EDC3

EDC3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2VC8, 2WAX, 2WAY, 3D3J, 3D3K
Ідентифікатори
Символи	EDC3, LSM16, YJDC, YJEFN2, MRT50, enhancer of mRNA decapping 3, hYjeF_N2-15q23
Зовнішні ІД	OMIM: 609842 MGI: 2142951 HomoloGene: 11827 GeneCards: EDC3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • phosphodiesterase decapping endonuclease activity; • identical protein binding; • RNA binding; • mRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • P-body; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• P-body assembly; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	80153
	353190
	ENSG00000179151
	ENSMUSG00000038957
	Q96F86
	Q8K2D3
	NM_001142443; NM_001142444; NM_025083; NM_001351378; NM_001351379
	NM_153799
	NP_001135915; NP_001135916; NP_079359; NP_001338307; NP_001338308
	NP_722494
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EDC3 (англ. Enhancer of mRNA decapping 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 56 078[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATDWLGSIV	SINCGDSLGV	YQGRVSAVDQ	VSQTISLTRP	FHNGVKCLVP
EVTFRAGDIT	ELKILEIPGP	GDNQHFGDLH	QTELGPSGAG	CQVGINQNGT
GKFVKKPASS	SSAPQNIPKR	TDVKSQDVAV	SPQQQQCSKS	YVDRHMESLS
QSKSFRRRHN	SWSSSSRHPN	QATPKKSGLK	NGQMKNKDDE	CFGDDIEEIP
DTDFDFEGNL	ALFDKAAVFE	EIDTYERRSG	TRSRGIPNER	PTRYRHDENI
LESEPIVYRR	IIVPHNVSKE	FCTDSGLVVP	SISYELHKKL	LSVAEKHGLT
LERRLEMTGV	CASQMALTLL	GGPNRLNPKN	VHQRPTVALL	CGPHVKGAQG
ISCGRHLANH	DVQVILFLPN	FVKMLESITN	ELSLFSKTQG	QQVSSLKDLP
TSPVDLVINC	LDCPENVFLR	DQPWYKAAVA	WANQNRAPVL	SIDPPVHEVE
QGIDAKWSLA	LGLPLPLGEH	AGRIYLCDIG	IPQQVFQEVG	INYHSPFGCK
FVIPLHSA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping.. Mol. Cell 20: 905 — 915. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2005.10.031
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26114 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q96F86 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26114 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96F86 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.