GYPC

GYPC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EJY
Ідентифікатори
Символи	GYPC, CD236, CD236R, GE, GPC, GPD, GYPD, PAS-2, PAS-2', glycophorin C (Gerbich blood group), GE:GPC:GPD:GYPD
Зовнішні ІД	OMIM: 110750 MGI: 1098566 HomoloGene: 128415 GeneCards: GYPC
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • signaling receptor binding; • protein homodimerization activity; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cortical cytoskeleton; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • extrinsic component of plasma membrane;
Біологічний процес	• leukocyte migration; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • cell recognition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2995
	71683
	ENSG00000136732
	ENSMUSG00000090523
	P04921
	Q78HU7
	NM_001256584; NM_002101; NM_016815
	NM_001048207; NM_027863; NM_001347610
	NP_001243513; NP_002092; NP_058131
	NP_001041672; NP_001334539
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GYPC (англ. Glycophorin C (Gerbich blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 128 амінокислот, а молекулярна маса — 13 811[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWSTRSPNST	AWPLSLEPDP	GMASASTTMH	TTTIAEPDPG	MSGWPDGRME
TSTPTIMDIV	VIAGVIAAVA	IVLVSLLFVM	LRYMYRHKGT	YHTNEAKGTE
FAESADAALQ	GDPALQDAGD	SSRKEYFI

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

High S., Tanner M.J.A. (1987). Human erythrocyte membrane sialoglycoprotein beta. The cDNA sequence suggests the absence of a cleaved N-terminal signal sequence.. Biochem. J. 243: 277 — 280. PubMed DOI:10.1042/bj2430277
le van Kim C., Mitjavila M.T., Clerget M., Cartron J.-P., Colin Y. (1990). An ubiquitous isoform of glycophorin C is produced by alternative splicing.. Nucleic Acids Res. 18: 3076 — 3076. PubMed DOI:10.1093/nar/18.10.3076
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Dahr W., Beyreuther K., Kordowicz M., Krueger J. (1982). N-terminal amino acid sequence of sialoglycoprotein D (glycophorin C) from human erythrocyte membranes.. Eur. J. Biochem. 125: 57 — 62. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1982.tb06650.x
El-Maliki B., Blanchard D., Dahr W., Beyreuther K., Cartron J.-P. (1989). Structural homology between glycophorins C and D of human erythrocytes.. Eur. J. Biochem. 183: 639 — 643. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1989.tb21093.x
High S., Tanner M.J.A., Macdonald E.N., Anstee D.J. (1989). Rearrangements of the red-cell membrane glycophorin C (sialoglycoprotein beta) gene. A further study of alterations in the glycophorin C gene.. Biochem. J. 262: 47 — 54. PubMed DOI:10.1042/bj2620047

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4704 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
UniProt, P04921 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4704 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04921 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.