LFNG

LFNG
Ідентифікатори
Символи	LFNG, SCDO3, LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase
Зовнішні ІД	OMIM: 602576 MGI: 1095413 HomoloGene: 22475 GeneCards: LFNG
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • glycosyltransferase activity; • зв'язування з іоном металу; • O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase activity; • молекулярна функція; • acetylglucosaminyltransferase activity;
Клітинна компонента	• extracellular vesicle; • integral component of membrane; • integral component of Golgi membrane; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • Golgi membrane; • extracellular region;
Біологічний процес	• somitogenesis; • pattern specification process; • regulation of somitogenesis; • marginal zone B cell differentiation; • negative regulation of Notch signaling pathway involved in somitogenesis; • multicellular organism development; • T cell differentiation; • compartment pattern specification; • animal organ morphogenesis; • ovarian follicle development; • positive regulation of protein binding; • regulation of Notch signaling pathway; • positive regulation of Notch signaling pathway; • positive regulation of meiotic cell cycle; • protein O-linked fucosylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3955
	16848
	ENSG00000106003
	ENSMUSG00000029570
	Q8NES3
	O09010
	NM_002304; NM_001040167; NM_001040168; NM_001166355
	NM_008494
	NP_001035257; NP_001035258; NP_001159827; NP_002295
	NP_032520
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LFNG (англ. LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 41 773[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLKRCGRRLL	LALAGALLAC	LLVLTADPPP	PPLPAERGRR	ALRSLAGPAG
AAPAPGLGAA	AAAPGALVRD	VHSLSEYFSL	LTRARRDAGP	PPGAAPRPAD
GHPRPLAEPL	APRDVFIAVK	TTKKFHRARL	DLLLETWISR	HKEMTFIFTD
GEDEALARHT	GNVVITNCSA	AHSRQALSCK	MAVEYDRFIE	SGRKWFCHVD
DDNYVNLRAL	LRLLASYPHT	RDVYVGKPSL	DRPIQAMERV	SENKVRPVHF
WFATGGAGFC	ISRGLALKMS	PWASGGHFMN	TAERIRLPDD	CTIGYIVEAL
LGVPLIRSGL	FHSHLENLQQ	VPTSELHEQV	TLSYGMFENK	RNAVHVKGPF
SVEADPSRFR	SIHCHLYPDT	PWCPRTAIF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

Cole S.E., Levorse J.M., Tilghman S.M., Vogt T.F. (2002). Clock regulatory elements control cyclic expression of Lunatic fringe during somitogenesis.. Dev. Cell 3: 75 — 84. PubMed DOI:10.1016/S1534-5807(02)00212-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6560 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, Q8NES3 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6560 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8NES3 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.