NOD2

NOD2
Ідентифікатори
Символи	NOD2, ACUG, BLAU, CARD15, CD, CLR16.3, IBD1, NLRC2, NOD2B, PSORAS1, nucleotide binding oligomerization domain containing 2, BLAUS, YAOS
Зовнішні ІД	OMIM: 605956 MGI: 2429397 HomoloGene: 11156 GeneCards: NOD2
Пов'язані генетичні захворювання
	Хвороба Крона, inflammatory bowel diseases, Blau syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• Hsp90 protein binding; • nucleotide binding; • Hsp70 protein binding; • GO:0001948 protein binding; • peptidoglycan binding; • enzyme binding; • actin binding; • CARD domain binding; • ATP binding; • protein kinase binding; • muramyl dipeptide binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • везикула; • мембрана; • клітинна мембрана; • cell surface; • basolateral plasma membrane; • COP9 signalosome; • Цитоскелет; • комплекс Ґольджі; • мітохондрія; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• positive regulation of prostaglandin-endoperoxide synthase activity; • regulation of apoptotic process; • defense response; • detection of biotic stimulus; • cytokine production involved in immune response; • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • detection of muramyl dipeptide; • positive regulation of interleukin-10 production; • positive regulation of epithelial cell proliferation; • immune system process; • positive regulation of oxidoreductase activity; • response to muramyl dipeptide; • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity; • positive regulation of JNK cascade; • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity; • positive regulation of gamma-delta T cell activation; • cellular response to muramyl dipeptide; • JNK cascade; • negative regulation of macrophage apoptotic process; • positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation; • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway; • maintenance of gastrointestinal epithelium; • defense response to bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of interleukin-8 production; • detection of bacterium; • positive regulation of interleukin-1 beta production; • regulation of inflammatory response; • positive regulation of interleukin-6 production; • protein complex oligomerization; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of B cell activation; • positive regulation of interleukin-17 production; • positive regulation of type 2 immune response; • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; • positive regulation of stress-activated MAPK cascade; • positive regulation of Notch signaling pathway; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of cell population proliferation; • Вроджений імунітет; • response to nutrient; • positive regulation of dendritic cell cytokine production; • positive regulation of protein K63-linked ubiquitination; • cellular response to peptidoglycan; • positive regulation of MAP kinase activity; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • cellular response to lipopolysaccharide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	64127
	257632
	ENSG00000167207
	ENSMUSG00000055994
	Q9HC29
	Q8K3Z0
	NM_001293557; NM_022162; NM_001370466
	NM_145857
	NP_001280486; NP_071445; NP_001357395
	NP_665856
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NOD2 (англ. Nucleotide binding oligomerization domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 115 283[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEEGGSASH	DEEERASVLL	GHSPGCEMCS	QEAFQAQRSQ	LVELLVSGSL
EGFESVLDWL	LSWEVLSWED	YEGFHLLGQP	LSHLARRLLD	TVWNKGTWAC
QKLIAAAQEA	QADSQSPKLH	GCWDPHSLHP	ARDLQSHRPA	IVRRLHSHVE
NMLDLAWERG	FVSQYECDEI	RLPIFTPSQR	ARRLLDLATV	KANGLAAFLL
QHVQELPVPL	ALPLEAATCK	KYMAKLRTTV	SAQSRFLSTY	DGAETLCLED
IYTENVLEVW	ADVGMAGPPQ	KSPATLGLEE	LFSTPGHLND	DADTVLVVGE
AGSGKSTLLQ	RLHLLWAAGQ	DFQEFLFVFP	FSCRQLQCMA	KPLSVRTLLF
EHCCWPDVGQ	EDIFQLLLDH	PDRVLLTFDG	FDEFKFRFTD	RERHCSPTDP
TSVQTLLFNL	LQGNLLKNAR	KVVTSRPAAV	SAFLRKYIRT	EFNLKGFSEQ
GIELYLRKRH	HEPGVADRLI	RLLQETSALH	GLCHLPVFSW	MVSKCHQELL
LQEGGSPKTT	TDMYLLILQH	FLLHATPPDS	ASQGLGPSLL	RGRLPTLLHL
GRLALWGLGM	CCYVFSAQQL	QAAQVSPDDI	SLGFLVRAKG	VVPGSTAPLE
FLHITFQCFF	AAFYLALSAD	VPPALLRHLF	NCGRPGNSPM	ARLLPTMCIQ
ASEGKDSSVA	ALLQKAEPHN	LQITAAFLAG	LLSREHWGLL	AECQTSEKAL
LRRQACARWC	LARSLRKHFH	SIPPAAPGEA	KSVHAMPGFI	WLIRSLYEMQ
EERLARKAAR	GLNVGHLKLT	FCSVGPTECA	ALAFVLQHLR	RPVALQLDYN
SVGDIGVEQL	LPCLGVCKAL	YLRDNNISDR	GICKLIECAL	HCEQLQKLAL
FNNKLTDGCA	HSMAKLLACR	QNFLALRLGN	NYITAAGAQV	LAEGLRGNTS
LQFLGFWGNR	VGDEGAQALA	EALGDHQSLR	WLSLVGNNIG	SVGAQALALM
LAKNVMLEEL	CLEENHLQDE	GVCSLAEGLK	KNSSLKILKL	SNNCITYLGA
EALLQALERN	DTILEVWLRG	NTFSLEEVDK	LGCRDTRLLL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Lee K.H., Biswas A., Liu Y.J., Kobayashi K.S. (2012). Proteasomal degradation of Nod2 protein mediates tolerance to bacterial cell wall components.. J. Biol. Chem. 287: 39800 — 39811. PubMed DOI:10.1074/jbc.M112.410027
Menning M., Kufer T.A. (2013). A role for the Ankyrin repeat containing protein Ankrd17 in Nod1- and Nod2-mediated inflammatory responses.. FEBS Lett. 587: 2137 — 2142. PubMed DOI:10.1016/j.febslet.2013.05.037
Parkhouse R., Boyle J.P., Monie T.P. (2014). Blau syndrome polymorphisms in NOD2 identify nucleotide hydrolysis and helical domain 1 as signalling regulators.. FEBS Lett. 588: 3382 — 3389. PubMed DOI:10.1016/j.febslet.2014.07.029
Mohanan V., Grimes C.L. (2014). The molecular chaperone HSP70 binds to and stabilizes NOD2, an important protein involved in Crohn disease.. J. Biol. Chem. 289: 18987 — 18998. PubMed DOI:10.1074/jbc.M114.557686
Milman N., Ursin K., Rodevand E., Nielsen F.C., Hansen T.V. (2009). A novel mutation in the NOD2 gene associated with Blau syndrome: a Norwegian family with four affected members.. Scand. J. Rheumatol. 38: 190 — 197. PubMed DOI:10.1080/03009740802464194
Zeybek C., Basbozkurt G., Gul D., Demirkaya E., Gok F. (2015). A new mutation in blau syndrome.. Case Rep. Rheumatol. 2015: 463959 — 463959. PubMed DOI:10.1155/2015/463959

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з NOD2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5331 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q9HC29 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NOD2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5331 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9HC29 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.