HLA-A

HLA-A
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2XPG, 3RL1, 3RL2,%%s2BCK, 3I6L, 3NFN, 3QZW, 3VXM, 3VXN, 3VXO, 3VXP, 3VXR, 3VXS, 3VXU, 3W0W, 3WL9, 3WLB, 4F7M, 4F7P, 4F7T, 4WU5, 4WU7, 5HGA, 5HGD, 5HGB, 5HGH,%%s1Q94, 1QVO, 1X7Q, 2HN7, 4MJ5, 4MJ6, 4N8V, 4UQ2,%%s1W72, 3BO8, 4NQV, 4NQX, 5BRZ, 5BS0,%%s1AKJ, 1AO7, 1AQD, 1B0G, 1B0R, 1BD2, 1DUY, 1DUZ, 1EEY, 1EEZ, 1HHG, 1HHH, 1HHI, 1HHJ, 1HHK, 1HLA, 1I1F, 1I1Y, 1I4F, 1I7R, 1I7T, 1I7U, 1IM3, 1JF1, 1JHT, 1LP9, 1OGA, 1P7Q, 1QEW, 1QR1, 1QRN, 1QSE, 1QSF, 1S8D, 1S9W, 1S9X, 1S9Y, 1T1W, 1T1X, 1T1Y, 1T1Z, 1T20, 1T21, 1T22, 1TVB, 1TVH, 2AV1, 2AV7, 2BNQ, 2BNR, 2C7U, 2CLR, 2F53, 2F54, 2GIT, 2GJ6, 2GT9, 2GTW, 2GTZ, 2GUO, 2J8U, 2JCC, 2P5E, 2P5W, 2PYE, 2UWE, 2V2W, 2V2X, 2VLJ, 2VLK, 2VLL, 2VLR, 2X4N, 2X4O, 2X4P, 2X4Q, 2X4R, 2X4S, 2X4T, 2X4U, 2X70, 3BGM, 3BH8, 3BH9, 3BHB, 3D25, 3D39, 3D3V, 3FQN, 3FQR, 3FQT, 3FQU, 3FQW, 3FQX, 3FT2, 3FT3, 3FT4, 3GIV, 3GJF, 3GSN, 3GSO, 3GSQ, 3GSR, 3GSU, 3GSV, 3GSW, 3GSX, 3H7B, 3H9H, 3H9S, 3HAE, 3HLA, 3HPJ, 3I6G, 3I6K, 3IXA, 3KLA, 3MGO, 3MGT, 3MR9, 3MRB, 3MRC, 3MRD, 3MRF, 3MRG, 3MRH, 3MRI, 3MRJ, 3MRK, 3MRL, 3MRM, 3MRN, 3MRO, 3MRP, 3MRQ, 3MRR, 3MYJ, 3O3A, 3O3B, 3O3D, 3O3E, 3PWJ, 3PWL, 3PWN, 3PWP, 3QDG, 3QDJ, 3QDM, 3QEQ, 3QFD, 3QFJ, 3REW, 3TO2, 3UTQ, 3UTS, 3UTT, 3V5D, 3V5H, 3V5K, 4E5X, 4EMZ, 4EN2, 4EUP, 4FTV, 4GKN, 4GKS, 4I4W, 4JFD, 4JFE, 4JFF, 4JFO, 4JFP, 4JFQ, 4K7F, 4L29, 4L3C, 4L3E, 4MNQ, 4NNX, 4NNY, 4NO0, 4NO2, 4NO3, 4NO5, 4OV5, 4QOK, 4U6X, 4U6Y, 4UQ3, 4WJ5, 4WUU, 5EU3, 5EU5, 5EU4, 5D2L, 5D2N, 5EU6, 5HHQ, 5HHO, 5HHM, 5C09, 5C0F, 5E9D, 5C0G, 5C0A, 4ZEZ, 5C0I, 5D9S, 5HYJ, 5C0H, 5C0J, 5C0E, 5C0C, 5C0B, 5C07, 5C0D, 5C08, 5HHN,%%s1HSB, 1TMC, 2HLA, 4HWZ, 4HX1, 4I48
Ідентифікатори
Символи	HLA-A, Aw-33, Aw-74, major histocompatibility complex, class I, A, HLA-A11, HLA-A33, HLA-DQB1, HLA-DRB1
Зовнішні ІД	OMIM: 142800 MGI: 95931 HomoloGene: 128352 GeneCards: HLA-A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-2-microglobulin binding; • TAP binding; • peptide antigen binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • phagocytic vesicle membrane; • комплекс Ґольджі; • early endosome membrane; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • MHC class I protein complex; • мембрана; • recycling endosome membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • Екзосома;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immune system process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent; • type I interferon signaling pathway; • regulation of immune response; • GO:0022415 viral process; • Імунна відповідь; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • Убіквітин-залежний протеоліз; • T cell mediated cytotoxicity; • CD8-positive, alpha-beta T cell activation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I; • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity; • T cell mediated cytotoxicity directed against tumor cell target; • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I; • adaptive immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3105
	15013
ENSG00000206505; ENSG00000224320; ENSG00000206503; ENSG00000223980; ENSG00000229215;
	ENSG00000227715; ENSG00000235657; ENSG00000231834
	ENSMUSG00000091705
	P04439; Q5SUL5
	н/д
	NM_001242758; NM_002116
	NM_010392; NM_001368740
	NP_001229687; NP_002107; NP_001229687.1
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-A (англ. HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 841[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVMAPRTLL	LLLSGALALT	QTWAGSHSMR	YFFTSVSRPG	RGEPRFIAVG
YVDDTQFVRF	DSDAASQRME	PRAPWIEQEG	PEYWDQETRN	VKAQSQTDRV
DLGTLRGYYN	QSEAGSHTIQ	IMYGCDVGSD	GRFLRGYRQD	AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA	DMAAQITKRK	WEAAHEAEQL	RAYLDGTCVE	WLRRYLENGK
ETLQRTDPPK	THMTHHPISD	HEATLRCWAL	GFYPAEITLT	WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA	GDGTFQKWAA	VVVPSGEEQR	YTCHVQHEGL	PKPLTLRWEL
SSQPTIPIVG	IIAGLVLLGA	VITGAVVAAV	MWRRKSSDRK	GGSYTQAASS
DSAQGSDVSL	TACKV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

Strachan T., Sodoyer R., Damotte M., Jordan B.R. (1984). Complete nucleotide sequence of a functional class I HLA gene, HLA-A3: implications for the evolution of HLA genes.. EMBO J. 3: 887 — 894. PubMed
Cowan E.P., Jordan B.E., Coligan J.E. (1985). Molecular cloning and DNA sequence analysis of genes encoding cytotoxic T lymphocyte-defined HLA-A3 subtypes: the E1 subtype.. J. Immunol. 135: 2835 — 2841. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4931 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P04439 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4931 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04439 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.