PRIM2

PRIM2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3L9Q, 3Q36, 4BPU, 4BPW, 4BPX, 4RR2, 5F0Q, 5EXR, 5F0S
Ідентифікатори
Символи	PRIM2, PRIM2A, p58, primase (DNA) subunit 2, DNA primase subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 176636 MGI: 97758 HomoloGene: 731 GeneCards: PRIM2
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a [SARS-CoV-2][1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • transferase activity; • DNA binding; • 4 iron, 4 sulfur cluster binding; • iron-sulfur cluster binding; • nucleotidyltransferase activity; • зв'язування з іоном металу; • single-stranded DNA binding; • DNA-directed DNA polymerase activity; • DNA primase activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • alpha DNA polymerase:primase complex;
Біологічний процес	• Реплікація ДНК; • DNA replication, synthesis of RNA primer; • DNA biosynthetic process; • telomere maintenance via semi-conservative replication; • G1/S transition of mitotic cell cycle; • DNA replication initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5558
	19076
	ENSG00000146143
	ENSMUSG00000026134
	P49643
	P33610
	NM_000947; NM_001282487; NM_001282488
	NM_008922
	NP_000938; NP_001269416; NP_001269417
	NP_032948
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRIM2 (англ. Primase (DNA) subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 806[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEFSGRKWRK	LRLAGDQRNA	SYPHCLQFYL	QPPSENISLI	EFENLAIDRV
KLLKSVENLG	VSYVKGTEQY	QSKLESELRK	LKFSYRENLE	DEYEPRRRDH
ISHFILRLAY	CQSEELRRWF	IQQEMDLLRF	RFSILPKDKI	QDFLKDSQLQ
FEAISDEEKT	LREQEIVASS	PSLSGLKLGF	ESIYKIPFAD	ALDLFRGRKV
YLEDGFAYVP	LKDIVAIILN	EFRAKLSKAL	ALTARSLPAV	QSDERLQPLL
NHLSHSYTGQ	DYSTQGNVGK	ISLDQIDLLS	TKSFPPCMRQ	LHKALRENHH
LRHGGRMQYG	LFLKGIGLTL	EQALQFWKQE	FIKGKMDPDK	FDKGYSYNIR
HSFGKEGKRT	DYTPFSCLKI	ILSNPPSQGD	YHGCPFRHSD	PELLKQKLQS
YKISPGGISQ	ILDLVKGTHY	QVACQKYFEM	IHNVDDCGFS	LNHPNQFFCE
SQRILNGGKD	IKKEPIQPET	PQPKPSVQKT	KDASSALASL	NSSLEMDMEG
LEDYFSEDS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA primase subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9370 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P49643 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA primase subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9370 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P49643 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.