GAD1

GAD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2OKJ, 3VP6
Ідентифікатори
Символи	GAD1, CPSQ1, GAD, SCP, glutamate decarboxylase 1, DEE89
Зовнішні ІД	OMIM: 605363 MGI: 95632 HomoloGene: 635 GeneCards: GAD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • каталітична активність; • lyase activity; • protein heterodimerization activity; • pyridoxal phosphate binding; • carboxy-lyase activity; • glutamate binding; • glutamate decarboxylase activity; • protein N-terminus binding;
Клітинна компонента	• vesicle membrane; • клітинна мембрана; • clathrin-sculpted gamma-aminobutyric acid transport vesicle membrane; • внутрішньоклітинний; • presynaptic active zone; • цитоплазма; • cell cortex; • Аксон; • axon terminus; • neuron projection terminus; • Синапс; • inhibitory synapse;
Біологічний процес	• gamma-aminobutyric acid biosynthetic process; • glutamate catabolic process; • carboxylic acid metabolic process; • neurotransmitter biosynthetic process; • protein-pyridoxal-5-phosphate linkage; • glutamate decarboxylation to succinate; • chemical synaptic transmission; • соціальна поведінка; • locomotory exploration behavior; • GO:0010554 neurotransmitter secretion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2571
	14415
	ENSG00000128683
	ENSMUSG00000070880
	Q99259
	P48318
	NM_000817; NM_013445
	NM_008077; NM_001312900
	NP_000808; NP_038473
	NP_001299829; NP_032103
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GAD1 (англ. Glutamate decarboxylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 66 897[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASSTPSSSA	TSSNAGADPN	TTNLRPTTYD	TWCGVAHGCT	RKLGLKICGF
LQRTNSLEEK	SRLVSAFKER	QSSKNLLSCE	NSDRDARFRR	TETDFSNLFA
RDLLPAKNGE	EQTVQFLLEV	VDILLNYVRK	TFDRSTKVLD	FHHPHQLLEG
MEGFNLELSD	HPESLEQILV	DCRDTLKYGV	RTGHPRFFNQ	LSTGLDIIGL
AGEWLTSTAN	TNMFTYEIAP	VFVLMEQITL	KKMREIVGWS	SKDGDGIFSP
GGAISNMYSI	MAARYKYFPE	VKTKGMAAVP	KLVLFTSEQS	HYSIKKAGAA
LGFGTDNVIL	IKCNERGKII	PADFEAKILE	AKQKGYVPFY	VNATAGTTVY
GAFDPIQEIA	DICEKYNLWL	HVDAAWGGGL	LMSRKHRHKL	NGIERANSVT
WNPHKMMGVL	LQCSAILVKE	KGILQGCNQM	CAGYLFQPDK	QYDVSYDTGD
KAIQCGRHVD	IFKFWLMWKA	KGTVGFENQI	NKCLELAEYL	YAKIKNREEF
EMVFNGEPEH	TNVCFWYIPQ	SLRGVPDSPQ	RREKLHKVAP	KIKALMMESG
TTMVGYQPQG	DKANFFRMVI	SNPAATQSDI	DFLIEEIERL	GQDL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

Bu D.-F., Tobin A.J. (1994). The exon-intron organization of the genes (GAD1 and GAD2) encoding two human glutamate decarboxylases (GAD67 and GAD65) suggests that they derive from a common ancestral GAD.. Genomics 21: 222 — 228. PubMed DOI:10.1006/geno.1994.1246
Kelly C.D., Carter N.D., Johnstone A.P., Nussey S.S. (1991). Cloning of large isoform of human brain glutamic acid decarboxylase.. Lancet 338: 1468 — 1469. PubMed DOI:10.1016/0140-6736(91)92780-6
Yamashita K., Cram D.S., Harrison L.C. (1993). Molecular cloning of full-length glutamic acid decarboxylase 67 from human pancreas and islets.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 192: 1347 — 1352. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1993.1564
Chessler S.D., Lernmark A. (2000). Alternative splicing of GAD67 results in the synthesis of a third form of glutamic-acid decarboxylase in human islets and other non-neural tissues.. J. Biol. Chem. 275: 5188 — 5192. PubMed DOI:10.1074/jbc.275.7.5188
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Cram D.S., Barnett L.D., Joseph J.L., Harrison L.C. (1991). Cloning and partial nucleotide sequence of human glutamic acid decarboxylase cDNA from brain and pancreatic islets.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176: 1239 — 1244. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(91)90418-7

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4092 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q99259 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4092 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q99259 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.