HCN1

HCN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3U0Z
Ідентифікатори
Символи	HCN1, BCNG-1, BCNG1, EIEE24, HAC-2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, GEFSP10, DEE24
Зовнішні ІД	OMIM: 602780 MGI: 1096392 HomoloGene: 32093 GeneCards: HCN1
Реагує на сполуку
	Івабрадин[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • intracellular cAMP-activated cation channel activity; • identical protein binding; • voltage-gated sodium channel activity; • ion channel activity; • potassium channel activity; • sodium channel activity; • voltage-gated ion channel activity; • voltage-gated potassium channel activity; • voltage-gated cation channel activity; • cAMP binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• Аксон; • мембрана; • Дендрит (нейробіологія); • клітинна мембрана; • integral component of membrane; • HCN channel complex; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• transmembrane transport; • retinal cone cell development; • regulation of ion transmembrane transport; • apical protein localization; • ion transport; • sodium ion transport; • regulation of membrane potential; • sodium ion transmembrane transport; • potassium ion transmembrane transport; • potassium ion transport; • protein homotetramerization; • cellular response to cAMP;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	348980
	15165
	ENSG00000164588
	ENSMUSG00000021730
	O60741
	O88704
	NM_021072
	NM_010408
	NP_066550
	NP_034538
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HCN1 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 890 амінокислот, а молекулярна маса — 98 796[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGGGKPNSS	SNSRDDGNSV	FPAKASATGA	GPAAAEKRLG	TPPGGGGAGA
KEHGNSVCFK	VDGGGGGGGG	GGGGEEPAGG	FEDAEGPRRQ	YGFMQRQFTS
MLQPGVNKFS	LRMFGSQKAV	EKEQERVKTA	GFWIIHPYSD	FRFYWDLIML
IMMVGNLVII	PVGITFFTEQ	TTTPWIIFNV	ASDTVFLLDL	IMNFRTGTVN
EDSSEIILDP	KVIKMNYLKS	WFVVDFISSI	PVDYIFLIVE	KGMDSEVYKT
ARALRIVRFT	KILSLLRLLR	LSRLIRYIHQ	WEEIFHMTYD	LASAVVRIFN
LIGMMLLLCH	WDGCLQFLVP	LLQDFPPDCW	VSLNEMVNDS	WGKQYSYALF
KAMSHMLCIG	YGAQAPVSMS	DLWITMLSMI	VGATCYAMFV	GHATALIQSL
DSSRRQYQEK	YKQVEQYMSF	HKLPADMRQK	IHDYYEHRYQ	GKIFDEENIL
NELNDPLREE	IVNFNCRKLV	ATMPLFANAD	PNFVTAMLSK	LRFEVFQPGD
YIIREGAVGK	KMYFIQHGVA	GVITKSSKEM	KLTDGSYFGE	ICLLTKGRRT
ASVRADTYCR	LYSLSVDNFN	EVLEEYPMMR	RAFETVAIDR	LDRIGKKNSI
LLQKFQKDLN	TGVFNNQENE	ILKQIVKHDR	EMVQAIAPIN	YPQMTTLNST
SSTTTPTSRM	RTQSPPVYTA	TSLSHSNLHS	PSPSTQTPQP	SAILSPCSYT
TAVCSPPVQS	PLAARTFHYA	SPTASQLSLM	QQQPQQQVQQ	SQPPQTQPQQ
PSPQPQTPGS	STPKNEVHKS	TQALHNTNLT	REVRPLSASQ	PSLPHEVSTL
ISRPHPTVGE	SLASIPQPVT	AVPGTGLQAG	GRSTVPQRVT	LFRQMSSGAI
PPNRGVPPAP	PPPAAALPRE	SSSVLNTDPD	AEKPRFASNL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Lee C.H., MacKinnon R. (2017). Structures of the human HCN1 hyperpolarization-activated channel.. Cell 168: 111 — 120. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2016.12.023

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4845 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.
UniProt, O60741 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4845 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O60741 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.