NCF1

NCF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GD5, 1K4U, 1KQ6, 1NG2, 1O7K, 1OV3, 1UEC, 1W70, 1WLP
Ідентифікатори
Символи	NCF1, NCF1A, NOXO2, SH3PXD1A, p47phox, Neutrophil cytosolic factor 1, CGD1
Зовнішні ІД	OMIM: 608512 MGI: 97283 HomoloGene: 30964 GeneCards: NCF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• superoxide-generating NAD(P)H oxidase activity; • SH3 domain binding; • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding; • GO:0001948 protein binding; • phosphatidylinositol binding; • electron transfer activity; • lipid binding; • superoxide-generating NADPH oxidase activator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • Фаголізосома; • extrinsic component of membrane; • Дендрит (нейробіологія); • НАДФН-оксидаза; • комплекс Ґольджі; • rough endoplasmic reticulum; • neuronal cell body; • podosome; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• protein targeting to membrane; • superoxide anion generation; • cellular defense response; • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • Вроджений імунітет; • superoxide metabolic process; • Апоптоз; • respiratory burst; • podosome assembly; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • cellular response to reactive oxygen species; • positive regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of JNK cascade; • cellular response to cadmium ion; • positive regulation of p38MAPK cascade; • Електронтранспортний ланцюг; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • cellular response to oxidative stress; • cell redox homeostasis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	653361
	17969
	ENSG00000158517
	ENSMUSG00000015950
	P14598
	Q09014
	NM_000265
	NM_001286037; NM_010876
	NP_000256
	NP_001272966; NP_035006
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCF1 (англ. Neutrophil cytosolic factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 44 652[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDTFIRHIA	LLGFEKRFVP	SQHYVYMFLV	KWQDLSEKVV	YRRFTEIYEF
HKTLKEMFPI	EAGAINPENR	IIPHLPAPKW	FDGQRAAENR	QGTLTEYCGT
LMSLPTKISR	CPHLLDFFKV	RPDDLKLPTD	NQTKKPETYL	MPKDGKSTAT
DITGPIILQT	YRAIANYEKT	SGSEMALSTG	DVVEVVEKSE	SGWWFCQMKA
KRGWIPASFL	EPLDSPDETE	DPEPNYAGEP	YVAIKAYTAV	EGDEVSLLEG
EAVEVIHKLL	DGWWVIRKDD	VTGYFPSMYL	QKSGQDVSQA	QRQIKRGAPP
RRSSIRNAHS	IHQRSRKRLS	QDAYRRNSVR	FLQQRRRQAR	PGPQSPGSPL
EEERQTQRSK	PQPAVPPRPS	ADLILNRCSE	STKRKLASAV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Volpp B.D., Nauseef W.M., Clark R.A. (1989). Cloning of the cDNA and functional expression of the 47-kilodalton cytosolic component of human neutrophil respiratory burst oxidase.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 7195 — 7199. PubMed DOI:10.1073/pnas.86.18.7195
Lomax K.J., Leto T.L., Nunoi H., Gallin J.I., Malech H.L. (1989). Recombinant 47-kilodalton cytosol factor restores NADPH oxidase in chronic granulomatous disease.. Science 245: 409 — 412. PubMed DOI:10.1126/science.2547247
Rodaway A.R.F., Teahan C.G., Casimir C.M., Segal A.W., Bentley D.L. (1990). Characterization of the 47-kilodalton autosomal chronic granulomatous disease protein: tissue-specific expression and transcriptional control by retinoic acid.. Mol. Cell. Biol. 10: 5388 — 5396. PubMed DOI:10.1128/MCB.10.10.5388
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening.. BMC Immunol. 10: 53 — 53. PubMed DOI:10.1186/1471-2172-10-53
Kleino I., Ortiz R.M., Yritys M., Huovila A.P., Saksela K. (2009). Alternative splicing of ADAM15 regulates its interactions with cellular SH3 proteins.. J. Cell. Biochem. 108: 877 — 885. PubMed DOI:10.1002/jcb.22317

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7660 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P14598 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7660 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P14598 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.