HLA-C

HLA-C
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3BZF,%%s4NT6,%%s1EFX,%%s1IM9, 1QQD
Ідентифікатори
Символи	HLA-C, D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, major histocompatibility complex, class I, C, MHC
Зовнішні ІД	OMIM: 142840 HomoloGene: 133080 GeneCards: HLA-C
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічне обструктивне захворювання легень, psoriatic arthritis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • phagocytic vesicle membrane; • комплекс Ґольджі; • early endosome membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • cell surface; • ендоплазматичний ретикулум; • MHC class I protein complex; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • Екзосома; • secretory granule membrane; • recycling endosome membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • immune system process; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent; • type I interferon signaling pathway; • Імунна відповідь; • regulation of immune response; • GO:0022415 viral process; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3107
	н/д
ENSG00000204525; ENSG00000233841; ENSG00000228299; ENSG00000225691; ENSG00000206435;
	ENSG00000237022; ENSG00000206452
	н/д
	P10321
	н/д
	NM_002117; NM_001243042
	н/д
	NP_001229971; NP_002108
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

HLA-C (англ. Major histocompatibility complex, class I, C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 40 649[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVMAPRALL	LLLSGGLALT	ETWACSHSMR	YFDTAVSRPG	RGEPRFISVG
YVDDTQFVRF	DSDAASPRGE	PRAPWVEQEG	PEYWDRETQK	YKRQAQADRV
SLRNLRGYYN	QSEDGSHTLQ	RMSGCDLGPD	GRLLRGYDQS	AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA	DTAAQITQRK	LEAARAAEQL	RAYLEGTCVE	WLRRYLENGK
ETLQRAEPPK	THVTHHPLSD	HEATLRCWAL	GFYPAEITLT	WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA	GDGTFQKWAA	VVVPSGQEQR	YTCHMQHEGL	QEPLTLSWEP
SSQPTIPIMG	IVAGLAVLVV	LAVLGAVVTA	MMCRRKSSGG	KGGSCSQAAC
SNSAQGSDES	LITCKA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

Vilches C., Bunce M., de Pablo R., Herrero M.J., Kreisler M. (1995). Anchored PCR cloning of the novel HLA-Cw*0704 allele detected by PCR-SSP.. Tissue Antigens 46: 19 — 23. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02471.x
Cooper S.L., Adams E.J., Wells R.S., Walker C.M., Parham P. (1998). A major histocompatibility complex class I allele shared by two species of chimpanzee.. Immunogenetics 47: 212 — 217. PubMed DOI:10.1007/s002510050350
Baurain J.-F., Coulie P.G. (1999). Correction of HLA-Cw*0501 and identification of HLA-Cw*0711.. Tissue Antigens 53: 510 — 512. PubMed DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.530508.x
Steinle A., Schendel D.J. (1994). HLA class I alleles of LCL 721 and 174 x CEM.T2 (T2).. Tissue Antigens 44: 268 — 270. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1994.tb02394.x
van der Vlies S.A., Voorter C.E., van den Berg-Loonen E.M. (1999). There is more to HLA -C than exons 2 and 3: sequencing exons 1, 4 and 5.. Tissue Antigens 54: 169 — 177. PubMed DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.540208.x
Pohla H., Kuon W., Tabaczewski P., Doerner C., Weiss E.H. (1989). Allelic variation in HLA-B and HLA-C sequences and the evolution of the HLA-B alleles.. Immunogenetics 29: 297 — 307. PubMed DOI:10.1007/BF00352839

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HLA-C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4933 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P10321 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HLA-C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4933 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P10321 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.