PDPN

PDPN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3WSR, 4YO0
Ідентифікатори
Символи	PDPN, AGGRUS, GP36, GP40, Gp38, HT1A-1, OTS8, PA2.26, T1A, T1A-2, T1A2, TI1A, podoplanin, D2-40
Зовнішні ІД	OMIM: 608863 MGI: 103098 HomoloGene: 4729 GeneCards: PDPN
Онтологія гена
Молекулярна функція	• folic acid transmembrane transporter activity; • water channel activity; • amino acid transmembrane transporter activity; • water transmembrane transporter activity; • signaling receptor binding; • GO:0001948 protein binding; • chaperone binding; • chemokine binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • клітинна мембрана; • мембрана; • tetraspanin-enriched microdomain; • lamellipodium membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • filopodium membrane; • microvillus membrane; • ruffle membrane; • cell projection; • leading edge of lamellipodium; • цитоплазма; • гіалоплазма; • basolateral plasma membrane; • apical plasma membrane; • Міжклітинні контакти; • membrane raft; • ruffle; • lamellipodium; • filopodium;
Біологічний процес	• folic acid transport; • water transport; • platelet activation; • multicellular organism development; • regulation of cell shape; • amino acid transport; • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; • positive regulation of cell migration; • Rho protein signal transduction; • wound healing, spreading of cells; • positive regulation of extracellular matrix disassembly; • regulation of lamellipodium morphogenesis; • cell morphogenesis; • lymphangiogenesis; • negative regulation of cell population proliferation; • lung development; • negative regulation of apoptotic process; • lymph node development; • positive regulation of cellular component movement; • lymphatic endothelial cell fate commitment; • actin-mediated cell contraction; • regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; • positive regulation of platelet aggregation; • regulation of myofibroblast contraction; • amino acid transmembrane transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10630
	14726
	ENSG00000162493
	ENSMUSG00000028583
	Q86YL7
	Q62011
NM_001006624; NM_001006625; NM_006474; NM_198389; NM_001385053;
	NM_013317
	NM_001290822; NM_010329
	NP_001006625; NP_001006626; NP_006465; NP_938203
	NP_001277751; NP_034459
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDPN (англ. Podoplanin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 162 амінокислот, а молекулярна маса — 16 698[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWKVSALLFV	LGSASLWVLA	EGASTGQPED	DTETTGLEGG	VAMPGAEDDV
VTPGTSEDRY	KSGLTTLVAT	SVNSVTGIRI	EDLPTSESTV	HAQEQSPSAT
ASNVATSHST	EKVDGDTQTT	VEKDGLSTVT	LVGIIVGVLL	AIGFIGAIIV
VVMRKMSGRY	SP

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

Ma T., Yang B., Matthay M.A., Verkman A.S. (1998). Evidence against a role of mouse, rat, and two cloned human T1alpha isoforms as a water channel or a regulator of aquaporin-type water channels.. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 19: 143 — 149. PubMed DOI:10.1165/ajrcmb.19.1.2953
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29602 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q86YL7 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29602 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q86YL7 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.