HIST1H1E

HIST1H1E
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3TZD, 5JJZ
Ідентифікатори
Символи	H1-4, histone cluster 1, H1e, H1.4, H1E, H1F4, H1s-4, dJ221C16.5, histone cluster 1 H1 family member e, RMNS, HIST1H1E, H1.4 linker histone, cluster member
Зовнішні ІД	OMIM: 142220 HomoloGene: 130534 GeneCards: H1-4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • chromatin DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding; • nucleotide binding; • double-stranded DNA binding; • calcium ion binding; • ATP binding; • GTP binding; • AMP binding; • dATP binding; • ADP binding; • nucleosomal DNA binding;
Клітинна компонента	• Нуклеосома; • Екзосома; • клітинне ядро; • хромосома;
Біологічний процес	• regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H3-K4 trimethylation; • nucleosome assembly; • nucleosome positioning; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H3-K27 trimethylation; • regulation of transcription, DNA-templated; • chromosome condensation; • negative regulation of DNA recombination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3008
	н/д
	ENSG00000168298
	н/д
	P10412
	н/д
	NM_005321
	н/д
	NP_005312; NP_005312.1
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

HIST1H1E (англ. Histone cluster 1 H1 family member e) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 21 865[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSETAPAAPA	APAPAEKTPV	KKKARKSAGA	AKRKASGPPV	SELITKAVAA
SKERSGVSLA	ALKKALAAAG	YDVEKNNSRI	KLGLKSLVSK	GTLVQTKGTG
ASGSFKLNKK	AASGEAKPKA	KKAGAAKAKK	PAGAAKKPKK	ATGAATPKKS
AKKTPKKAKK	PAAAAGAKKA	KSPKKAKAAK	PKKAPKSPAK	AKAVKPKAAK
PKTAKPKAAK	PKKAAAKKK

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes.. Genomics 10: 940 — 948. PubMed DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes.. Genomics 80: 487 — 498. PubMed DOI:10.1006/geno.2002.6850
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts.. Chromosome Res. 8: 405 — 424. PubMed DOI:10.1023/A:1009262819961
Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain.. J. Biol. Chem. 280: 27809 — 27814. PubMed DOI:10.1074/jbc.M501627200
Ohe Y., Hayashi H., Iwai K. (1986). Human spleen histone H1. Isolation and amino acid sequence of a main variant, H1b.. J. Biochem. 100: 359 — 368. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4718 (англ.). Процитовано 28 лютого 2017.
UniProt, P10412 (англ.). Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4718 (англ.). Процитовано 28 лютого 2017.

[UniProt-3] UniProt, P10412 (англ.). Процитовано 28 лютого 2017.