NKD1

NKD1
Ідентифікатори
Символи	NKD1, Naked1, Naked cuticle 1, naked cuticle homolog 1, WNT signaling pathway inhibitor, NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607851 MGI: 2135954 HomoloGene: 12343 GeneCards: NKD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • PDZ domain binding; • GO:0001948 protein binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинна мембрана; • protein phosphatase type 2A complex; • мембрана;
Біологічний процес	• negative regulation of Wnt signaling pathway; • positive regulation of Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • positive regulation of non-canonical Wnt signaling pathway via JNK cascade; • somatic muscle development; • eye photoreceptor cell differentiation; • Wnt signaling pathway; • positive regulation of protein catabolic process; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • regulation of cell migration involved in somitogenic axis elongation; • negative regulation of convergent extension involved in axis elongation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	85407
	93960
	ENSG00000140807
	ENSMUSG00000031661
	Q969G9
	Q99MH6
	NM_033119
	NM_001163660; NM_027280
	NP_149110
	NP_001157132; NP_081556
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NKD1 (англ. Naked cuticle homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 52 285[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKLHSKPAA	VCKRRESPEG	DSFAVSAAWA	RKGIEEWIGR	QRCPGGVSGP
RQLRLAGTIG	RSTRELVGDV	LRDTLSEEEE	DDFRLEVALP	PEKTDGLGSG
DEKKMERVSE	PCPGSKKQLK	FEELQCDVSM	EEDSRQEWTF	TLYDFDNNGK
VTREDITSLL	HTIYEVVDSS	VNHSPTSSKM	LRVKLTVAPD	GSQSKRSVLV
NQADLQSARP	RAETKPTEDL	RSWEKKQRAP	LRFQGDSRLE	QSGCYHHCVD
ENIERRNHYL	DLAGIENYTS	QFGPGSPSVA	QKSELPPRTS	NPTRSRSHEP
EAIHIPHRKP	QGVDPASFHF	LDTPIAKVSE	LQQRLRGTQD	GSKHFVRSPK
AQGKSVGVGH	VARGARNKPP	LGPAIPAVSP	SAHLAASPAL	LPSLAPLGHK
KHKHRAKESQ	QGCRGLQAPL	ASGGPVLGRE	HLRELPALVV	YESQAGQPVQ
RHEHHHHHEH	HHHYHHFYQT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Wharton K.A. Jr., Zimmermann G., Rousset R., Scott M.P. (2001). Vertebrate proteins related to Drosophila Naked Cuticle bind Dishevelled and antagonize Wnt signaling.. Dev. Biol. 234: 93 — 106. PubMed DOI:10.1006/dbio.2001.0238
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Katoh M. (2001). Molecular cloning, gene structure, and expression analyses of NKD1 and NKD2.. Int. J. Oncol. 19: 963 — 969. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17045 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q969G9 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17045 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q969G9 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.