 HomoloGene: 3944 GeneCards: CXCL11
Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemokine activity; • cytokine activity; • heparin binding; • GO:0001948 protein binding; • CXCR3 chemokine receptor binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • extracellular space; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• хемотаксис; • positive regulation of leukocyte chemotaxis; • T cell chemotaxis; • chemokine-mediated signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • cell-cell signaling; • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • positive regulation of cAMP-mediated signaling; • regulation of cell population proliferation; • Імунна відповідь; • Сигнальна трансдукція; • defense response; • inflammatory response; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • regulation of signaling receptor activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • neutrophil chemotaxis; • leukocyte chemotaxis; • cellular response to lipopolysaccharide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6373
	305236
	ENSG00000169248
	ENSRNOG00000022298
	O14625
	Q7TNL0
	NM_005409; NM_001302123
	NM_182952
	NP_001289052; NP_005400
	NP_891997
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CXCL11 (англ. C-X-C motif chemokine ligand 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 365[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVKGMAIAL		AVILCATVVQ		GFPMFKRGRC		LCIGPGVKAV		KVADIEKASI
MYPSNNCDKI		EVIITLKENK		GQRCLNPKSK		QARLIIKKVE		RKNF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах як запальна відповідь, хемотаксис, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

Laich A.M., Meyer M., Werner E.R., Werner-Felmayer G. (1999). Structure and expression of the human small cytokine B subfamily member 11 (SCYB11/formerly SCYB9B, alias I-TAC) gene cloned from IFN-gamma-treated human monocytes (THP-1).. J. Interferon Cytokine Res. 19: 505 — 513. PubMed DOI:10.1089/107999099313956
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Booth V., Clark-Lewis I., Sykes B.D. (2004). NMR structure of CXCR3 binding chemokine CXCL11 (ITAC).. Protein Sci. 13: 2022 — 2028. PubMed DOI:10.1110/ps.04791404
Erdel M., Laich A., Utermann G., Werner E.R., Werner-Felmayer G. (1998). The human gene encoding SCYB9B, a putative novel CXC chemokine, maps to human chromosome 4q21 like the closely related genes for MIG (SCYB9) and INP10 (SCYB10).. Cytogenet. Cell Genet. 81: 271 — 272. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10638 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, O14625 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10638 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O14625 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.