PTPRC

PTPRC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YGU, 1YGR, 5FMV, 5FN6, 5FN7
Ідентифікатори
Символи	PTPRC, B220, CD45, CD45R, GP180, L-CA, LCA, LY5, T200, protein tyrosine phosphatase, receptor type C, protein tyrosine phosphatase receptor type C
Зовнішні ІД	OMIM: 151460 MGI: 97810 HomoloGene: 2126 GeneCards: PTPRC
Пов'язані генетичні захворювання
	неспецифічний виразковий коліт[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity; • phosphatase activity; • GO:0001948 protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • protein kinase binding; • hydrolase activity; • protein tyrosine phosphatase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • membrane raft; • Екзосома; • external side of plasma membrane; • secretory granule membrane;
Біологічний процес	• B cell receptor signaling pathway; • cell cycle phase transition; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of protein kinase activity; • bone marrow development; • stem cell development; • protein dephosphorylation; • negative regulation of cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of hematopoietic stem cell migration; • regulation of cell cycle; • negative regulation of cell adhesion involved in substrate-bound cell migration; • negative regulation of T cell mediated cytotoxicity; • cell surface receptor signaling pathway; • B cell proliferation; • T cell differentiation; • positive regulation of B cell proliferation; • defense response to virus; • positive regulation of T cell proliferation; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • positive regulation of antigen receptor-mediated signaling pathway; • T cell receptor signaling pathway; • positive regulation of stem cell proliferation; • дефосфорилювання; • positive regulation of protein kinase activity; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5788
	19264
	ENSG00000081237; ENSG00000262418
	ENSMUSG00000026395
	P08575
	P06800
	NM_001267798; NM_002838; NM_080921; NM_080922
	NM_001111316; NM_001268286; NM_011210
	NP_001254727; NP_002829; NP_563578; NP_563578.2; NP_002829.3
	NP_001104786; NP_001255215; NP_035340
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRC (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 304 амінокислот, а молекулярна маса — 147 254[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYLWLKLLAF	GFAFLDTEVF	VTGQSPTPSP	TGLTTAKMPS	VPLSSDPLPT
HTTAFSPAST	FERENDFSET	TTSLSPDNTS	TQVSPDSLDN	ASAFNTTGVS
SVQTPHLPTH	ADSQTPSAGT	DTQTFSGSAA	NAKLNPTPGS	NAISDVPGER
STASTFPTDP	VSPLTTTLSL	AHHSSAALPA	RTSNTTITAN	TSDAYLNASE
TTTLSPSGSA	VISTTTIATT	PSKPTCDEKY	ANITVDYLYN	KETKLFTAKL
NVNENVECGN	NTCTNNEVHN	LTECKNASVS	ISHNSCTAPD	KTLILDVPPG
VEKFQLHDCT	QVEKADTTIC	LKWKNIETFT	CDTQNITYRF	QCGNMIFDNK
EIKLENLEPE	HEYKCDSEIL	YNNHKFTNAS	KIIKTDFGSP	GEPQIIFCRS
EAAHQGVITW	NPPQRSFHNF	TLCYIKETEK	DCLNLDKNLI	KYDLQNLKPY
TKYVLSLHAY	IIAKVQRNGS	AAMCHFTTKS	APPSQVWNMT	VSMTSDNSMH
VKCRPPRDRN	GPHERYHLEV	EAGNTLVRNE	SHKNCDFRVK	DLQYSTDYTF
KAYFHNGDYP	GEPFILHHST	SYNSKALIAF	LAFLIIVTSI	ALLVVLYKIY
DLHKKRSCNL	DEQQELVERD	DEKQLMNVEP	IHADILLETY	KRKIADEGRL
FLAEFQSIPR	VFSKFPIKEA	RKPFNQNKNR	YVDILPYDYN	RVELSEINGD
AGSNYINASY	IDGFKEPRKY	IAAQGPRDET	VDDFWRMIWE	QKATVIVMVT
RCEEGNRNKC	AEYWPSMEEG	TRAFGDVVVK	INQHKRCPDY	IIQKLNIVNK
KEKATGREVT	HIQFTSWPDH	GVPEDPHLLL	KLRRRVNAFS	NFFSGPIVVH
CSAGVGRTGT	YIGIDAMLEG	LEAENKVDVY	GYVVKLRRQR	CLMVQVEAQY
ILIHQALVEY	NQFGETEVNL	SELHPYLHNM	KKRDPPSEPS	PLEAEFQRLP
SYRSWRTQHI	GNQEENKSKN	RNSNVIPYDY	NRVPLKHELE	MSKESEHDSD
ESSDDDSDSE	EPSKYINASF	IMSYWKPEVM	IAAQGPLKET	IGDFWQMIFQ
RKVKVIVMLT	ELKHGDQEIC	AQYWGEGKQT	YGDIEVDLKD	TDKSSTYTLR
VFELRHSKRK	DSRTVYQYQY	TNWSVEQLPA	EPKELISMIQ	VVKQKLPQKN
SSEGNKHHKS	TPLLIHCRDG	SQQTGIFCAL	LNLLESAETE	EVVDIFQVVK
ALRKARPGMV	STFEQYQFLY	DVIASTYPAQ	NGQVKKNNHQ	EDKIEFDNEV
DKVKQDANCV	NPLGAPEKLP	EAKEQAEGSE	PTSGTEGPEH	SVNGPASPAL
NQGS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Локалізований у мембрані.

Література

Streuli M., Hall L.R., Saga Y., Schlossman S.F., Saito H. (1987). Differential usage of three exons generates at least five different mRNAs encoding human leukocyte common antigens.. J. Exp. Med. 166: 1548 — 1566. PubMed DOI:10.1084/jem.166.5.1548
Tsai A.Y.M., Streuli M., Saito H. (1989). Integrity of the exon 6 sequence is essential for tissue-specific alternative splicing of human leukocyte common antigen pre-mRNA.. Mol. Cell. Biol. 9: 4550 — 4555. PubMed DOI:10.1128/MCB.9.10.4550
Charbonneau H., Tonks N.K., Walsh K.A., Fischer E.H. (1988). The leukocyte common antigen (CD45): a putative receptor-linked protein tyrosine phosphatase.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7182 — 7186. PubMed DOI:10.1073/pnas.85.19.7182
Wu L., Fu J., Shen S.-H. (2002). SKAP55 coupled with CD45 positively regulates T-cell receptor-mediated gene transcription.. Mol. Cell. Biol. 22: 2673 — 2686. PubMed DOI:10.1128/MCB.22.8.2673-2686.2002
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment.. J. Proteome Res. 7: 5167 — 5176. PubMed DOI:10.1021/pr800500r
Nam H.J., Poy F., Saito H., Frederick C.A. (2005). Structural basis for the function and regulation of the receptor protein tyrosine phosphatase CD45.. J. Exp. Med. 201: 441 — 452. PubMed DOI:10.1084/jem.20041890

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з PTPRC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9666 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.
UniProt, P08575 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PTPRC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9666 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P08575 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.