HDC

HDC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4E1O
Ідентифікатори
Символи	HDC, entrez:3067, Histidine decarboxylase
Зовнішні ІД	OMIM: 142704 MGI: 96062 HomoloGene: 20490 GeneCards: HDC
Онтологія гена
Молекулярна функція	• pyridoxal phosphate binding; • GO:0001948 protein binding; • histidine decarboxylase activity; • каталітична активність; • carboxy-lyase activity; • lyase activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма;
Біологічний процес	• cellular amino acid metabolic process; • catecholamine biosynthetic process; • histidine metabolic process; • carboxylic acid metabolic process; • histidine catabolic process; • histamine biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3067
	15186
	ENSG00000140287
	ENSMUSG00000027360
	P19113
	P23738
	NM_001306146; NM_002112
	NM_008230
	NP_001293075; NP_002103
	NP_032256
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HDC (англ. Histidine decarboxylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 662 амінокислот, а молекулярна маса — 74 141[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMEPEEYRER	GREMVDYICQ	YLSTVRERRV	TPDVQPGYLR	AQLPESAPED
PDSWDSIFGD	IERIIMPGVV	HWQSPHMHAY	YPALTSWPSL	LGDMLADAIN
CLGFTWASSP	ACTELEMNVM	DWLAKMLGLP	EHFLHHHPSS	QGGGVLQSTV
SESTLIALLA	ARKNKILEMK	TSEPDADESC	LNARLVAYAS	DQAHSSVEKA
GLISLVKMKF	LPVDDNFSLR	GEALQKAIEE	DKQRGLVPVF	VCATLGTTGV
CAFDCLSELG	PICAREGLWL	HIDAAYAGTA	FLCPEFRGFL	KGIEYADSFT
FNPSKWMMVH	FDCTGFWVKD	KYKLQQTFSV	NPIYLRHANS	GVATDFMHWQ
IPLSRRFRSV	KLWFVIRSFG	VKNLQAHVRH	GTEMAKYFES	LVRNDPSFEI
PAKRHLGLVV	FRLKGPNCLT	ENVLKEIAKA	GRLFLIPATI	QDKLIIRFTV
TSQFTTRDDI	LRDWNLIRDA	ATLILSQHCT	SQPSPRVGNL	ISQIRGARAW
ACGTSLQSVS	GAGDDPVQAR	KIIKQPQRVG	AGPMKRENGL	HLETLLDPVD
DCFSEEAPDA	TKHKLSSFLF	SYLSVQTKKK	TVRSLSCNSV	PVSAQKPLPT
EASVKNGGSS	RVRIFSRFPE	DMMMLKKSAF	KKLIKFYSVP	SFPECSSQCG
LQLPCCPLQA	MV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

Zahnow C.A., Yi H.F., McBride O.W., Joseph D.R. (1991). Cloning of the cDNA encoding human histidine decarboxylase from an erythroleukemia cell line and mapping of the gene locus to chromosome 15.. DNA Seq. 1: 395 — 400. PubMed DOI:10.3109/10425179109020795
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Komori H., Nitta Y., Ueno H., Higuchi Y. (2012). Structural study reveals that Ser-354 determines substrate specificity on human histidine decarboxylase.. J. Biol. Chem. 287: 29175 — 29183. PubMed DOI:10.1074/jbc.M112.381897

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4855 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P19113 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4855 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P19113 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.