HLA-B

HLA-B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3VCL, 4U1H, 4U1K, 5EO1, 5EO0,%%s1AGB, 1AGC, 1AGD, 1AGE, 1AGF, 1M05, 1MI5, 3FFC, 3SJV, 3SKM, 3SKO, 3SPV, 3X13, 3X14, 4QRP, 4QRQ, 4QRS, 4QRT, 4QRU,%%s4O2C, 4O2E, 4O2F,%%s3LN4, 3LN5,%%s4U1J, 4U1M, 4U1N,%%s4U1I, 4U1L, 4U1S,%%s1HSA, 1JGD, 1JGE, 1K5N, 1OF2, 1OGT, 1UXS, 1UXW, 1W0V, 1W0W, 2A83, 2BSR, 2BSS, 2BST, 3B3I, 3B6S, 3BP4, 3BP7, 3CZF, 3D18, 3DTX, 3HCV, 3LV3, 4G8G, 4G8I, 4G9D, 4G9F, 5DEF, 5DEG,%%s1A1N, 1A9B, 1A9E, 1CG9, 1XH3, 1ZHK, 1ZHL, 1ZSD, 2AK4, 2AXF, 2AXG, 2H6P, 2NW3, 2NX5, 3BW9, 3BWA, 3KWW, 3KXF, 3LKN, 3LKO, 3LKP, 3LKQ, 3LKR, 3LKS, 3MV7, 3MV8, 3MV9, 3VFS, 3VFT, 3VFU, 3VFV, 3VFW, 4LNR, 4PR5, 4PRN, 4QRR,%%s1A1M, 1A1O,%%s2BVO, 2BVP, 2BVQ, 2HJL, 2RFX, 2YPK, 2YPL, 3UPR, 3VH8, 3VRI, 3VRJ, 3WUW, 3X11, 3X12, 5B39, 5B38,%%s4JQV, 4XXC,%%s1XR8, 1XR9, 3C9N,%%s4LCY,%%s1M6O, 1N2R, 1SYV, 3DX6, 3DX7, 3DX8, 3DXA, 3KPL, 3KPM, 3KPN, 3KPO, 3KPP, 3KPQ, 3KPR, 3KPS, 3L3D, 3L3G, 3L3I, 3L3J, 4JQX,%%s1E27, 1E28, 4MJI,%%s3W39
Ідентифікатори
Символи	HLA-B, AS, SPDA1, Bw-47, Bw-50, major histocompatibility complex, class I, B, B-4901, B-5001, HEL-S-83, HLA-B*45ZJ, HLA-B-3506, HLA-B-3905, HLA-B-5502, HLA-B-5602, HLA-B15, HLA-B39, HLA-B49, HLA-B50, HLA-B55, HLA-B59, HLA-B61, HLA-Cw, HLA-DRB1
Зовнішні ІД	HomoloGene: 134029 GeneCards: HLA-B
Пов'язані генетичні захворювання
	human immunodeficiency virus infectious disease[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding; • peptide antigen binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • phagocytic vesicle membrane; • комплекс Ґольджі; • early endosome membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • Ендоплазматичний ретикулум; • MHC class I protein complex; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • Екзосома; • secretory granule membrane; • recycling endosome membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • regulation of interleukin-12 production; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immune system process; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • regulation of dendritic cell differentiation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent; • protection from natural killer cell mediated cytotoxicity; • type I interferon signaling pathway; • Імунна відповідь; • regulation of immune response; • regulation of T cell anergy; • GO:0022415 viral process; • regulation of interleukin-6 production; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3106
	30757
ENSG00000228964; ENSG00000234745; ENSG00000206450; ENSG00000224608; ENSG00000223532;
	ENSG00000232126
	ENSDARG00000075963
	P01889
	Q31365
	NM_005514
	NM_131471
	NP_005505
	NP_571546
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-B (англ. HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 40 460[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLVMAPRTVL	LLLSAALALT	ETWAGSHSMR	YFYTSVSRPG	RGEPRFISVG
YVDDTQFVRF	DSDAASPREE	PRAPWIEQEG	PEYWDRNTQI	YKAQAQTDRE
SLRNLRGYYN	QSEAGSHTLQ	SMYGCDVGPD	GRLLRGHDQY	AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA	DTAAQITQRK	WEAAREAEQR	RAYLEGECVE	WLRRYLENGK
DKLERADPPK	THVTHHPISD	HEATLRCWAL	GFYPAEITLT	WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA	GDRTFQKWAA	VVVPSGEEQR	YTCHVQHEGL	PKPLTLRWEP
SSQSTVPIVG	IVAGLAVLAV	VVIGAVVAAV	MCRRKSSGGK	GGSYSQAACS
DSAQGSDVSL	TA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

Ennis P.D., Zemmour J., Salter R.D., Parham P. (1990). Rapid cloning of HLA-A,B cDNA by using the polymerase chain reaction: frequency and nature of errors produced in amplification.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2833 — 2837. PubMed DOI:10.1073/pnas.87.7.2833
Bergmans A., Tijssen H., Lardy J., Reekers P. (1993). Complete nucleotide sequence of HLA-B*0703, a B7-variant (BPOT).. Hum. Immunol. 38: 159 — 162. PubMed DOI:10.1016/0198-8859(93)90533-7
Kubens B.S., Arnett K.L., Adams E.J., Parham P., Grosse-Wilde H. (1995). Definition of a new HLA-B7 subtype (B*0704) by isoelectric focusing, family studies and DNA sequence analysis.. Tissue Antigens 45: 322 — 327. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02461.x
Arnett K.L., Adams E.J., Domena J.D., Parham P. (1994). Structure of a novel subtype of B7 (B*0705) isolated from a Chinese individual.. Tissue Antigens 44: 318 — 321. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1994.tb02402.x
Middleton D., Curran M.D., Anholts J.D., Reilly E.R., Schreuder G.M. (2001). Characterisation of a new HLA-B allele, HLA-B*0724.. Tissue Antigens 57: 471 — 473. PubMed DOI:10.1034/j.1399-0039.2001.057005471.x
Orr H.T., Lopez de Castro J.A., Lancet D., Strominger J.L. (1979). Complete amino acid sequence of a papain-solubilized human histocompatibility antigen, HLA-B7. 2. Sequence determination and search for homologies.. Biochemistry 18: 5711 — 5720. PubMed DOI:10.1021/bi00592a030

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HLA-B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4932 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P01889 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HLA-B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4932 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P01889 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.