HTRA1

HTRA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JOA, 2YTW, 3NUM, 3NWU, 3NZI, 3TJN, 3TJO, 3TJQ
Ідентифікатори
Символи	HTRA1, ARMD7, CARASIL, HtrA, L56, ORF480, PRSS11, CADASIL2, HtrA serine peptidase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602194 MGI: 1929076 HomoloGene: 31114 GeneCards: HTRA1
Пов'язані генетичні захворювання
	макулодистрофія, age related macular degeneration 7, cerebral arteriopathy, autosomal dominant, with subcortical infarcts and leukoencephalopathy, type 2[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• insulin-like growth factor binding; • growth factor binding; • peptidase activity; • serine-type peptidase activity; • hydrolase activity; • serine-type endopeptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • клітинна мембрана; • Екзосома; • extracellular region; • extracellular space; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• negative regulation of defense response to virus; • chorionic trophoblast cell differentiation; • positive regulation of epithelial cell proliferation; • placenta development; • dentinogenesis; • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • Протеоліз; • negative regulation of BMP signaling pathway; • regulation of cell growth; • extracellular matrix disassembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5654
	56213
	ENSG00000166033
	ENSMUSG00000006205
	Q92743
	Q9R118
	NM_002775
	NM_019564
	NP_002766
	NP_062510
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HTRA1 (англ. HtrA serine peptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 51 287[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQIPRAALLP	LLLLLLAAPA	SAQLSRAGRS	APLAAGCPDR	CEPARCPPQP
EHCEGGRARD	ACGCCEVCGA	PEGAACGLQE	GPCGEGLQCV	VPFGVPASAT
VRRRAQAGLC	VCASSEPVCG	SDANTYANLC	QLRAASRRSE	RLHRPPVIVL
QRGACGQGQE	DPNSLRHKYN	FIADVVEKIA	PAVVHIELFR	KLPFSKREVP
VASGSGFIVS	EDGLIVTNAH	VVTNKHRVKV	ELKNGATYEA	KIKDVDEKAD
IALIKIDHQG	KLPVLLLGRS	SELRPGEFVV	AIGSPFSLQN	TVTTGIVSTT
QRGGKELGLR	NSDMDYIQTD	AIINYGNSGG	PLVNLDGEVI	GINTLKVTAG
ISFAIPSDKI	KKFLTESHDR	QAKGKAITKK	KYIGIRMMSL	TSSKAKELKD
RHRDFPDVIS	GAYIIEVIPD	TPAEAGGLKE	NDVIISINGQ	SVVSANDVSD
VIKRESTLNM	VVRRGNEDIM	ITVIPEEIDP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Zumbrunn J., Trueb B. (1996). Primary structure of a putative serine protease specific for IGF-binding proteins.. FEBS Lett. 398: 187 — 192. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(96)01229-X

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HTRA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9476 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q92743 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HTRA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9476 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q92743 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.